FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00002295819

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002295819
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTTCCCTCATTTGACCAACTCCATCTAAGTTTAGATGTGCAGAAGGGCTTAGATATATCCAGAGTAAGCCACATG12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGTCTCTCTGCTTCCAGGGGCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACA12.083333333333333No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACATGGGCAGGAATTCGGCTGTATATTTGTGGAGTTAACATAGACACAAGGACGATCCA12.083333333333333No Hit
AACAGAAGTCATCTTTACAGAGGTGATATGCTTGATCTACACAGAGATGTGACTTGATCTGTAGCACCAATGCAA12.083333333333333No Hit
GGTCTTTCTATCTCTTGTACTACACTGAATTCACCCCCACTGAAAAAGATGAGTATGCCTGCCGTGTGAACCATG12.083333333333333No Hit
AGCCTCTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACG12.083333333333333No Hit
GCCTCTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGA12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGTGCAGGGCGAAAGTCACAGGCTCGCTTCGGAGCCTCTCAGTTAAACAGATCA12.083333333333333No Hit
GTCGTCATGGCGGCGACTAAGGAGAGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGCTGCGCGGCGCTGGAGCGGCGGCGGGGGCC12.083333333333333No Hit
CGAGAACATGCCTCTCGCAAAGGATCTCCTTCATCCCTCTCCAGAAGAGGAGAAGAGGAAACACAAGAAGACACG12.083333333333333No Hit
AACGCAGAGTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGAGGCTCGGTTCCGAGCAGACCCTGTCTCTTATACACATCT12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGAGGCGGCCGAAAGACAGAGGCTCGGGTCAGAGAAAAACACTTGAGCGAGGCC12.083333333333333No Hit
GAGGTCGAACTGCACCTCACGGGCAACATGGAACGCTACGCATGGTCCCTGGACGGGCTGGAGTTCGGAAAGTCC12.083333333333333No Hit
ACCACATCAAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCACGACCAGGGGAGGTAGTGACTAAAAATAACAA12.083333333333333No Hit
GAGCTGTGCAGCAAACAGTCGACCCCCATGGGGCTCAGCCTTCCCCTGAGTACTAGCTGTCTCTTATACACATCT12.083333333333333No Hit
GAACAAAGTCATGCCTTAATAGTTCTGCTGATGTTGGCCTTTCCTGAGGTATTTTCTGCAAGCAGTAATCAACAA12.083333333333333No Hit
CTCCTGCAGCTTGGACCTTTGACTTCTGACCCTCTCATCCTGGATGGTGTGTGGTCTGTCTCTTATACACATCTC12.083333333333333No Hit
CTCAGTTACGTGTGGCGGACAAAAAAAAGGAGCAGACTGTGACAGACCATTCCCATCGGCCAAGTGGTCGAACCC12.083333333333333No Hit
GCTCGGAACCGAGCCTCTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAG12.083333333333333No Hit
GCTGAGTCGTTCTCTGGCTCCTCTACCTTCCCCCAATCGCAATCACCTGGAGACGCCACACCACGCCTTCCTCCT12.083333333333333No Hit
ACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGACCCGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAA12.083333333333333No Hit
CAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCCCCATGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCA12.083333333333333No Hit
GTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGTCGCTACGCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACATCTCA12.083333333333333No Hit
GAGACTGCCCCATGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACTAGCGCTGAGG12.083333333333333No Hit
GCTCAGGGTACTAAGGACAGTCTCCAGCCCTAGGCGGCAGCAGGGATGCCGCATGAGTGTCCCTGCCCCCTTGGC12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGAGGCTCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACG12.083333333333333No Hit
CTTGGGCCCAGGAGCTTGAGACCAGCCTGGGCAACATGACAAAACCCCATCTCTACAAAAAATAGAAAAATTAGC12.083333333333333No Hit
GACACACCCACGGTGCGGCCACGGCGGCCAGTGGTCTTGGTGTGCTGGCCTCGGACACGAAGGCCCCAGAAGTGA12.083333333333333No Hit
GCTCTCCTTCCTGGAGCCCAGAGGAGGGCAGCAGAAGGGGGTGGTGTCTCCAACCCCCCAGCACCTGTCTCTTAT12.083333333333333No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACATGGGCGCACTACAAGAAATAAAAATTAATCACAATCTGTGTCTCTAATATACACAT12.083333333333333No Hit
CTATTTGAGCATGGAAATCATAGTCCCCACTCTGTGAAAACTTAACGCTTTTTGGAAGACATTTCTGTAGCATGT12.083333333333333No Hit
GCTCGGAACCGAGCCTCTGTCTTTACGCCGGCGGCCCCTTTTAGAATCGGTTGAACCCTGTCTCTTATACACATC12.083333333333333No Hit
GAAACAAGCCACTGTACATCGGCAGCAGCCCCAAAGACAGAGCCAGGCTACCACTCTCATATACACATCTCCCAC12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGAAATTTCGGGATGATCTGAAAATCGATTAGTATAGAGCACTGTTTATGTATAT12.083333333333333No Hit
GTCTTCCTTTATCCATCTGCCATTCACATCTCATTCCAACAACATTCAAAATCTTAAACAACCTCTCCCAAGGGT12.083333333333333No Hit
TAAAGATACTGCCACAGACACCCCAATGTTTAGCAACTACCAACCTGATCAGTCAGCAACCATCCACGTGGAGGC12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGCTGCAGGCCCTAAGTCTCTGGAGTGACGAGACACTAATAACTTGAGCGTCGCC12.083333333333333No Hit
GCTTTGAGCCTCCCTCCTTCGTGGGCTGGTTCCTTGGCTGGGATGATGATTACTGGTCTGTGGACCCCTTGGACA12.083333333333333No Hit
GGGCTGTGGAGGTGGGCATGTGGGCCCCTGGGCCCAGGCTGGGGACAGAGCCCTTGTTTTGTGACTTAGGATTTT12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTATGGAGGGAACCCGCACAAGGGGT12.083333333333333No Hit
GTCTTCACTGCTCTGTGTCCTCTGCTCCTAGAGGCCCAGCCTCTGTGGCGCTGTTACCAGCAGGTATTGGAGATC12.083333333333333No Hit
CACCACTGCTGTTTGCCACTGCCGCAGACACGCGCTGACTTCCATCCCTTCGGATCCGGCAGGGTGTCCTCTGTG12.083333333333333No Hit
CACAAAATCTCACCACAATTCACACAGAGATAGTCTGGAACTTGTAACCTCCCATGTACTCTGCGTTGATACTGT12.083333333333333No Hit
GATGAACTGATTGAGGATTCAAAAGTGGCAGTCTGTTCCAGAGCCAGTGCCATGTTGCTTCCTGTATAAACAAGG12.083333333333333No Hit
GTCCGGGGCTGCACGCGCGCTACACTGACTGGCTCAGCGTGTGCCTACCCTACGCCGGCAGGCGCGGGTAACCCC12.083333333333333No Hit
CAGTCGCTACGGGTCTGCTCGGAACCGAGCCTCTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACTCTGCGTTGATACTGT12.083333333333333No Hit
AAATCTGCTCCTTCACGTCGTCAGATGTCAACTTCAACCAAGTGGGGACGCTGCGTCGATAGGGTAAAGCCGACT12.083333333333333No Hit
ACAGGTCTATCCTGAAGCGGGCTCGCCGGGAGCGCCCAGGCCGTGTAGCCTTTGATGGGATCACCGTCTTCTACT12.083333333333333No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)