FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00001323209

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001323209
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATGAAATTTGTTGAAACCTTAAAAGGGGAAACTTAGACACCCCCCCTCAA16.666666666666667No Hit
ACTATACTCAATTGATCCAATAACTTGACCAACGGAACAAGTTACCCTAG16.666666666666667No Hit
ATACGAAGCATTAGGCGAGCGTGCACATTTGTGTTTTTCCGCCACGGATT16.666666666666667No Hit
ATCCTAACTACTACCGCATTCCTACTACTCAACTTAAACTCCAGCACCAC16.666666666666667No Hit
CTATAGCGGTTTTCGTTATCAGACAATCGATGTCAAAAAAATGCCACTCG16.666666666666667No Hit
CGATGTAAAAGTTCACCTTCCAGAGAATGCACGCGCGTTCCGTTGCCGGT16.666666666666667No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTT16.666666666666667No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACATGGGGGGAATTCGTGGAGAAAGAAATGGCTC16.666666666666667No Hit
CCCTCCAGCTCTGAATGATTCTGACAGGGATTCTTAGGCAAATCTCTCAC16.666666666666667No Hit
CAGCACTTCGAGGCAATCCGTGGCGGAAAAACACAAATGTGCACGCTCGC16.666666666666667No Hit
GCTGTACACCGTAGTGGGTTAGTGGCGCTGGGCATTGCGACAGCGTTGAT16.666666666666667No Hit
ACCAAAGGCCGTGCAATCGCGCAACGATAAACCTAAATGTTGGGTCAGCA16.666666666666667No Hit
ATCAGCAATGGGATACCCGAGCCAGCATGCATATCTTCAATGACGACGGT16.666666666666667No Hit
CTTAAGGAGATGGTAATCTTAGCAGGGAAATCAGAGGATGTCCAAAGCAT16.666666666666667No Hit
CATATCTTCAATGACGACGGTTGGTTTACCGGGAAAGAGATCCCTGCGTT16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)