FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00001132609

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001132609
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length208
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTCGAGTTTGTTCGTAAGGCGAGACGTTTCG14.166666666666666No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATTGAGGGGCGTATAGTGGGGTCGGATTA14.166666666666666No Hit
TTTTTATTTTTATAAATAGTAAGGATTGTGTTTTTTTGTATGGCGTTTTG14.166666666666666No Hit
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTTGAGTTTGTTTGTAAGGTGAGATGTTTTG14.166666666666666No Hit
CTTATTATGTTCATCCCGTCAACATTCAAACGGCCTGTCTCATCATGGAT14.166666666666666No Hit
CGTTGACCCTAATTTTGGTCGTCGGGTACGCAATCGCCGCCAGTTAAATA14.166666666666666No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTCGGCGGATTGTGGGTGT14.166666666666666No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATCGAGGGGCGTAGAGTGGGGTCGGATTA14.166666666666666No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTTGGTGGATTGTGGGTGT14.166666666666666No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATTGAGGGGTGTAGAGTGGGGTCGGATTA14.166666666666666No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGTGAGGTTGAGGTCGGTGGATCGTGGGTGT14.166666666666666No Hit
AGGGTTCCCTGGCCCCAGTAGCCAATAGTACCACTACTATCATAGTACTC14.166666666666666No Hit
GTTAAAATTTTGGGTTAAGGAGATCGACGCGTTGTCGTTTGTATTAAGAG14.166666666666666No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTTGGTAAAGGTTTTAAATCGGGTGCGTGGTA14.166666666666666No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTTGAGGTTGGTGGATTGTGGGCGT14.166666666666666No Hit
AACTGGCCTAACGACGTTTGGTCAGTTCCATCAACATCATAGCCAGATGC14.166666666666666No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGGTGGAGGTTGTAGTGAGTTGTGATTGTAT14.166666666666666No Hit
CGCCATTAATAATGTTTTCCGTAAATTCAGCGCCTTCCATGATGAGACAG14.166666666666666No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATTGGTTGGAGATGGGATTAGTAAGATTT14.166666666666666No Hit
GGTTTTTGAGGAATTGGATTTTGAGTTTGTTCGTAAGGTGAGATGTTTTG14.166666666666666No Hit
GTTTGTAATTTTAGTTTTTTGGGAGGTCGAGGAGAGTGGATTATAAGTTT14.166666666666666No Hit
ATATCACCATTATCGAACTCAACGCCCTGCATACGAAAAGACAGAATCTC14.166666666666666No Hit
ATTGTAGAAAGAGTTTGGGAGATTGAGGGGCGTAGAGTGGGGTCGGATTA14.166666666666666No Hit
ATTGTAGAGAGAGTTTGGGAGATTGAGGGGTGTAGAGTGGGGTTGGATTA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)