FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00001132419

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001132419
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[FAIL]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[WARN]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCGTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATAC1414.583333333333334No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACC77.291666666666667No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCGTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATAC55.208333333333334No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGT55.208333333333334No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCATTGTCCCTTGGCCCCAGATATCAAAAG33.125No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACC33.125No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAACC33.125No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCGTGGTCCCTTTGCCCCAGACGTCCATGT22.083333333333333No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGT22.083333333333333No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCGTGGTTCCCTGGCCCCAGACGTCCATAC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGACTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGC11.0416666666666665No Hit
CTCANCTGAGGAGACGGTGACCATTGTCCCTTGGCCCCAGATATCAAAAG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCATTGTTCCCTGGCCCCAGATATCAAAAG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCTCTCAGGCGGGT11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTCAACCATAG11.0416666666666665No Hit
TCCCTGGGGGCTGACGGATCCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC11.0416666666666665Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (100% over 28bp)
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAAC11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCACCCG11.0416666666666665No Hit
CTTCCCTGGGGGCTGACGGATCCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC11.0416666666666665Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (100% over 27bp)
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAAG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGCCAATTT11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAATCC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAATGA11.0416666666666665No Hit
CTTACTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACCA11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGCTCCCTGGCCCCAGTAGCCAATGT11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGCTTTCCCTGGCCCCAGATACGGAAAT11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAATAATCAAAGG11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGAAGACGGTGACCGTGGTCCCTTGGCCCCAGACGTCCATAC11.0416666666666665No Hit
CTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGTA11.0416666666666665No Hit
CTTCCCTGGGGCTGACGGATCCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTC11.0416666666666665Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (100% over 27bp)
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAACT11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGCGTCCATGT11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCATGGTCCCTTGGCCCCAGATGTCAAAAG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGAGCCCGCGAGAGTAGCAGCTACCAC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGAGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGT11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGGGTCGAGCC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGATCCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC11.0416666666666665Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (100% over 28bp)
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCACAGGAGACTGTGACAGTGACGGTGACC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCACGGGAAGAGCCCCGGGAGGAGGACCCG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGAGTCAGGGC11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCGTGGTCCCTTGGCCCCAGACATCCATAC11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCCTGTGGGCTAAGGTCTCCCTTTGGCCAG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGA11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAGGAA11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTCGTCAAACA11.0416666666666665No Hit
CTTCCCTGGGGGCTGACGGATCCAAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACT11.0416666666666665Illumina Multiplexing PCR Primer 2.01 (100% over 26bp)
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAACC11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCTAAGA11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAGGAA11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAAGG11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGCGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCGTAGT11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTCGTTTATTA11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGGAGTCAATGT11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCATTGTCCCCTGGCCCCAGATATCAAAAG11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTGCCCTGGCCCCAGGAGTCACAGG11.0416666666666665No Hit
CACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAACCGTC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCACAGGAGACTGTGACAGTGACGGTTACC11.0416666666666665No Hit
CTTANCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAACTC11.0416666666666665No Hit
CTTACCTGAGGAGACGGTGACCAGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGTCAAATA11.0416666666666665No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)