FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00002295423

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002295423
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences60
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC57

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[WARN]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG711.666666666666666No Hit
GTAGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCAGCGTGAAGATGCCGAT711.666666666666666No Hit
TAAAATAGTAGCCCTCCCGCACTCACCAGGTCCGGTCGGTAGTACCTGTGCACCACTTCTGCCCCTGCGCACATG58.333333333333332No Hit
TTTCAGGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGATTTGCCAATTTCAGCTCCATTGGGATCATG23.3333333333333335No Hit
CCTTTAACAAGTATGCCTGTCAGCACCACACTGGTGGCCACTTCTACAATCAGCACCCTTTCAACAACTCCTGTT23.3333333333333335No Hit
GTCATTGTCACTGGTCAGCTCCAGCACCTTCTGCTGCGTCTCCACGTTGCGCGCTTGGCCTTGTCGCGGCTCTTG23.3333333333333335No Hit
GGCTGTGGTGTGAGTCCGGGTGGCGGCCGTAGCGCGCCATTTGCACCCGCAGCTCGCGGCCGTCCAGCACGGCCC23.3333333333333335No Hit
CTTTGACAGCATCACGAGTTTCACCGGGATCACCAATGCCATACTCATTTTCAGCAAACACTCGGAAGAAGTAGG23.3333333333333335No Hit
CTTTGACAGCATCACGAGTTTCACCGGGATCACCAATGCCATACTCATTTTCAGCAAACACTCTGAAGAAGTAGG11.6666666666666667No Hit
GTCGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCAGCGTGAAGATGCCGAT11.6666666666666667No Hit
CCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCATACTCTCTCTGCTCCGCCTGGCAGGTCGCGCAGCTGCCCTT11.6666666666666667No Hit
CAGTGACATGTATTCCCCCTCTTACCTTAAGGCTGTGCTTCTTTCTCTCTTCTTTTTTCTTCCTGGCAGTATTAT11.6666666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGTAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG11.6666666666666667No Hit
TAAAATAGTAGCCCTCCCGCACTCACCAGGTCCGGTCGGTCGTACCTGTGCACCACTTCTGCCCCTGCGCACATG11.6666666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCCCCCTCAGTGA11.6666666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCACCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG11.6666666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCGTGCAACCTGCCCATAAGCAACAATCTGCACAACATCATCAGT11.6666666666666667No Hit
AACTGTAGCTTACACTGACTCCGTGGAACAGTTTCTCCCCAATGAGACGAACGTCTGTGTTGTTATCAGCCAAGC11.6666666666666667No Hit
CTTCAGTGGAACATTCAGTTGTCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGTCCACGAGACACCATTCAATCTCGTATGC11.6666666666666667No Hit
ATGCTCAGTTGTAGGTGATTCTCACTTTACAACTTTTGATGGTCGACATTATTCTTTTATTGGCATGTGCCAATA11.6666666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCACCTTCCCATAAGCAGCACTCTGCACAGCATCATCCAT11.6666666666666667No Hit
GACACTTGGCCTGGAGTACGGTGATGGCGTTGAGGCTGTGGTAGGGCCGGGGCACCAGCAGCGGGTAGCCGGCAA11.6666666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCGCCTTCCCATAAGCAGCACTCTGCACAGCATCATCCAT11.6666666666666667No Hit
GTCATTGTCACTGGTCAGCTCCAGCACCTTCTGCTGCGTCTCCACGTTGCGCTGCTTGGCCTTGTCGCGGCTCTT11.6666666666666667No Hit
CAACCAAAAGAACAGCCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACACCATTCAATATCGTATGCCGTCTT11.6666666666666667No Hit
CCTTTAACAAGTATGCCTGTCAGCACCACACTGGTGGCCACTTCTACAATCATCACCCTTTCAACAACTCCTGTT11.6666666666666667No Hit
CAGTGACATGTATTCCCCCTCTTACCTTAAGGCTGTGATTCTTTCTCTCTTCTTTTTTCTTACTGGCAGTATTAT11.6666666666666667No Hit
CAGTGACATGTATTCCCCCTCTTACCTTAAGGCTGTGATTCTTTCTCTCTTCTTTTTTCTTCCTGGCAGTATTAT11.6666666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCGCCTTCCCATAAGCAACACTCTGCACAGCATCATCCAT11.6666666666666667No Hit
ACATCAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACAAAAGCCACCACAGCAATAAGCTGGAGGACCGCNTTGACTACCTGA11.6666666666666667No Hit
GGCTGTGGTGTGAGTCCGGTTGGCGGCCGTAGCGCGCCATTTGCACCCGCAGCTCGCGGCCGTCCAGCACGGCCC11.6666666666666667No Hit
TAAAATAGTAGCCCTCCCGCACTCACCAGGTCCGGTCGGTAGTACCTGTGAACCAATTATGCCCCTGCGCACATG11.6666666666666667No Hit
CAAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTTCATCACTTGCCACCTTCCCATAAGCAGCACTCTGCACAGCATCATCCCT11.6666666666666667No Hit
CAGTGACATGTATTCCCCCTCTTACCTTAAGGCTGTGATTCTTTCGCGCTTCTTTTTTCTTCCTGGCAGTATTAT11.6666666666666667No Hit
TAAAATAGTAGCCCTCCCGCACTCACCAGGTCCGGTCGGTAGTACCTGTGCACCACTTCTGCCCCTGCTCACATT11.6666666666666667No Hit
GGCTGTGGTGTGAGTCCTGGTGGCGGCCGTAGCGCGCCGTTTGCACCCGCAGCTCGCGGCCGTCCAGCACGGCCC11.6666666666666667No Hit
CCAGCAATCAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCGCCTTCCCATAAGCAGCACTCTGCGCAGCATCATCCAT11.6666666666666667No Hit
CAAGCAATAAAGGCCAGTCTACCCTGCAGCCCTTGCCGCCTGCCCATAAGCAGCACTCTGCACAGCATCATCCAT11.6666666666666667No Hit
TCTCGTGCTCGCAGATGCCGCCCAGCGGCTCCGGGGCGGCAGGTGGGGCGGGAGGCTGCGCGGGGCCCGCGCCCC11.6666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)