FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00002296241

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002296241
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTATCAACGCAGAGTACATGGGGATTCCTGAAGCTGACAGCATTCGGGCCGAGATGTTTCGCTCCGTGGCCTTAG14.166666666666666No Hit
CCCCGGGTCGGGAGTGGGTAATTTGCGCGCCTGCTGCCTTCCTTGGATGTGGTAGCCGTTTCTCAGGCTCCCTCT14.166666666666666No Hit
TCTCTCGGACTCGCGGCGTCGCTGTCGAACCTCACGAACTGCGTGTCGTCCACGTAGCCCACTGCTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
GTTTAATTTTGGCAAAGAAAAGTTTGAAGTCAAAAAAGGTGATCGAATTGCACAGCTCATTTGCGAACGGATTTT14.166666666666666No Hit
GGAATGGATGATTGCGGGAGAAAAAGAATCTCGGAAAAGAGTCGGGAGGGAACTAGGAGGGAGTGGCCAGAAGGA14.166666666666666No Hit
GGCAATTTATTAACAGAAAATATTTTGAGGAATCTTGTTCACAGACGGCGACCACGGCGACCCCCCTTCCTGCGA14.166666666666666No Hit
GGCTTGTAGTACAGCTACAGCTTCATCAACCTTAGAACGGAGTGACTCTGGAGACTCGAGCATATGAAGAACTGT14.166666666666666No Hit
CCTCTGCTGACTGTGGCCACCGCCCTGATGCTGCCCGTGAAGCCCCCCGGCTCCTGGGGCTGTCTCTTATACACA14.166666666666666No Hit
CGCCACTACTTTCGGAATCTCGGTTGATGTCTTTTCCTCGAGCTACTGAGATGTTCCCATGTACTCTGCGTTGAT14.166666666666666No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACATGGGCTGTGTGTGATAGAGCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACATC14.166666666666666No Hit
CTTCTAACCAAACTAATTTTTCACTGTTGACAAGCGAGGCAAGGGTTGCACTGGACCAAAGGCTGAGGCTTGGCC14.166666666666666No Hit
GAAAAAACATCCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAACACAAAAAGAAAAGA14.166666666666666No Hit
CTGTTGAATTAACCCCTTCAGCGCCGAGGACGCCGCGGAGCCCCCGTGGGCAGCCATCTTACCGCCGCCGCCCCA14.166666666666666No Hit
GTCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTGGCTGCCACCCAACAACAGA14.166666666666666No Hit
GCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCCCCCCGCCCCAAGTAATGGGGTGTGATTTTA14.166666666666666No Hit
CCGCCAGGCACACGAGCACACTCTACAAATCTCGGGGCCCACCGCATCAAGGAGACAGAAAGAAGCAAACAAAGG14.166666666666666No Hit
CCTCAAAACCTACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATAAACACACAAAAAAAAAAAAA14.166666666666666No Hit
CTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACTCTGCGTTGATACCCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACATCT14.166666666666666No Hit
GCTTTTCACCAAGGAGCCCTACCTGGATGAGCAGAGAGCTGTGAAATATCTTTGGCTTGCAGCCAACAATGGGGG14.166666666666666No Hit
CCCTCCACCCATGTGCTCCTCACCCACACCATCAGCCGCATCGCCGTCTCCTACCAGACCAAGGTCAACCTCCTC14.166666666666666No Hit
CATTCAGGTGCCTTTGCAGAAAGAGATGCCAGAGGCTCTTGAAGTCACAAAGGGGAGGCGTGAAGAAATCCTGCA14.166666666666666No Hit
GTACTCGTCAGTGTAAATCTCTTGAATTTACACCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGAGACATCTCAGG14.166666666666666No Hit
GCCTCTGTCTTTCGGCCTCCTCCCCATGTACTCTGCGTTGATACCCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACG14.166666666666666No Hit
CGGCCGGTACAGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATGGTTCCTTTGGTCGCTCGCTCCCTGTCTCTT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)