FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00001132384

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001132384
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length208
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATGCCGTAGTAGTAGTAGGTCGCCCT23.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGGAGATAGCAGCTGGTACTAC23.3333333333333335No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTACCAGCCACTGCTATACCCGGA11.6666666666666667No Hit
AGGGTGCCCTGGCCCCAGTGCTGGAAGTATTCATTTTTCGGCGGGACCAG11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTTGCCCCAGACGTCCATGTAGTAGTAGTAGTACCCCCCCGG11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCTGTACCAGCTGCCGCAGACCTCCCTCT11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTTGCCCCAGACGTCCATGTAGTAGTAGTATCCATCTCTCGC11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAACTCGAAGAGCTGTCTCCGATGGGATCTTT11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGTAAGGGAT11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAACTCGACGAGCTGCCTCCGAGGGGATCTTT11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGGATGTGTATGGGGCCACTGA11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTTGCCCCAGACGTCCATGTAGTAGTAGTAGGGATAGTGGAG11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGTTGAAGTCTCCGGAGATCTT11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGATGTCCATCCCGTAGAAGTAGTTTTAGGCCAG11.6666666666666667No Hit
GTTTGTAATTTTAGTGAGGTTGAAGTAGGTGGATTATTTGAGGTTAGGAG11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTATCCCAAGTAGTC11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGTTTGGATCGTAGCCCCCCAT11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCGCAATTTGAGAACCAGTCAAAATATCC11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAAACCTGGCCCCG11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGCCCGAGCGGTAGCA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAGCGGCTGCTGCTATACGCCCCCGAGA11.6666666666666667No Hit
AGGGTGCCACGGCCCCAGAGATCGAAGTACCAGTCGAGATACCAGCCACT11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGTGACTTCA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGTCCTTTGTAAATGGAATATA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCTTGTGGTGATTCCTACAGTGGGCCGGC11.6666666666666667No Hit
ATTGTCCCTTGGCCCCAGATATCAAAAGCACCATGAAGCCGATAATAACC11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAACCCAATCGGGCCCAAGTATCATA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAACAGGACTACCACCACGGGCGAAGG11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGTACTGGGGTTTGGGGTATAC11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAACCCCCTGCACCGGGTATGGGCCCATCTCTTGC11.6666666666666667No Hit
GGTTTTTGAGGTAGTTAAGTTTTTTTTTAATAAAGAAAAGTTGGTAGATT11.6666666666666667No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGGTACGGCGGGGGGATTATTTTAGG11.6666666666666667No Hit
TGGGCTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAATAGAATGTTTTACCATAGCTGTA11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTTGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGTAGAGTGA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGGAGCTATCATCTGGCCAGAC11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCCCAACTTAGGGGGGATACGCGA11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGGGGGAATA11.6666666666666667No Hit
CCATCATAGCCCTGCTGACCCTGTGACCTTGTGGCAGCCCCTCTGGCCCC11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAAAGGACCAT11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTCGTAGTCATAATCATAGCA11.6666666666666667No Hit
AGGGATCCCTGGCCCCAGACGCCAGCCACTGCGTCCGTACCGAGGAGATC11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGGGAGAGTACCAGCCACTGCTCCT11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTGCGATAACTCCCCCAAATGTAA11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTCTTCAAAACCACTCCAAGA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTCAAGCTTGCGGGGGTCAAGCATACACCATTAGTACAATAG11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTCTTCGTACCA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCGGGCCCCAGGGGTCGAACCAGTTTGAGGCGGTAGTATCTTG11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAACCCTAGGGGCCAGCCACTGCTAGT11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAACCATCCACCACCTCCGCCTAATCT11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGGTAGTCTCCATAGCTCCCTGAAC11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGCCCTGAGTGTA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTGGTCAAAAGACTCAGTTATATAAAGGCTCTG11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCATAGTACAAATCGTCGCTCGT11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCAGACCGTAGTAGTACCCAATAACTCC11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTTGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGTTGTCCCC11.6666666666666667No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTGGTAACCACTCCAAAA11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCCGGATAACCACTCAGGCTACTCAACTC11.6666666666666667No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGTTTCTACTAATAACCACTAC11.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph