FastQCFastQC Report
Mon 12 Sep 2022
EGAF00002300366

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002300366
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences3780065
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length101-126
%GC57

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGT175290.4637221846714276No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGG166210.4397014337055051No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGT143940.38078710286727874No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGT119150.31520621999886245No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGG101820.26936044750553234No Hit
GTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT96600.2555511611572817No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT90610.23970487279980635No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTG86890.22986377218381168No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGT83710.2214512184314291No Hit
GTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT82000.21692748669665732No Hit
GTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT80000.21163657238698277No Hit
CTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTGGAAGCGGCCCCCGCAGACGCTCGG79580.2105254803819511No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG77190.20420283778189No Hit
GTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG72980.19306546316002504No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGG71810.1899702782888654No Hit
GTCCACGTCAAGAGCCAAGCCAAGGTACTGTTCCTCCAATGAGTAAACAG70880.18751000313486674No Hit
CCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGT69580.18407090883357824No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGG67010.17727208394564645No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGT65770.17399171707364822No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTG65360.1729070796401649No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGG63890.16901825762255412No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG63700.16851562076313503No Hit
TGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTC62590.16557916332126563No Hit
CCCACGTCAAGAGAAAAGCCAACATGTTTTTCCTCCAATGCATAAAAGGA61350.1622987964492674No Hit
GTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGG58770.1554735169897872No Hit
GTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCTTG56320.14899214696043586No Hit
GGTGTCTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTGGAAGCGGCCCCCGCAGACG54360.14380705093695478No Hit
GGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCG52950.1400769563486342No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGT50570.13378076832012148No Hit
GTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG49500.13095012916444557No Hit
GTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT49500.13095012916444557No Hit
CTGCTGAGGGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAA49110.12991840087405904No Hit
CCTTCTTTGATCTTCTTCCCCTTCTTTTCTTCCCCTTCCCCTTCTTTTCA49040.12973321887322042No Hit
GTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT49030.12970676430167208No Hit
GGGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCT48670.12875439972593064No Hit
CTTCTTTGATCTTCTTCCCCTTCTTTTCTTCCCCTTCCCCTTCTTTTCAA46210.12224657512503093No Hit
TGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCG45070.1192307539685164No Hit
GGCAGAGGTTGTGCTGGTTGTAGGAGCAGAGGTTGTGCTGGTGGTGGGAA44880.11872811710909734No Hit
GTCTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTGGAAGCGGCCCCCGCAGACGCTC44270.11711438824464658No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT43950.11626784195509865No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG43090.1139927488019386No Hit
GTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGT43010.1137811122295516No Hit
GTGGAAGCGGCCCCCGCAGACGCTCGGCAGGTGTCTTGATATTATCATCT42580.11264356565297158No Hit
GTCCTTTTTAATTCTGTCCACGTCAAGAGCCAAGCCAAGGTACTGTTCCT42570.1126171110814232No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT42530.11251129279522971No Hit
GTGGGAACAGGGCTGGGAGTAGTTCCAGGACCAGAGGTTGTGCTGGCTGT42110.11140020079019805No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGA41690.11028910878516639No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGCTGATGGG41680.11026265421361801No Hit
GATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGG41440.10962774449645707No Hit
GTGGGTTTTGATCTTCTTCCCCTTCTTTTCTTCCCCTTCTTCTTTCCTTC40430.10695583277007142No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGG38610.10214110074826756No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTG38380.10153264560265499No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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