FastQCFastQC Report
Tue 13 Sep 2022
EGAF00002300440

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002300440
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences14468780
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length126
%GC56

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGT555400.3838609751478701No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGT548150.3788501864013414No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGT534990.3697547408972975No Hit
GTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT497960.34416170540985486No Hit
GTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG491550.3397314770146481No Hit
GTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT487100.3366558894391925No Hit
GTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT442500.3058308993570985No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTG435660.3011034793534769No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGT432310.29878814938094295No Hit
GTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT413190.28557348995561477No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGG411650.28450912931152456No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGG387130.2675622961991267No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGG368570.2547346770080131No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGG350620.24232865521488334No Hit
GTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT334030.23086258827627487No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT321060.2218984599945538No Hit
GTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGG274000.18937325745501693No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTG272950.1886475570158645No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGT250460.17310374475249468No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGG242390.16752621852015168No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG234970.16239793541680778No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGT218420.1509595142092146No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCATGGTTGGGGTCTG201800.1394727129723446No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTG197570.13654917691747334No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGT194910.13471073580495382No Hit
GGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCG194760.13460706431364636No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT182700.12627187641252408No Hit
GTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTG170890.11810947433024761No Hit
GGCAGACGTTCGAATGGGTCGTCGCCGCCACGGGGGGCGTGCGATCGGCC169910.117432153920372No Hit
GTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCAGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT167440.11572503003017531No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTG152180.10517818364782656No Hit
GTGATGAGTACCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTCGGGGTTGG152080.10510906932028824No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGA145970.10088618390769644No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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