FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00002295204

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002295204
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences240
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[WARN]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG4619.166666666666668No Hit
GTAGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCAGCGTGAAGATGCCGAT218.75No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTCTGTCCACTCTTAACGGCCCC156.25No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCCCCCTCAGTGA135.416666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCGGCAGGTGGGGCGGGAGGCTGCGCGGGGCCCGCGCCCC104.166666666666666No Hit
CAGTGACATGTATTCCCCCTCTTACCTTAAGGCTGTGATTCTTTCTCTCTTCTTTTTTCTTCCTGGCAGTATTAT83.3333333333333335No Hit
ACATCAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACAAAAGCCACCACAGCAATAAGCTGGAGGACCGCATTGACTACCTGA83.3333333333333335No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCACCTTCCCATAAGCAGCACTCTGCACAGCATCATCCAT62.5No Hit
GACACTTGGCCTGGAGTACGGTGATGGCGTTGAGGCTGTGGTAGGGCCGGGGCACCAGCAGCGGGTAGCCGGCAA62.5No Hit
GGCTGTGGTGTGAGTCCGGGGGGCGGCCGTAGCGCGCCATTTGCACCCGCAGCTCGCGGCCGTCCAGCACGGCCC62.5No Hit
TTTCAGGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGATTTGCCAATTTCAGCTCCATTGGGATCATG52.083333333333333No Hit
CCTTTAACAAGTATGCCTGTCAGCACCACACTGGTGGCCACTTCTGCAATCAGCACCCTTTCAACAACTCCTGTT52.083333333333333No Hit
CCTTTAACAAGTATGCCTGTCAGCACCACACTGGTGGCCACTTCTACAATCAGCACCCTTTCAACAACTCCTGTT41.6666666666666667No Hit
GGCTGTGGTGTGAGTCCGGGTGGCGGCCGTAGCGCGCCATTTGCACCCGCAGCTCGCGGCCGTCCAGCACGGCCC31.25No Hit
GTAGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCAGCGTGAAGATGCCTAT20.8333333333333334No Hit
ATAGCAGAATCATCGTGGTCTCCAGAAGTGCCCACGTTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCACCAGGGGAAGCAGTGG20.8333333333333334No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTCTGTCCACNCTTAACGGCCCC20.8333333333333334No Hit
GTAGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCAGCGNGAAGATGCCGAT20.8333333333333334No Hit
TAAAATAGTAGCCCTCCCGCACTCACCAGGTCCGGTCGGTAGTACCTGTGCACCACTTCTGCCCCTGCGCACATG20.8333333333333334No Hit
CTTTGACAGCATCACGAGTTTCACCGGGATCACCAATGCCATACTCATTTTCAGCAAACACTCGGAAGAAGTAGG20.8333333333333334No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGNCCCCCTCAGTGA20.8333333333333334No Hit
CAAGCAATCAAGACCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCGCCTTCCCATAAGCAGCACTCTGCACAGCATCATCCAT10.4166666666666667No Hit
GTCCAGGGTGGGCATGGATTGCAGGGCCGCGGGCACGGGGGGCACTGCGTCCTGCTTGAGGATGGGTAGGGGGAT10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCACTG10.4166666666666667No Hit
ACATCAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACAAAAGCCACCACAGCAATACGCTGGAGGACCGCATTGACTACCTGA10.4166666666666667No Hit
GACACTTGGCCTGGAGTACGGTGATGGCGTTGAGTCTGTGGTAGGGCCGGGGCACCAGCAGCGGGTAGCCGGCAA10.4166666666666667No Hit
CTTTGACAGCATCACGAGTTTCACCGGGATCACCAATGCCATACTCATTTTCATCAAACACTCGGAAGAAGTAGG10.4166666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACGTGCATTCATATCGNATGCCGTCTTCT10.4166666666666667No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTTTGTCCACTCTTAACGGCCCC10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATATGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGACTGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCACTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGTTGCTGGGTGCCCCCTCAGTGA10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGTGGCCCCCTCAGTGA10.4166666666666667No Hit
GTAGTGCTGCTCGTCCAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGATCAGCGTGAAGATGCCGAT10.4166666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGTGCGGCAGGTGGGGCTGGAGGCTGCGCGGTGCCCGCGCCCC10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTCCTCAGAGTGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACCCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGNGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
CAGTGACATGTATTCCCCCTCTTACCTTAAGGCTGTGATTCTTTCGCTCTTCTTTTTTCTTCNTGGCAGTATTAT10.4166666666666667No Hit
ACATCAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACAAAAGCCACCGCAGCAATAAGCTGGAGGACCGCATTGACTACCTGA10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACAGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCATG10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACGCAGAGGGACTAAGCACCGCATGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTTACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTGG10.4166666666666667No Hit
TTTCAGGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCACTCTGTGGATTTGCCAATTTCAGCGCCATTGGGAGCATG10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAGCGGAGCGTGGACCCAGTCCCGCGTCTCCTCCCAGGTGCGGGGGNCCCCCTCAGTGG10.4166666666666667No Hit
ATAGCAGAATCATCGTGGTCTCCAGAAGTGCCCACGTTGCTCTTGCCGCTCCCTCTGCACCAGGGGAAGCAGTGG10.4166666666666667No Hit
GTAAAAGTTGAAATGTCAGGGCCGCGGGCACGGGGGTCACTGCGTCCTGCTTGAGGATGGGTAGGGGGCTCAGGT10.4166666666666667No Hit
TTTCAGGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGCTTTGCCAATTTCAGCTCCATTGGGATCATG10.4166666666666667No Hit
ACATCAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACCAAAGCCACCACAGCAATAAGCTGGAGGACCGCATTGACTACCTGA10.4166666666666667No Hit
GTAGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCAGCGTGAAGATGCCGAA10.4166666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCGGCAGGTGGGGCGGGAGGCTGCGCGNGGCCCGCGCCCC10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGTACCGCCTGGCAGGTCGNGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTCTGTCCACTATTAACGGCCCC10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCGGGTCGCGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
GACACTTGGCCTGGAGTACGGTGATGGCGTTGAGGCTGTGGTAGGGCCTGGGCACCAGCAGCGGGTAGCCGGCAA10.4166666666666667No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTCTTTCCACTCTTAACGGCCCC10.4166666666666667No Hit
TCTCGTTCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCGGCAGGTGGGGCGGGAGGCTGCGCGGGGCCCGCGCCCC10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCACGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCCCCCTCAGTGG10.4166666666666667No Hit
CAGTGACATGTATTCCCCCTCTTACCTTACGGCTGTTATTCTTTCTCTCTTCTTTTTTCTTCCTGGCAGTATTCT10.4166666666666667No Hit
AAATCAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACAAAAGCCACCACAGCAATAAGCTGAAGGACCGCATTGACTACCTGA10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTCACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGTGGCCCCCTCAGTGA10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCCGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGTGTGCGGGTGGCCCCCTCAGTGA10.4166666666666667No Hit
AAAGTCTCTGACGTGGATGAGTTTGGGAGTGTGGAAGCTCAGGAGGAGAAAAAACGGAGTGGAGCCATTCAGGTA10.4166666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCGGCAGGTGGGGCTGGAGGCTGCGCGGGGCCCGCGCCCC10.4166666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCATTGCCGCCTTCGCATCGGCAGCACTCTTCACAGCATCATCCAT10.4166666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCTGCAGGTTGGGCGGGAGGCTGCGCGGGGCCCGCGCCCC10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGNGAAGGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCACCTTCCCATAAGCAGCACGCTGCANAGCATCATCCAT10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGGCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCCCCCTCAGTGA10.4166666666666667No Hit
GACACTTGGCCTGGAGTACGGTGATGGCATTGAGTCTGTGGTAGGGCCGGGGCACCAGCAGCGGGTAGCCGGCAA10.4166666666666667No Hit
CTTCTTGTTTTCGAGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTCTGTCCACTCTTAACGGCCCC10.4166666666666667No Hit
GTCATTGTCACTGGTCAGCTCCAGCACCTTCTGCTGCGTCTCCACGTTGCGCGCTTGGCCTTGTCGCGGCTCTTG10.4166666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCGCCTTCCCATAAGCAGCACTCTGCACAGCATCATCCAT10.4166666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCTGCAGGTTGGGCGAGAGGCTGCGCGGTGCCCTCGCCCC10.4166666666666667No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTCTGTCCCCTCTTAACGGCCCC10.4166666666666667No Hit
CCTTTAACAAGTATGCCTGTCAGCACCACACTGGTAGCCACTTCTGCAATCAGCACCCTTTCNACAACTCCTGTT10.4166666666666667No Hit
GTCCAGGGTGGGCATGGATTGCAGGGCCGCGGGCACGGGGGGCACTGCGTCCTGCTTGGGGATGGGTAGGGGGAT10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGCCCCCTCAGTGAG10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAATGGGCCCTG10.4166666666666667No Hit
CATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTGGGGGTTCCGGAGCTGC10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCGCCCTCAGTGA10.4166666666666667No Hit
ACATAAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACAAAAGCCACCAAAGCAATAAGCTGGAGGACCGCATTGACTACCTGA10.4166666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCGGCAGGTGGGGCGGGAGGCTGCGCGGGGCCCGCGCACC10.4166666666666667No Hit
GTAGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCCCAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCCGCGTGAAGATGCCGAT10.4166666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGAGGCAGGTGGGGCGGGAGGCTGCGCGGGGCCCGCGCCCC10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCCCTCTCAGTGA10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGCACAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCCCCCTAGGTGA10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGAACTCAACACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCGCTG10.4166666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGTGTGCGGGTGGCCCCCTCATTGA10.4166666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTT10.4166666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph