FastQCFastQC Report
Sun 11 Sep 2022
EGAF00001879198

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00001879198
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences2973848
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length126
%GC58

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGT161570.543302818435912No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGG150440.5058765612768373No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGT130850.44000231350089175No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGT108800.3658559549781966No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGG95440.32093099580072687No Hit
GTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT90090.30294083624986884No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT85720.28824607041113065No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTG77070.259159176931706No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGT76140.25603191555183724No Hit
GTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT75810.25492224215898057No Hit
GTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT74770.25142508964815957No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG72710.24449803755941796No Hit
CTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTGGAAGCGGCCCCCGCAGACGCTCGG69440.23350218303020195No Hit
GTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG64050.21537751761354315No Hit
CCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGT63700.21420059128778607No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTG61970.20838321259190112No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGT60370.20300297795986882No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGG60160.20229682216441458No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG59900.20142253403670934No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGG59260.19927044018389642No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGG57800.19436097608216693No Hit
TGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTC57250.19251152042740585No Hit
GTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGG55830.18773656219147716No Hit
GGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCG48570.1633237475486306No Hit
GTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG45900.15434548100642667No Hit
GTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT45840.15414372220772546No Hit
GTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT45800.15400921634192466No Hit
GGTGTCTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTGGAAGCGGCCCCCGCAGACG45140.15178986955621135No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGT44610.15000766683435066No Hit
GGCAGAGGTTGTGCTGGTTGTAGGAGCAGAGGTTGTGCTGGTGGTGGGAA43090.14489644393391996No Hit
GTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCTTG43020.14466105866876855No Hit
TGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCG41550.13971796810058887No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT41330.13897818583868443No Hit
GGGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCT40700.1368597184523217No Hit
CTGCTGAGGGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAA40200.1351783951298116No Hit
GTGGGAACAGGGCTGGGAGTAGTTCCAGGACCAGAGGTTGTGCTGGCTGT40190.13514476866336142No Hit
GTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGT39980.13443861286790718No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT39850.13400146880405453No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGA39330.13225289254864403No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG38360.12899112530297446No Hit
GTGGAAGCGGCCCCCGCAGACGCTCGGCAGGTGTCTTGATATTATCATCT37880.12737705491336476No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGCTGATGGG36710.12344275833869114No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGG35440.11917219709951551No Hit
GTCCACGTCAAGAGCCAAGCCAAGGTACTGTTCCTCCAATGAGTAAACAG34960.11755812670990581No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTG34410.11570867105514472No Hit
GGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCT34260.11520427405839169No Hit
GGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCAC33250.1118080009469213No Hit
GTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATG33050.11113547161791726No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCAT31740.1067304045129408No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTG31170.1048136959252793No Hit
GATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGG31040.10437655186142669No Hit
GGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCTT30870.10380490193177325No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGT30020.10094665228350609No Hit
GTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG29970.10077851995125507No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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