FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00001132375

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001132375
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length208
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGCCGTATAATAACCAGTC26.666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGTACGATACCCCTTTTTCGTA13.3333333333333335No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGGGGGGTAA13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGCGAGAATAACCACTCCAAAAATCGTAATCGTG13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAGGGAGTCTAGCAGTCACCACGTGGG13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGTCATAGTCACCGCAGTCACC13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGTTGTAGTCACCGTAGTCTAC13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGTTGCCGGAGTAATAACCACT13.3333333333333335No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGGGGGGTCG13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGCACCAGCTCACTCCAGCTCTCCCCAC13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTGATGTACCAGCCACTGCTCCCC13.3333333333333335No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGGATGTGGTATA13.3333333333333335No Hit
CTCGTTGCCGAACGTGACGTTGTTCATCGTCCCGGATCCCTCGGCCTGCA13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAATAGTCAAGGTCATAACGTGTACCAGGTGGCCT13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGTACTGGAAGCTCCGGCTTGC13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAGGGGGGCAGGTCGAAGATCTTAGTA13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGGTTGTAGAACATAGCCCCCC13.3333333333333335No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGGCTTCAAGTCG13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGCCTATAGCAGCTGGTACTACTCCTACCGA13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCGGGTTCCCACGTAGCATCTGACACCAC13.3333333333333335No Hit
ACGCGACGCCGTTCAACCAGATATTGAAGCAGAACGCAAAAAGAGAGATG13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGTAGGCCGCTGTTAGTCTCGC13.3333333333333335No Hit
AGGGTGCCACGGCCCCAGAGATCGAAGTACCAGTAGCGACGGTGATAACC13.3333333333333335No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTAGGAGGATTGTTTGAGT13.3333333333333335No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTCTCTCCGGCCTAT13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAATTGGGGTGACCACTATCTCC13.3333333333333335No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGCTTGAGGTCGATGTCGT13.3333333333333335No Hit
AGGATTCCCCGGCCCCAGTCGGATAACTCCCCGAACCAGAGTGGCGTTCC13.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGGAGTAGTAATAACCACTACT13.3333333333333335No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)