FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00002878750

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002878750
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences1705
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length71
%GC28

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA47027.56598240469208No Hit
CTCATGTACTTGAAAGTTATATGTATTATAACTTATGTTGTGAGAGCAGTATTTTACTAGATGAACAGTAT452.6392961876832843No Hit
GTACTCATGTACTTGAAAGTTATATGTATTATAACTTATGTTGTGAGAGCAGTATTTTACTAGATGAACAG372.1700879765395897No Hit
CGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCTTGGTTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA281.6422287390029326No Hit
CCTTTGAGGAAGTTTGTGCACACACTATTCCCTGTGCTTAGAACACCCTGGACTCTGAGTCAGATTGCCTG211.2316715542521994No Hit
CATGATCATTCTCAGTGAGGGCTCTGGATTGAGAGGGAGGCCCTGGGAGGAGAGAAGGGGGCAGAGTCTTC211.2316715542521994No Hit
GATCTATACTGTTGGAAAACGCTTCAAAGAGGCAAATAACTTCCTGTGGCCCTTCAAATTGTCTTCTCCAC191.1143695014662758No Hit
GGAATCCAATCTGTTGCAGTCTCCTTCAAGCATTCTGTCGATCCTGGATGTTGAATTGCCACCTGTTTGCT191.1143695014662758No Hit
GGCTGTCCTTTTTATAATGCAGAGTGAGAACTTTCCCTACCGTGTTTGATAAATGTTGTCCAGGTTCTATT191.1143695014662758No Hit
CCTAGTCTCCTGGTGTTTTCCATGGGCCTGCTCAGAACAAGCCCTGTTCTAGGAGCTGAGGCTACAAAGTT191.1143695014662758No Hit
GGAGCCTCAGCTTGAAGATGATGCTCAAGGTACTCTTCATGGACCACCATTCGCTGTTGGCAAGAAACGGC181.0557184750733137No Hit
ACTCCTAGAACTGATAAACAACTTCAGTAAGGTTTCAAGATAGAAAATTGACATACAAAAATCAGTAGCAT170.997067448680352No Hit
AGCAGGGGGATCATTCACAGTGAGGACAGACACAGGTGAACCTATGGGTCGTGGAACAAAAGTTATCCTAC160.9384164222873901No Hit
CCTCAGCTCGCCTGAAGGCAGGTCCCCTCTGACGCCTCCGGGAGCCCAGGTTTCCCAGAGTCCTTGGGACG160.9384164222873901No Hit
GGTTGAAGCCAAGGAAGAGTCGGAGGAGTCGGACGAGGATATGGGATTTGGTCTCTTTGACTAATCACCAA150.8797653958944283No Hit
CTGTACTGTTATTTAAGATGTAATAAAGCAGTTTGACATGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA150.8797653958944283No Hit
GAGTGCAATGGCGCGATCTTGGCTCACCACAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGC130.7624633431085044No Hit
CTACACGACGCGGGGCAGGAGGTTCTCACTGTTGTGAAGGTTGTAGACGTTGTGTAATGTGTTTTTATCTG130.7624633431085044No Hit
CGTCTCAAAGAACTTTTGACTGGAGAGAATCACAGATGTGAAATATTTGTCATAAATAAATAATGAAAACC110.6451612903225806No Hit
GGTTTGTACAGATGCATGCCACAGTAGATGTCCACATAATAAAATTCATAGTTACCAAAAAAAAAAAAAAA110.6451612903225806No Hit
GCCCTGCCCCCATGGGCTTTACCCTTCCCTGCGGGCTCTCTCCCCGACACATTTGTTAAAATCAAACCTGA110.6451612903225806No Hit
