FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00001323210

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001323210
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC50

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCGTAGGACTTTAATCGTTGAACAAACGAACCTTTAATAGCGGCTGCACC16.666666666666667No Hit
GCATTAGGCGAGCGTGCACATTTGTGTTTTTCCGCCACGGATTGCCTCGA16.666666666666667No Hit
CACCAATAAAGTGCCATCCATATCAAATGTTGCCAGACGAGCCATTTCTT16.666666666666667No Hit
TATTAACTCCCTGACTTGTACCTCAATGCTTTGGACATCCTCTGATTTCC16.666666666666667No Hit
GTATAGCTGGATCTGCAAGCGTGTAAGATCGTCGTGATCGCCACAGAAGC16.666666666666667No Hit
CGGTTATGACACCTGGACCCAGGGAGTTGACAGCGTCTGGGTTTCAGAGG16.666666666666667No Hit
GCCCATAATAAATCCGCTACCGACGCTGACTAACATTTCGCGATCGTTCA16.666666666666667No Hit
GGTGAGAAAACCCTCTCTACTTTGGCGCGACTGCGTGAACGCGACATTAC16.666666666666667No Hit
ACGCTGCCGAGTGGCATTTTTTTGACATCGATTATCTAATAACGAAAACC16.666666666666667No Hit
GTACATGGGACTCTCGAAGTGGAGCCGAGTGACACCATTGAGAATGTCAA16.666666666666667No Hit
GTTGTGATCTTGAGAACTCCAGCGTGCACCAAGGCGTCCTCCCTCCAGGC16.666666666666667No Hit
ACATAGGGGGAATTCGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGA16.666666666666667No Hit
TTCTTATACAGGTTATAGCGTTTAAGATGATTCGCCGGATCGCTGGCCCG16.666666666666667No Hit
GGCGATGAGTGTGGGGAGGAATGGGGTGGGTTTTGTATGTTCAAACTGTC16.666666666666667No Hit
CAATCCGTGGCGGAAAAACACAAATGTGCACGCTCGCCTAAGGCTTCGTA16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)