Basic Statistics
Measure | Value |
---|---|
Filename | EGAF00001878274 |
File type | Conventional base calls |
Encoding | Sanger / Illumina 1.9 |
Total Sequences | 28200970 |
Sequences flagged as poor quality | 0 |
Sequence length | 50 |
%GC | 44 |
Per base sequence quality
Per tile sequence quality
Per sequence quality scores
Per base sequence content
Per sequence GC content
Per base N content
Sequence Length Distribution
Sequence Duplication Levels
Overrepresented sequences
Sequence | Count | Percentage | Possible Source |
---|---|---|---|
ACTTCCAGGGATTTATAAGCCGATGACGTCATAACATCCCTGACCCTTTA | 125693 | 0.44570452718470327 | No Hit |
GACGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACCGATGTATCTCGTATGCC | 58540 | 0.20758151226713123 | TruSeq Adapter, Index 2 (100% over 48bp) |
AATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAA | 39047 | 0.13845977638357831 | No Hit |
TAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTAATTA | 33794 | 0.11983275752571632 | No Hit |