FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00002295640

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002295640
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC57

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTAGTGCTGCTCGTACAGGTAGCAGGCCACCACAATGCTGGCGGGGACCGTGTAGAGCAGCGTGAAGATGCCGAT213.333333333333334No Hit
TAAAATAGTAGCCCTCCCGCACTCACCAGGTCAGGTCGGTAGTACCTGTGCACCACTTCTACACCTGCGCACATG16.666666666666667No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCACTGTCGCTCTGTCCACTCTTAACGGCCCC16.666666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGTGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG16.666666666666667No Hit
ATAGCAGAATCATCGTGGTCTCCAGAAGTGCCCACGTTGCTCTTGCCGCTCCCCCTGCACCAGGGGAAGCAGTGG16.666666666666667No Hit
GCACAGGTCGTATACGCATTGGCGGAAGTACTCAGAGGGACTCAGCACCGCCTGGCAGGTCGCGAAGGGGCCCTG16.666666666666667No Hit
ACATCAGCCTCTTTATTCTCAGCATTGACAAAAGCCACCACAGCAATAAGCTGGAGGACCGCATTGACTACCTGA16.666666666666667No Hit
AACTGTAGCTTACACTGACTCCGTGGAACAGTTTCTCCCCAATGAGACGAACGTCTGTGTTGTTATCAGCCAAGT16.666666666666667No Hit
TTTCAGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGATTTGCCAATTTCAGCTCCATTGGGATCATGC16.666666666666667No Hit
AAAGTCTCTGACGTGGATGAGTTTGGGAGTGTGGAAGCTCAGGAGGAGAAAAACGGAGTGGTGGCATTCAGGTAC16.666666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGTGCCCCCTCAGTGA16.666666666666667No Hit
TAAAATAGTAGCCCTCCCGCACTCACCAGGTCCGGTCGGTAGTACATGTGCACCACTTCTGCCCCTGCGCACATG16.666666666666667No Hit
GTTTCCAGGTCAAGGGTAACGGAGCGTGGACCAAGTCCCGCGTCTCCTCCCGGGTGCGGGGGGCCCCCTCAGTGA16.666666666666667No Hit
CTTCTTGTTTTCGGGACATGCTTCAGCCCCTAGCCCTCCTTGGTCGCTGTCGCTCTGTCCACTCTTAACGGCCCC16.666666666666667No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)