Basic Statistics
Measure | Value |
---|---|
Filename | EGAF00001063130 |
File type | Conventional base calls |
Encoding | Sanger / Illumina 1.9 |
Total Sequences | 21712529 |
Sequences flagged as poor quality | 0 |
Sequence length | 42 |
%GC | 48 |
Per base sequence quality
Per tile sequence quality
Per sequence quality scores
Per base sequence content
Per sequence GC content
Per base N content
Sequence Length Distribution
Sequence Duplication Levels
Overrepresented sequences
Sequence | Count | Percentage | Possible Source |
---|---|---|---|
AATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAA | 171774 | 0.7911284770189599 | No Hit |
TAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTA | 89870 | 0.41390848574111283 | No Hit |
GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACGGCTACATC | 83381 | 0.3840225152952012 | TruSeq Adapter, Index 11 (100% over 42bp) |
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT | 65846 | 0.30326269224556934 | No Hit |
ATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAAT | 60170 | 0.27712110367244647 | No Hit |
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA | 49859 | 0.22963239335224375 | No Hit |