FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00002295820

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002295820
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GAGGAAGGCGTGGTGTGGCGTCTCCAGGTGATTGCGATTGGGGGAAGGTAGAGGAGCCAGAGAACGACTCAGCCT12.083333333333333No Hit
GTCCTGTATTGTTATTTTTCGTCACTACCTCCCCGGGTCGGGAGTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTG12.083333333333333No Hit
TATCAACGCAGAGTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGAGGCTCGGTTCCGAGCAGACCCGTAGCGACTGCTGT12.083333333333333No Hit
GATAAAACTCTGTTAGCGAGGCCCAGTCGCGTGTCGCTTCTAAACAACACAGGATCGCGGCGTTGTGCACTGTGT12.083333333333333No Hit
GAACCGAGGGAGTCTGAATCGCGCACGAGGCGATGTTCAGTGCGATGATACCAATCTGAATATCACAACTCTCCG12.083333333333333No Hit
ACCACACACCATCCAGGATGAGAGGGTCAGAAGTCAAAGGTCCAAGCTGCAGGAGCTGTCTCTTATACACATCTG12.083333333333333No Hit
GGTCTGCTCGGAACCGAGCCTCTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACTCTGCGTTCTGTCTCTTATACACATCT12.083333333333333No Hit
ATCTTGGGCTGTGACAAAGTCACATGGTTCACACGGCAGGCATACTCATCTTTTTCAGTGGGGGTGAATTCAGTG12.083333333333333No Hit
GGGTCGGAGAGTCAAAGCGCCGCGTGCGGTAGTACTCAGCCAACTTTCCTCTGAGTTAATCACTTGAGAGGCTCC12.083333333333333No Hit
CCACCCCGGCCGGCCGCCCATAGCCAGCCCTCCGTCACCTCTTCACCGCACCCTCGGACTGCCCCAAGGCCCCCG12.083333333333333No Hit
GCACGCTTCCGAGCGTCTGACATTCGGCGTGGTGGGGATGTAGTGAGCGTAGAAACCTCTCACTATTACACATCT12.083333333333333No Hit
GTGCTGGGGGGTTGGAGACACCACCCCCTTCTGCTGCCCTCCTCTGGGCTCCAGGAAGGAGAGCCTGTCTCTTAT12.083333333333333No Hit
CGCCAGAAAGGAAGTAGAATTACTGAAAATTTCATATGACTTCATCACCACTCACTAAAAAAAAGAAGACGATGA12.083333333333333No Hit
CGTAGCGACTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGATATGCAG12.083333333333333No Hit
GCCCAGCCTTTAGGGAGTTGTAATCATTTTGCTGCTGGAGGGCCTTGCCTCCACGTGGATGGTTGCTGACTGATC12.083333333333333No Hit
GGTCTTGGATGTCGGGTTCGACCACTTGGCCGATGGGAATGGTCTGTCACAGTCTGCTCCTTTTTTTTGTCCGCC12.083333333333333No Hit
GCACCAGGCGTTACATCTAGTGTTTCCTCTTCTCCTCTACTGGAGAGGGAAGAAGGAGATACTTTGCGAGAGGCA12.083333333333333No Hit
CCTAAAACCTTATTTTAGAAAATTGATCAAGTAACATGTTGCATGTGGCTTACTCTGGATATATCTAAGCCCTTC12.083333333333333No Hit
GATACGCATCTACTTTTTCTGGAGCCCTCTTTCAAGTCCTTGTTTATACAGGAAGCAACATGGCACTGGCTCTGG12.083333333333333No Hit
CCGAAAGACAAAGGCTCAATTCCAAGAAGACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGGTGTGGGTCTTGTCGCAGCTCTTGCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCC12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGAGGCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGAC12.083333333333333No Hit
GGGTTACCCGCGCCTGCCGGCGTAGGGTAGGCACACGCTGAGCCAGTCAGTGTAGCGCGCGTGCAGCCCCGGACC12.083333333333333No Hit
AGCCTCTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTGTACACATCTGACGCTGCCGA12.083333333333333No Hit
