FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00001324358

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001324358
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC44

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCGACCCAAAGGTGGATAGTCTGAGAAGCTCTCAACACACATGGGCTTGC13.3333333333333335No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAA13.3333333333333335No Hit
CTACCACCCCTCTAATGAAGTTCAGATATTCAGGGATTAGCTCCTCACAG13.3333333333333335No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCG13.3333333333333335No Hit
ATGTAGGGGGAGTATTGGACTGGCTTTAAATTTCAACTATTTGTGGTGAC13.3333333333333335No Hit
GTGTGTTTACGTTATACAGGGAAACCTGCAATATTGGAGACTTAGGGGGT13.3333333333333335No Hit
GTCTGAAAGGTAAGCGCCATCGTGGTCAGAGATACGGAGGCCCGGTCAGA13.3333333333333335No Hit
GGATTAAGGCAAGAAAAATAACTAAAAGCTACAATAAAAACTGAAAAGAA13.3333333333333335No Hit
ATCTTTATCTAGTCGTTGCTTGAACAGGTTGTGTTCCACATCCAGCTGCT13.3333333333333335No Hit
CTACATAGTTGTGAATTCCAATTCTGCTACTATATTTAACTTACAGACCT13.3333333333333335No Hit
GCCTGGAGTGCAGTGGCGAGATCATAGTTCATGGCAGCTTCGAACTTCTG13.3333333333333335No Hit
CCATCATTTAGGTGAGAAAACCCTCTCTACTTTGGCGCGACTGCGTGAAC13.3333333333333335No Hit
CTCTACAAGGTTTTTTCCTAGTGTCCAAAGAGCTGTTCCTCTTTGGACTA13.3333333333333335No Hit
CATATCTTCAATGACGACGGTTGGTTTACCGGGAAAGAGATCCCTGCGTT13.3333333333333335No Hit
GCGCTATCGCTGGATGCGTATTTGATTACCGGCAACGGAACGCGCGTGCA13.3333333333333335No Hit
GATTCAGCAGCTCCAGCAGGATCCTCTGAACCTCCCTGTCGGCCCCTGTC13.3333333333333335No Hit
ACACCATTCTTCGCCAGGCCAGGAATCACAAGCTCCGGGTGGATAAGGCA13.3333333333333335No Hit
TCACAGTGCAGCTTGTGGCTCGTGTCCATCTTGCAGGTGGCTCTTCCTCC13.3333333333333335No Hit
CCCCATACCTCAAGGGTTCTCTTGTTTATCGAGGTTTTTGGGCTGGTGGT13.3333333333333335No Hit
CTCTTAGCCAATATTGTGCCTATTGCCATACTAGTCTTTGCCGCCTGCGA13.3333333333333335No Hit
CTGTAGACGCATCACGAGACATCCATTTACTTAATCACAGAAGTGGATCT13.3333333333333335No Hit
GATCAAGACCCTCAACAACAAGTTTGCCTCCTTCATAGACAAGGTACGGT13.3333333333333335No Hit
CCTTTATTAACATTTTGAACAGGTTCAGCTATTACTGAAACTTGTAATTT13.3333333333333335No Hit
GAACAGAAGTCCAAAAGCAAACAGCACCGAGTGTCAAGGAGAGCACAGCA13.3333333333333335No Hit
CAGGAACCACAGTGCCAGATCCCCACAGCTCGTCTCTTCATCTTGGTTTT13.3333333333333335No Hit
TTGTTGCTGTTTGTTTGAAGTTCAAGCTGTGTATCAGGCATACTAGGCAC13.3333333333333335No Hit
CTGTATGCCTTCTTATGAAATGTTTTTCCAGTTCGGGAAAGTGTCAACTA13.3333333333333335No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGACGGAGT13.3333333333333335No Hit
ATTCTATTCATACTTATTTGGATGTACTTACCAGCTATTACCCTGACCAG13.3333333333333335No Hit
CTTCAAGGCCTGGCCTTGTTCCTGATTCCTCAAAAAATCTTGACTCTAAG13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)