FastQCFastQC Report
Mon 5 Sep 2022
EGAF00001745377

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001745377
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences5197890
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length126
%GC59

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGT468180.9007116349133976No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGT399480.7685426201785724No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGG269930.5193068725963804No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGT211680.4072421694187449No Hit
GTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT206910.39806536883235316No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGG200760.3862336448058732No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGT172340.3315576128005787No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGG167630.32249624366810375No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT165950.31926416295843124No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGG165620.3186292899618884No Hit
GGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGG161300.3103182252798732No Hit
GATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGG156000.3001217801838823No Hit
GTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG128810.24781209298388387No Hit
GTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT128700.2476004686517029No Hit
GTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATG123420.23744250070701764No Hit
GGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCG122900.23644209477307138No Hit
GTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGT117670.2263803197066502No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTG114690.22064722416211194No Hit
GGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCA110120.21185519508877643No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGG110000.21162433218094268No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT108300.20835377431996446No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGT106820.20550646512334814No Hit
GTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT98630.18975007166369431No Hit
GTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT97400.18738372685839833No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGT94740.18226626573475008No Hit
GGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCA94320.18145824555733192No Hit
GGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCA92800.17853398205810433No Hit
GGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTG91630.17628306870672522No Hit
GTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT90360.173839769598818No Hit
GGGTGTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCA89380.1719543891848423No Hit
GGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGG88390.17004977019521383No Hit
GTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGT87690.16870306989951692No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG87630.16858763844560004No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG83380.16041124379315455No Hit
GGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGG81950.15766012747480226No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT80520.15490901115645No Hit
GATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGG79780.15348535655814186No Hit
GGTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGG78200.15044566160499742No Hit
GGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCAC77630.1493490627927871No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTG75990.14619393638572575No Hit
GTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGG75840.14590535775093355No Hit
GTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGT75000.14428931739609727No Hit
GGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGT73720.1418267797125372No Hit
GGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTG73320.14105723668642467No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTG72700.13986444499595027No Hit
GTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATG72470.13942195775593558No Hit
GTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG70650.1359205369871236No Hit
CCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGT70170.1349970853557886No Hit
GTGGTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG67720.13028363432084944No Hit
GATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGG67450.12976419277822346No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGA65370.12576256904243838No Hit
GGGTGTCATGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCA65000.1250507417432843No Hit
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GTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGG64240.1235886099936705No Hit
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GTGGTGATGGCTGTTGGGGTTGGGGCCTGTGTGCCAGTGGGTGTTGGGGT63350.12187637676057016No Hit
GTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG62840.12089520940227669No Hit
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GTTGGGTTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGT61280.11789399160043787No Hit
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GGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGT59070.11364226638116622No Hit
GATGGGTGTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGG58920.113353687746374No Hit
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GTGCTGATGGGTGTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT58410.11237252038808056No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGAGATGGG57230.11010236846104862No Hit
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GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGG57050.109756074099298No Hit
GGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCG56800.10927510970797766No Hit
GTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGG56710.10910196252710234No Hit
GGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCT56560.10881338389231016No Hit
GTGCCAGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGG55630.10702419635659854No Hit
GTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACC55270.10633160763309726No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGCTGATGGG54670.1051772930939285No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAATGGTGGT54470.10479252158087224No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGTGTCACCGTGGTGGTGGT53660.10323419695299439No Hit
GGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGT53470.10286866401559094No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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