FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00001324357

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001324357
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC54

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGGAGGCGCGGAGACGGGGGCGGCGCCGACCGGGGCCCCGCCCCCCTGAG16.666666666666667No Hit
GACTATAATTGCAACGTAGAGCTTGCTCTGACTTCTGATGGCAGGACAAT16.666666666666667No Hit
TGCACCCCCGCGAGGGCGGTCCAGCAGACCCGCCCCCCGCGCGGGCGGGG16.666666666666667No Hit
CCATTACTGTCATGTGGGATAGTGATAACACTATGGATCATTACAAATAT16.666666666666667No Hit
CCTACCGAGCCTGGTGATAGCTGGTTGTCCAAGATAGAATCTTAGTTCAA16.666666666666667No Hit
TGCCGCTTGGTAGCGGGGGATAAGCGCGGCGCCGGGCCGCCCCGTGTGCT16.666666666666667No Hit
CTTTACTCGCAGAATTTGCCTTCCTACTACAGTCTCAGAGAATCCCAGTC16.666666666666667No Hit
TGGGTCCTTTCTCGGCGGCGGTGCCGGGCGGCGGCGGGGGGCCGTGGGGG16.666666666666667No Hit
GGCTTAGGCAGAAGCCCTATTACTTTGCAAGGGGCCCTTCAGAAGTCGCT16.666666666666667No Hit
CATAGCTAGTAACGCACGGGGGGTGGGGGTAGAGCAGGCTCTGGAGGGGG16.666666666666667No Hit
CTTCTATAGTCTACAGTGGCTTTCTTGTGCCAAAAGCCTTGCAGTTCCCT16.666666666666667No Hit
CCAGACTGGCCGCGCGGGCGACGGCTTCCCATGTCTACCCGAGAACCACC16.666666666666667No Hit
TGAAACCGATAACACCAGATCATGCTAGAAAAAGGAGCGGCTTCGGGGTG16.666666666666667No Hit
TTTGAAAAAAAAAAAATACTAAGCATTTTTCTAAAGTCATATTTTTTGAG16.666666666666667No Hit
GAAAAGATCAGGGGCAATAAAGTTGAGTTGGCCAAGTATTTACGCCAGTA16.666666666666667No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)