FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00001132385

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001132385
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences175
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length208
%GC38

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGTGAGATGTTTTG4425.142857142857146No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATTGAGGGGTGTAGAGTGGGGTTGGATTA158.571428571428571No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTTGGTGGATTGTGGGTGT137.428571428571429No Hit
TTTTTATTTTTATAAATAGTAAGGATTGTGTTTTTTTGTATGGTGTTTTG84.571428571428571No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATCGACGCGTTGTCGTTTGTATTAAGAG63.428571428571429No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGAGGAGGGTGGTTTGAGTT31.7142857142857144No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTATTTTTTGAATTTTTATTTTGATCGGAAGAGCGG31.7142857142857144No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATTGATGCGTTGTCGTTTGTATTAAGAG21.1428571428571428No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGGTTGATGTGTTGTTGTTTGTATTAAGAG21.1428571428571428No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAATCGTTTCTTTTTCCCCCCTCCTCCG21.1428571428571428No Hit
TTTTTATTTTTATAAATAGTAAGGATTGCGTTTTTTTGTATGGTGTTTTG21.1428571428571428No Hit
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTCGAGTTTGTTCGTAAGGCGAGACGTTTCG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGGTAAAGGTTGTAGTGAGTCGTGGTTGCGT10.5714285714285714No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGATAGCAGCGACCACCACTAC10.5714285714285714No Hit
GGTTTTTGAGATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGTGAGATGTTTTGTG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGTATAGGGAGGTTAAATGAGGGTTATAAAGTT10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATCGATGTGTTGTTGTTTGTATTAAGAG10.5714285714285714No Hit
ACAGGAGACTGTGACAGTGACGGTGACCACAGACAGGCCACCCAGGGCTC10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTCGGGAGGTTGAGGTCGGCGGATCGTGGGTGT10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGTAGATAGGAAAATAGTTATAAAGTAGGAGAAA10.5714285714285714No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGTAAGGAAT10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGATAGACGTTAGGTGGAGAAGGGGTGGTTGAT10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATGTAGATATGGTGTTAGTGATTGAAGG10.5714285714285714No Hit
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGTGCGATGTTTTG10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGCGGGAGGATGGTTTGAAT10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATCGACGCGTTGTCGTTTGTATTAGGAG10.5714285714285714No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTCCGGGTCCTCCATTCATGTACC10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTCGAGGAGGCGGGAGAATTATTTG10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTATTTTTTGAATTTTTATTTAGATCGGAAGAGCGG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGTTTTTTGGTTTAAAGATTATTTTATAGAG10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATTGATGCATTGTCGTTTGTATTAAGAG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGTGGAAATGGGGGTTTGTGGTGGGTGAAAATGG10.5714285714285714No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCAGTTGATTAATAACTCCCCGAA10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTCGGGAGGTTAAGGTAGGTGGATTATTTGAGG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTGGGGAGATTGAGGGGTGTAGAGTGGGGTTGGATTA10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTCGGCGGATCGTGGGTGT10.5714285714285714No Hit
ATGTAGAAAGAGTTTGGGAGATTGAGGGGTGTAGAGTGGGGTTGGATTAG10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTCGAGGCGAGTGGATTATTTGTGG10.5714285714285714No Hit
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGTGGGATGTTTTG10.5714285714285714No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAATCCCCTCCCACTGAATAACCACT10.5714285714285714No Hit
GGTTTTTGAGGAATTATTTATGTGATTTGTGTAAAGAGTTAGTATATGGG10.5714285714285714No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTCAAGTAGTAGGGA10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATCGATGCGTTGTTGTTTGTATTAAGAG10.5714285714285714No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTAGTACCAGCCACTGCCTCCCGC10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTCGCGAGTTTGAGGTAGATGAATTATTTGAAT10.5714285714285714No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGCGAGCCCAAAG10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTTGGGGGATTGTGGGTGT10.5714285714285714No Hit
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGCGAGATGTTTCG10.5714285714285714No Hit
GTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATACCGTAGTAGTAGTAGTAACCCGA10.5714285714285714No Hit
GGTTTTTGAGTAATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGTGAGATGTTTTG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTGTGGGAATAAGATAGTTAAGAGAGAGAAGATAGTTA10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATATTTAGAGATTGGGTTATTTTTAGTG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGGTAGAGGTTGTAATGAGTTAAGATTATAT10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGCGTTTTGAGATGTTTAGATGAAATGTTAG10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTGGGTAGATTACGAGGTT10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGGTTGAGGTTGTAGTGAGGGATTTTTTTTT10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATCGAGGGGTGTAGAGTGGGGTTGGATTA10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGGTAGTGGTTGTATGAGTTGAGATTGTGTT10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGGTAGAGGGTGAAGTGAGTTAAGATTATGT10.5714285714285714No Hit
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GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATCGACGTGTTGTCGTTTGTATTAAGAG10.5714285714285714No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATTGATGCGTTGTTGTTTGTATTAAGAG10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGGGATAAGGTTTGTTTGGTTGTTTTTTGTTTA10.5714285714285714No Hit
GGTTTTTGAGGAATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATCGGAAGAGCGGTTCA10.5714285714285714No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATCGAGGGGCGTAGAGTGGGGTTGGATTA10.5714285714285714No Hit
GTTTGTATTTTGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTTGGTGGATTGTGGGTGTTT10.5714285714285714No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTGTTTTTGATTGGTATTAATATGGTATTTTAGAT10.5714285714285714No Hit
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GGTTTTTGAGAATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGTGAGATGTTTTGT10.5714285714285714No Hit
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GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATTTATGTGTTGTTGTTTGTATTAAGAG10.5714285714285714No Hit
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TTTTTATTTATAAATAGTAAGGATTGTGTTTTTTTGTATGGTGTTTTGTT10.5714285714285714No Hit
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[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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