FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00002877716

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002877716
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences378
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length71
%GC28

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA11931.48148148148148No Hit
GTTGACATCTGACCTGACATTTGCCTATGAACGTTTGTCACACTTCCGCTGTGAGTTGCTGAGGCGAGGTG338.73015873015873No Hit
CCGGATCACCTGTTTGAAACCATCTCCCAAGCCATGCTGAATGCTGTGGACCGGGATGCAGTGTCAGGCAT215.555555555555555No Hit
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GTTCCCTTTGGGTTCCATGTTTTCCTTGTTCCCTCCCATGCCTAGCTGGATTGCAGAGTTAAGTTTATGAT123.1746031746031744No Hit
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CAGGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGACCTGGGGCCCAGTCGGCCCTCAGAGCCCTTGCCCGCTCGGGT30.7936507936507936No Hit
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CAGGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGACCTGGGGCCCAGTCGGCCCTCAGAGCCCTTGCCCGCTCGGGG20.5291005291005291No Hit
GATTTCTAGATTATAATATTCTCCCACCAGTATTTTTTCTTAATAACCTTAACTGGAATACTTTTTTAAAA20.5291005291005291No Hit
ACACACTTATTTTTGCCTGTGTATGGAGAGATTCAAGAAATAATTTTAAAACCGCATACATAATAAAAGAC20.5291005291005291No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT20.5291005291005291No Hit
GCCTTGTGATTGTCCAAACTATCCCAAGAATAAATGTGTTCCAAATGGATTTGAAAACAAAAAAAAAAAAA20.5291005291005291No Hit
CCCGTAGTCCCAGCTACTCCGGGCTGAGCCAGGAGAATGGCATGAACCTCGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAG20.5291005291005291No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTT20.5291005291005291No Hit
ACCCATGTGAGGGAATAAACCTGGCACTAGGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.5291005291005291No Hit
GTTTCATGCCCATCGTCCTAGAATTAATTCCCCTAAAAATCTTTGAAATAGGGCCCGTATTTACCCTATAA10.26455026455026454No Hit
GTTCCATTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA10.26455026455026454No Hit
CAGGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGACCTTGGGCCCCGACGGCCCTAAGAGCCCATGCCCCCAGGGGG10.26455026455026454No Hit
CGACGCGGGGGACCACTTTGGTTTTATTTTTTTCGTGTGGCAGTTTTAAGTTATTAGTTTTTAAAATAAGT10.26455026455026454No Hit
TCTACAGCCTCTGCCCTGGTCGCATAAATTTTTATGTTTACTAAAACAATAAAATTAATGTTTAACAAAAA10.26455026455026454No Hit
GGCTAAAATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCC10.26455026455026454No Hit
GGAATGCCACAACCATGGGGCCCCCTGTGACCCTGGAGAGTGTCCCCGCTGTCGGGAATGCCACAGCCGCC10.26455026455026454No Hit
ACCCGAGATGGTGGGCAACATGGTGGGCGTCTACAACGGCAAGACCTTCAACCAGGTGGAGATCAAGCCCC10.26455026455026454No Hit
GGCTAAAATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCG10.26455026455026454No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAG10.26455026455026454No Hit
GGTTATGGTTTAATGTTACAACAACTATTTTTTAAGAAAAACAAGTTTTAGAAATTTGGTTTCAAGTGTAC10.26455026455026454No Hit
GTGGGGCTGGCCTTCCGGGCAGATGACACCTTTGAGGCCCTGTGCATCGAGCCGTTTTACCGCCCGCCAGC10.26455026455026454No Hit
GTTCCCTTTGGGTTCCATGTTTTCCTTGTTCCCTCCCATACCTAGCTGGATTGCAGAGTTAAGTTTATGAT10.26455026455026454No Hit
GTTGACATCTGCCCTGACATTTGCCTATGAACGTTTGTCACACTTCCGCTGTGAGTTGCTGAGGCGAGGTG10.26455026455026454No Hit
GTTCCCTTTGGGTTCCATGTTTTCCTTGTTCCCTCCCATGCCTAGCTGGATTGCAGAGTTAAGTTTATTAT10.26455026455026454No Hit
TTGCCGATCTGAGCGCTTGGCCAAGTACAACCAGCTCCTCAGAATTGAAGAGGAGCTGGGCAGCAAGGCTA10.26455026455026454No Hit
ATAAAGAACTGAACTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA10.26455026455026454No Hit
GCCTTACTACTAATAATTATTACATTTTGACTACCACAACTCAACGGCTACATAGAAAAATCCACCCCTTA10.26455026455026454No Hit
GGCTAAAATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAAAAATTACAAAAAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCG10.26455026455026454No Hit
GAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA10.26455026455026454No Hit
CGACGCGGGTGACCACGTTGGTGTTATTTTTTTGGTGTTGGAATTTTTAATTTTTATTTTTTTTAATAAAT10.26455026455026454No Hit
ACCCGAGATGGTGGGCAGCATGGTGGGCGTCTACAACGGCAAGACCTTCAACCAGGTGGAGATCAAGCCCG10.26455026455026454No Hit
GGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGCGACACCCACTCCTCCCCCTTTGACGCTGGGGCTGGCATTGCCCTCA10.26455026455026454No Hit
CCGGATCACATGTATGAAACCATCTCCCAAGCCATGCTGAATGCTGTGGACCGGCATGCAGTGTCAGGCAT10.26455026455026454No Hit
GTTGACATCTGACCTGACATTTGCCTATGAACGTTTGTCACACTTCCGCTGTGAGTTGCTGCGGCGAGGTG10.26455026455026454No Hit
GATTCATGCCCATAGTCATAGAATTAATTCCCATAAAAATCTTTAAAATATGTACCATATTTACCCTATAT10.26455026455026454No Hit
CTACTCTTGACAGCAGGATTGGATGTTGTGTATTGTGGTGTATTTTATTTTATTAAATTTTTTATGAAAAT10.26455026455026454No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA10.26455026455026454No Hit
GCCTTAGGATGCAGCATGCCTTCAGGAGACACTGCTGGACCTCAGCATTCCCTTGATATCAGTCCCCTTCA10.26455026455026454No Hit
AGATAGGATTGGGAAAGAAGTTGCTAAGTGTGCTTAGTTTTAATAAGTAATTCCTTCTCTTTTTTCAGAGA10.26455026455026454No Hit
TCCCTACACGACGCGGGAGTCCGAGTGGAGAGAGCGAGCTGAGTGGTTGTGTGGTCGCGTCTAGGAAACCC10.26455026455026454No Hit
TCTACAGCCTCTGCCCTGGTCGCATAAAATTTTCTTTTTAAACAAACAATAAAATGATTTTTTAACTAAAA10.26455026455026454No Hit
GTTGACATCTGACCTGACATTTGCCTATGAACGTTTGTCACACTTCCGCTGTGAGTTGCTGAGGCGGGGTG10.26455026455026454No Hit
TCATGAAGCCCCTTCCCACAAGGAAACCAGGAGGGAGACTGCGAGTGAGTGCCCGGGACCACCTCATCAGA10.26455026455026454No Hit
GTTTGTTCTTGGTGCCTTGCAGAGAGACTCACAGCAACTCTCCATTATAGCTTTCACACGGTTTGGATGTG10.26455026455026454No Hit
CTTGTTGATCAGTGTTGAAGAAAGTGCAAAAGGAACTTTTATATATTTGACAGTGTAGGAAATTGTCTATT10.26455026455026454No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAATAATA10.26455026455026454No Hit
CTTCAGGAGAAGCACGCCATGAAACAGGCCGTCATGGAAATGATGATTCAGAAGATTCAGCAGCTCACACC10.26455026455026454No Hit
TCTACAGCCTCTGCCCTGGTCGCATAAATTTGTCTGTGTACTCAAGCAATAAAATGATTGTTTAACAAAAA10.26455026455026454No Hit
CAGGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGACCTGGGGCCCAGTCGGCCCGCAGAGCCCTTGCCCGCGCGGGG10.26455026455026454No Hit
CAGGATCACCTGTTTGAAACCATCTCCCAAGCCATGCTGAATGCTGTGGACCGGGATGCAGTGTCAGTCAT10.26455026455026454No Hit
ATTATAATGCAAATACTTTTTAACTTAGAGGCAATGGAAAAATAAAAGTTGACTGTACTAAAAATGTAAAA10.26455026455026454No Hit
GTTCATTCCCTGCAGTGTCGGCATTGTAAATAAAGCCTGAGCACTTGCTGATGCGAGCAAAAAAAAAAAAA10.26455026455026454No Hit
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TCTACAGCCTCTGCCCTGGACGCAAAAAATTATCAGAATACTCAAGCAAAAAAAAAAATAATTAACAAAAA10.26455026455026454No Hit
GTCCCAGCTGCGCGTCGCCAAAGTGACAGGCGGTGCGGCCTCCAAGCTCTCTAAGATCCGAGTCGTCCGGG10.26455026455026454No Hit
ACTATAAGTAGTTGGTTTGTATGAGATGGTTAAAAAGGCCAAAGATAAAAGGTTTCTTTTTTTTTCCTTTT10.26455026455026454No Hit
CAGGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGCCCTGGGGCCCCGTCGGCCCGCAGAGCCCGTGCCCGCGCGGGG10.26455026455026454No Hit
ATTACCAGTATGTTAAGTAACACACTTATTTTTGCCTGTGTATGGAGAGATTCAAAAAATAATTTTAAAAC10.26455026455026454No Hit
ATAGGGGCCTTGTAATCCGATCTGAATGTTTCCTAGCGGATGTTTCTTTTCCAAAGTAAATCTGAGTTATT10.26455026455026454No Hit
CCGGATCACCAGTTTGAAACCATCTCCCAAGCCATGCTTAATGCAGTGGACCGGGATCCAGTGACACGCAT10.26455026455026454No Hit
CCGGATCACCTGTTAGAAACCATCTCCCAAGCCAAGCTGAATGCTGTGGACCGGGATGCAGTGTCAGGCAT10.26455026455026454No Hit
CAGGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGACCTGGGGCCCAGTCGGCCCTCAGAGCCCTTGCCCGCGCGGGT10.26455026455026454No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA10.26455026455026454No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATA10.26455026455026454No Hit
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CCCCAATGCCCAGCGGGCCTTTACTGATGATCCAAAGCAAAATTAACAATAGCCCATCCTCATCAAACCAC10.26455026455026454No Hit
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CTCAAATGAGATATCTATATCCCTACAACCTAATTGTATATTGAGCAGAAACTGAATTAATATGCTGCCTT10.26455026455026454No Hit
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GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG10.26455026455026454No Hit
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CAGGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGACCTGGGGCCCAGGCGGCCCGCAGAGCCCTTGCCCGCTCGGGG10.26455026455026454No Hit
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[OK]Adapter Content

Adapter graph