FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00001324356

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001324356
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC42

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCTTCAGGGGACATTTTCTCTGTTTCAGAAAGAAACTGTTTCAGAACAG16.666666666666667No Hit
GCCTAATCATGTCGTCGCCAAGTCCCGCTTCTGGTACTTTGTATCTCAGT16.666666666666667No Hit
CTGTGATACCGTCCATGAGGATACCAACGGTGCTTAGTAGTAAAGAACAT16.666666666666667No Hit
ATGTTAAGCCACTTAGTTAATAACAAATAGCATTTGGTTTTTTAGCATTA16.666666666666667No Hit
TCTTTGGACTAACAGTTAAATTTACAAGGGGATTTAGAGGGTTCTGTGGG16.666666666666667No Hit
GAGATAGAACAAGCCATGAGTACAGCCAGATAATTAAAGCCATGGAAAGC16.666666666666667No Hit
TATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTGAA16.666666666666667No Hit
CCTTGAAACTACACATGGCTTGCAAAATACATTCAATAGATAGGTGTAGT16.666666666666667No Hit
GTCCAGGGCAAAGGTCAGGACTGCCCGGGCCTCCTTTTCTTGCTTGGATG16.666666666666667No Hit
CTTCCAGGACATCAAGAAGCCAGCTGAAGATGAGTGGGGTAAAACCCCAG16.666666666666667No Hit
GCACTCAATAATTTAGCTTTTGGAGCATTCTCCATACAGTCTAATTTAAT16.666666666666667No Hit
GTACATGGGGGGAATTCGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTT16.666666666666667No Hit
GTGTTTAATGACTACACTGCAGTTCCAGACCTCTACTTTGAAAATGCCAT16.666666666666667No Hit
TTGCAGTTGTTTGCTTAAAGACTTATTGAAATGGTTACTGGCGTAAATAC16.666666666666667No Hit
CTTGTATGCTTTCTCGAAGTCCTTGGCCAGGACAATGTAGCGGTTTTCAC16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)