CCCTGCGGCTGCCTCTGCTGCCCCTGGAGTTTGGGAGCAGCTTCCTCACCCAAACCCACTCCTGCTCTGGTGGCC12.083333333333333No Hit
CTGCAGCCTAGACCTTCTGCATTCAAGTGATCCTCCCATTTCAGCCCTGCAAGTAGCTGGGACTACAAGTGAGCA12.083333333333333No Hit
GTATGAACCGAGAGTACCAGGGGGGGGGGCCGGAAAGACAGAGGCTCGGTTCCGAGCCTGTCTCTTATACACATC12.083333333333333No Hit
AGATATTGGTCGTGAGTGAACTAAGAGGTAGTGCCCGCATGTACTCTGCGTTGAAAAAATCTCTAATAACCCAAA12.083333333333333No Hit
CAGCATCAAGGCGCCCAGGATACATCTGATTTAATGTCACCTAGCAAACGTAGCTCTCAGAAGTACATAATAGAA12.083333333333333No Hit
CCCCTGGAAGCAGAGAGACCCATGTACTCTGCGTTGATACCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGATA12.083333333333333No Hit
GACTGCGGTGAGAGTAACGGCCTCGACGGCATCAAGTCAGCCAAGATACGAGTCTGTTATACAGATCTCTGCGTC12.083333333333333No Hit
CTAGTACTCAGGGGAAGGCTGAGCCCCATGGGGGTCGACTGTTTGCTGCACAGCTCCTGTCTCTTATACACATCT12.083333333333333No Hit
AATCTAAATCACACCGGATTTATCAGACTCTATGTGAATATCATCAAGCCAGTGAACTTGTCATCGTAGTTTCAA12.083333333333333No Hit
GTTGTGCAGAATGACCCGCAGCCGCTCGCCGTGTTTGAAGTGCACCGGCGTGGACTTTCCGAACTCCAGCCCGTC12.083333333333333No Hit
CATCTTAGCTGTGGATCTCCAATACCTGCTGGTAACAGCGCCACAGAGGCTGGGCCTCTAGGAGCAGAGGACACA12.083333333333333No Hit
GGCTAAACTTAGCAGCACCAACACGGTTCTTTCATCAAGGCGTAGCTCATCATTTCTCCAAACTGACATGCTACA12.083333333333333No Hit
TATCAACGCAGAGTACATGGGAGGTTACAAGTTCCAGACTATCTCTGTGTGAATTGTGGTGAGATTTTGTGCTGT12.083333333333333No Hit
GTGCTGCTCAGCTGGCCCTGTTAGAGAACATGGGAACCACATCAAAATCCTAAGTCACAAAACAAGGGCTCTGTC12.083333333333333No Hit
TGCAGGAACAATGGCAAGCCTTTAGTCGGATCGGGAGCAGCAATGGGCACCTCACTGGATCAGGAGCACAGAGGA12.083333333333333No Hit
ACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGACAGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACT12.083333333333333No Hit
CATAGAGGGCTGCGTCACTTCTGGGGCCTTCGTGTCCGAGGCCAGCACACCAAGACCACTGGCCGCCGTGGCCGC12.083333333333333No Hit
GTACATGGGGCCTTTCGTTGCCTGATCGCCGCCATCATGGGTCGCATGCATGCTCCCGGGAAGGGCCTGTCCCAG12.083333333333333No Hit
CCCAGAGTACAGCCACCACGGCTGGGCACACTGGTGAAGCCCTGGCAGCGGGGGAAGTAGAAGACGGTGCTCCCA12.083333333333333No Hit
GTGACATGGGTGGGCCCTGCCCCTCCTCAGGCAGCCAGCTCAGCCATGGCCCTGTCCAAGGGGTCCACAGACCAG12.083333333333333No Hit
GTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGAGGCTCGGTTCCGAGCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACG12.083333333333333No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGAGGCTCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGA12.083333333333333No Hit
GTCCAGTATTGTTATTTTTCGTCACTACATCCCCGCGTCGGGAGTCGGTAATTTGCGCGCCTGATGCCTTCCTTG12.083333333333333No Hit
GTTCCTAACACCTCAACTGCAAAGGGCTTCCTATTTCTCTCAAACTGAGACCTACATTGCATTGGTGCTACAGAT12.083333333333333No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)