FastQCFastQC Report
Tue 13 Sep 2022
EGAF00002300528

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002300528
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences9113418
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length126
%GC56

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT339880.3729445966376172No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGT335070.367666664691557No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGT318970.35000040599476506No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGT292210.320637108931029No Hit
GTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT291910.32030792398636826No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGG288820.31691731905636283No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGT267310.29331475852418926No Hit
GTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT259880.28516194472809214No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGG254070.27878672963316287No Hit
GTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT237170.26024264441727574No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTG233360.2560619956200846No Hit
CTCAGACCGCGTTCTCTCCCTCTCACTCCCCAATACGGAGAGAAGAACGA211100.23163647272625923No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGG189770.2082314231608821No Hit
ACTCAGACCGCGTTCTCTCCCTCTCACTCCCCAATACGGAGAGAAGAACG178100.19542612881358012No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT176240.1933851821566837No Hit
GTAGGAATATGCAGGCGCAGACACGAGGCCCAGCTTCATCTTCAACGTTG169900.18642840699285385No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG168490.18488123775294846No Hit
GTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT165570.1816771709582508No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGG164020.17997638207750374No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG158330.17373284096043878No Hit
GTCATGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT154870.1699362412653518No Hit
GTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG145750.15992901894766595No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGT144840.1589304912821951No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG140140.15377326048251053No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTG134360.14743096388204732No Hit
GCCGGCTTCACGCTCAGGAGAAAACGCTACCTCTCTTCCTCGTGGTTTTC121520.13334184825056855No Hit
GTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGG120670.13240915757402985No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGT115320.12653869272758037No Hit
GGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCG106670.11704719348986296No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT105210.11544516009251414No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGT101570.11145104943063075No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGG100620.11040863043920512No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCATGGTTGG97620.10711678099259794No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGG96270.10563544874162471No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTG94350.10352866509579613No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCATGGTTGGGGTCTG92480.10147674560741096No Hit
GGGGAGGCTCCTTGGCGAATATTTGCATAAACTACCAGAGGGCTGGGGAA91890.10082934854957822No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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