FastQCFastQC Report
Fri 20 Jan 2023
EGAF00002373693

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002373693
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences344127911
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length150
%GC40

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAACATTG114863683.3378193493872113No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCCTAA111248683.232771200590004No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCCTAA78995662.2955319076109464No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAACATTG74368752.161078704249595No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTCA60187511.748986585397893No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTCA57818851.6801557837021828No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTCA56960181.6552037245243962No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAACGTGAT55939711.6255499252427683No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAACATTG51201111.4878511263795746No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCCTAA50983721.4815339985602038No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAACATTG49711131.4445538536977316No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTCA46405021.3484817277724386No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAACGTGAT38670601.1237275084031182No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAACATTG37717251.0960241466726017No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCACTGT37663411.0944596121411378No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAACGTGAT37485731.0892964157156086No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTCA36376031.0570496852259101No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAACGTGAT35365761.0276922873599752No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCCTAA31756180.9228016381385583No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCACTGT29357750.8531057511344962No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCACTGT21355590.620571285192848No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAACGTGAT20974610.6095004017270776No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGTCTAA20072590.5832886365325943No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCCTAA17932440.5210980983172853No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAATGTGAT16813060.4885700770723012No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCACTGT15683610.4557494320767257No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGTCTAA14936220.43403105422622923No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGTCTAA14133110.41069351099510204No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAATGTGAT13031280.37867547453888445No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAATGTGAT12770950.37111055487736944No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCACTGT11010160.3199438246088676No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAATGTGAT10866660.3157738635155345No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTTA10860000.31558033082646414No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGATGTTTTGAAACATTG10247060.2977689304602788No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTTA10158270.29518878519563035No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGTATTGATGCCTAA10145780.2948258387562176No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTTA9796350.284671765551734No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTTA8237040.23935983501204586No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGATGTTTTGAAACATTG8106520.2355670592496637No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGTATTGATGCCTAA7972860.2316830383455877No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGTCTAA7932420.2305078939092505No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCTTAA7925640.2303108741447014No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAATATTG7640330.22202006160436083No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATTACGTTTGAACGTGAT7592900.22064179502138667No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCACGTTTGAATGTGAT6912320.2008648464436818No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCACTTGAGTGGTTA6734500.1956975817634275No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACTACTGT6592780.1915793456230291No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCATGTTTGAACGTGAT6377860.18533399344059598No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGATCACTGT6347720.18445815631618442No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATAGTGGTTGACCACTGT6321650.18370058916842696No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATTACGTTTGAACGTGAT6275300.18235370626476152No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGTATTGATGCCTAA6221900.1808019576767198No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGTACTTGAGTGGTCA6136510.1783206128839692No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGTACTTGAGTGGTCA5879190.17084316069904598No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCTTAA5677280.16497586561643354No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCATTTGAGTGGTCA5581760.16220015353535217No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATTACGTTTGAACGTGAT5543690.16109387883972015No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAATATTG5540460.16100001839141725No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCATGTTTGAACGTGAT5401530.1569628567558997No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTTGGATTACTCGAGATCGGAAGAGCACA5201780.15115832903190465No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGATGTTTTGAAACATTG5165930.15011656523262945No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGCTTAA5106860.14840005232821699No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCATTGT5104310.14832595197429363No Hit
AATGAGCGTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCATTTGAGTGGTCA5078760.1475834954869441No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGTACTTGAGTGGTCA5067430.14725425744382586No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCATGTTTGAACGTGAT4884920.14195070623027728No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACTACTGT4717470.1370847829893112No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCATTTGAGTGGTCA4577490.13301710944335463No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGCATTGATGTCTAA4551060.13224908106916092No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACTACTGT4461970.12966021811581566No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATTACGTTTGAACGTGAT4389600.1275572210125089No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGATCACTGT4374290.12711232829934566No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGATGTTTTGAAACATTG4350010.12640677669414616No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGTACTTGAGTGGTCA4323640.12564049185769183No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAATATTG4272600.1241573224207321No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTCGATGTTTTGAAATATTG4212750.12241814352570779No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGATCACTGT4157290.12080653347528093No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGTACTTGAGTGGTCA4110890.11945819762349935No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATAGTGGTTGACCACTGT3962850.11515630884122037No Hit
TTCTGAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCATTTGAGTGGTCA3921030.11394106303687758No Hit
GGAATCTCTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCATTGT3910450.11363361921550154No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTATCATGTTTGAACGTGAT3828860.11126269847957784No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTTAGGTATTGATGCCTAA3655520.10622561795053002No Hit
CGAGTAATTTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTACAGTGGTTGACCATTGT3488800.10138090775205968No Hit
TCTCCGGATTGGTTATGTGTAGTGTATGATGTTGAGCATTTGAGTGGTCA3484380.10125246713859255No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)