FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00001324359

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001324359
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[FAIL]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GACCTGCGGGGGCGCCACCGTGACCATTGTCAGTGGCCTTCTCATGCTGC13.3333333333333335No Hit
CCTCAAGCTTGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTCAAAATTT13.3333333333333335No Hit
AGGGGGCGCACGCGGGGGCGCAGAAGGGAAGTGGTAGGCAATGGATTGGG13.3333333333333335No Hit
GGGCGGGGAGACCGTGGGACGGGCACGCCGGCGCAGGGAGTGGTTGAAGC13.3333333333333335No Hit
GTGAGCTTCAATAAAGATATCCTTAGCTTTTTCAGGGAAGTCCTTTATTT13.3333333333333335No Hit
CATCTTAGAGCAGTTAATGAAATGTTTTGTATTTCAGTAGAAAACTATTT13.3333333333333335No Hit
GGTCCTGAAATTCCAACTCCTTGATGCTGCCTTTCAACTCAGAGGAACAA13.3333333333333335No Hit
ATTGAGTAGTGCCAGGGATTCACCATGTTGACCAGGCTGGGCGTGAACTT13.3333333333333335No Hit
GAATATTGACCAGTAAGAGGGTAAATAAAGTGGGGGCAACCCCTGGATAT13.3333333333333335No Hit
GGTGAAGGAGATGAACCCTGCTCTTGGCATCGACTGTTTGCACAAGGGGA13.3333333333333335No Hit
GCCTAAGGTTGTTGATGTAGCTCTCGAACATGTTGTCCATGTTGCTTCGA13.3333333333333335No Hit
GACTCCAGGTAGACAACACCGCTTTTGTGTATTTATTTATTTTTTGCAGA13.3333333333333335No Hit
GTTTATTGGATATCCCATTACTCTTTTTGTGGAGAAGGAACGTGATAAAG13.3333333333333335No Hit
GCCCAAGAGACGAATGGGCTGGGCCCCAGGCCGCGGCGTCCACGCCCAAC13.3333333333333335No Hit
GCCAAGTGCTAACATGCCTTGGTTCAAGGGATGGAAAGTCACCCGTAAGG13.3333333333333335No Hit
TGAGGACACCCAGGAATGACCCTTTTGTGTCTATGATGTTGCTGTTCACA13.3333333333333335No Hit
TAAAAGGAAAAAAAAAAAACGTAAAGGGACTTAAATCAAGAAATGTCTGG13.3333333333333335No Hit
GTGAAGAGTTTTCTGCATATTCTAAGTGATTTATGGTATTAACTCGTTTG13.3333333333333335No Hit
GCCTGCAACAACGCAGGGATCTCTTTCCCGGTAAACCAACCGTCGTCATT13.3333333333333335No Hit
GCCTCTACGGCCGGCAGGATCGATTTTGAAAAGGGACAGGCAAGCACTAA13.3333333333333335No Hit
ACCACAGGCTTCTTGCCTGCAACCGCCGCCTTCTCATCTGATTTGGCTTG13.3333333333333335No Hit
ACACCCTGGAAGTTGCAGCCGGATGAGGATAAGAGACCGGATTCAGGGTG13.3333333333333335No Hit
AGGCAATCCGTGGCGGAAAAACACAAATGTGCACGCTCGCCTAATGCTTC13.3333333333333335No Hit
TTCCCCACCTCCAACCATTTTATTTTTCATCCGTATTAATAGCCTTATGT13.3333333333333335No Hit
ACATGGGGAGGGGCGGTTGGCTTTGTTGGGTGAGCATGTTTGTGTTCCTG13.3333333333333335No Hit
TAACTGTAATTATTGTCATTTTAAAAACACTAGAGTCCCTTTTCTTCTGT13.3333333333333335No Hit
ATAAATGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTATAATCCCAGCATTTTGGGA13.3333333333333335No Hit
AGGGGTACAGGAAACGGGAGCATCGCAGGGGCCGCACCGGCCGTCGCGCT13.3333333333333335No Hit
GTACAAGACAATATATAATTTGGCGTTAAGAATGTCATACAGACTTGAAG13.3333333333333335No Hit
TAATTAGGCTGTGGGTGGTTGTGTTGATTCAAATTATGTGTTTTTTTGGA13.3333333333333335No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)