FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00002296242

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002296242
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length75
%GC49

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CTCTATCACACACAGCCCATGTACTCTGCGTTGATACCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAATAG14.166666666666666No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAATAGA14.166666666666666No Hit
CAGCTAAGGCCACGGAGCGAAACATCTCGGCCCGAATGCTGTCAGCTTCAGGAATCCCCATGTACTCTGCGTTGA14.166666666666666No Hit
GAGTACATGGGGCGGCGGCGGTAAGATGGCTGCCCACGGGGGCTCCGCGGCGTCCTCGGCGCTGAAGGGGTTAAT14.166666666666666No Hit
ACCATGGTGACCACGGGTGACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCC14.166666666666666No Hit
CAACGAAGGCTACAGGAAACACTCAGGCCAGTTATAGCAAACCTGGGAGTCGGGCTCCTATGTTGCCCCCATTGT14.166666666666666No Hit
GGGGTGTCATCGGAGCGGGCAATTTTATTTTATTTTGTTTTTTTGTGTTTTTTTGGGGCAGAGTGTAGAAAAATT14.166666666666666No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGAACATCTCAGTAGCTCGAGGAAAAGACATCAACCGAGATTCCGAAAGTAGTGG14.166666666666666No Hit
GATGAAGGCCACGCTGGAGGATGAGAGCATCTTGTTTGCAGCAACAGACATGGGGCAGAGGTGAGGCATCCTCTC14.166666666666666No Hit
GTGTTTGTTTATGAGGGCATGAGGACAAACTTCTAAATTCATTCCTCTTTTAGACAATGATCATCCATCCATCAC14.166666666666666No Hit
CATAAGGTCCTTCCTTTGTTTGCTTCTTTCTGTCTCCTTGATGCGGTGGGCCCCGAGATTTGTAGAGTGTGCTCG14.166666666666666No Hit
TAAAAAATCCGTTCGCAAATGAGCTGTGCAATTCGATCACCTTTTTTGACTTCAAACTTTTCTTTGCCAAAATTA14.166666666666666No Hit
CAGCTTGAAAAGCCTGAGACAGCTGTCTTGTGAGGGACTGAGATGCAGGATTTCTTCACGCCTCCCCTTTGTGAC14.166666666666666No Hit
CAAAATACATAAAAAAAAATACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA14.166666666666666No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACATTTTTATTATTAATAAATAAATATTATCGGATCCGAGACAGGCTCTTATAAAAAAC14.166666666666666No Hit
CCCCAGGAGCCGGGGGGCTTCACGGGCAGCATCAGGGCGGTGGCCACAGTCAGCAGAGGCTGTCTCTTATACACA14.166666666666666No Hit
CCCCCATCCCCTCTGACAGCACTCGCAGGAAGGGGGGTCGCCGTGGTCGCCGTCTGTGAACAAGATTCCTCAAAA14.166666666666666No Hit
GTGTAAATTCAAGAGATTTACACTGACGAGTACCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGACGAATAGAGAGG14.166666666666666No Hit
CAGTGGGCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGAGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGACTGTCTCTTAT14.166666666666666No Hit
TTCTTCATATGCTCGAGTCTCCAGAGTCACTCCGTTCTAAGGTTGATGAAGCTGTAGCTGTACTACAAGCCCTGT14.166666666666666No Hit
GGTATCAACGCAGAGTACATGGGGAGGAGGCCGAAAGACAGAGGCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGA14.166666666666666No Hit
GCTTATAGGAAACAATTTTGTATGGAATGCTAGATGGCCAAGCCTCAGCCTTTGGTCCAGTGCAACCCTTGCCTC14.166666666666666No Hit
CTGGGGTCTCCCTCTGGCAGGGGCTCTTGATGGCAGAGAGGAGGTTGACCTTGGTCTGGTAGGAGACGGCGATGC14.166666666666666No Hit
GGAGCGAGCGACCAAAGGAACCATAACTGATTTAATGAGCCATTCGCAGTTTCACTGTACCGGCCGCTGTCTCTT14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)