GTGGTAACGGGGCTGCTGGCCCTCAGCACTTTGGCCCTGTATGTCGCCGTTGTCAATGTGCACTCCTAGGC110.6451612903225806No Hit
GGATTATAGTGCCTTAACCGATATATTTTGTGACTTAAAAAATACATTTAAAACTGCTCTTCTGCTCTAGT110.6451612903225806No Hit
CCCTGGCAGCCCTTTTCATGTCACAGTGCCTTAAAACAGTTTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA100.5865102639296188No Hit
GGATAAGTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGC100.5865102639296188No Hit
GAGCTTGTTGGAGGGAAGGCATTATTTTTTAAAGTACTTAATAAATTAAATGAACACCAAAAAAAAAAAAA100.5865102639296188No Hit
GGTTTCAAAGCTGAAGTACATTGTCCTTAGCGGCTGTAACATGTCTCTTGACAGTAGTGCACTTGGAATAA100.5865102639296188No Hit
GTGTTGAATGGCTCTGCAAGACGTGTATCAGAGCTCATCAGAGGGTAAAGTTCACAAAAGACCACACTGTC90.5278592375366569No Hit
CTGTATATTTGTGATGCAATGGTCTTGTAAAGGTTTTTAATGAAAACTACCATTAGCCAGTCTTTCTTACT90.5278592375366569No Hit
GAATAGAGAAGATAGGGAAATTAGAAGATAAAAACATACTTTTAGAAGAAAAAAGATAAATTTAAACCTGA90.5278592375366569No Hit
GGCCAAGCTAGGAAGATCACTTGAGGCCAGGAATCCAGCACTAGCCTGAGCAAATAGCGAGACCACTATCT90.5278592375366569No Hit
GTTTCATGCCCATCGTCCTAGAATTAATTCCCCTAAAAATCTTTGAAATAGGGCCCGTATTTACCCTATAG80.46920821114369504No Hit
GGACACGAGCCACAAGCTGCACTGTGAACCTGGGCACTCCGCGCCGATGCCACCGGCCTGTGGGTCTCTGA80.46920821114369504No Hit
TTCCCTACACGACGCGGGAGGGGGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA80.46920821114369504No Hit
AATCTTACCAGATGCTACTGGACTTGAATGGTTAATAAAACTGCACAGTGCTGTTGGTGGCAAAAAAAAAA80.46920821114369504No Hit
GGACAGAATGGTGACTGGGTGCCCTTGGTGAGCTGTGTATTTCCTAGGAGGTAGAAAACTGTGGGAAACTG80.46920821114369504No Hit
GATTGAAATTTCACCTTGTAAGGAGGAAGTGAATGAAATAAAGGATCCCCCTAAGGAAAAAAAAAAAAAAA80.46920821114369504No Hit
CTTTGTAAGTAGATTCAAATTAGATAGTCAATAAAACATCTTGAAAATCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA70.41055718475073316No Hit
GACTTGCTGTATTTGCACTTTGAGCTCTTGAAATAAATGTGATTTTTGTGTGATTAAAAAAAAAAAAAAAA70.41055718475073316No Hit
TGTCTATGCTCCCTCTGTGTTAGAATTGGCTGAAGTGTTTTTGTGCAGCTGACTTTTCTGACCCATGTTCA70.41055718475073316No Hit
GGAAATAACATTGCACTTTATAAACACTGTATTGTAAGTGGAAAATGCAATGTCTTAAATAAAACTATTTA60.3519061583577713No Hit
GTCTTATTGGATTACACTTCAAGATTAAACCAATCTAGACTGAATATTGGTGTGGACATGGGGGGTGGGTG60.3519061583577713No Hit
CTTCAAGAGAATCAGCAAGAGAATTTAAACAAGTCTGCATTTCATATTATTTTAGTGTGTAAAATTAATGT60.3519061583577713No Hit
ATTTCTCTCCATTCCAGCCTAATAATTCAATAAGATCTAAATTCAGCTTTACTATTTTCTTTATAAAGTGC60.3519061583577713No Hit
CACTGTGTTCGCTCTAAACAAAACAGTGATAGGTTAATGTGTTCAGAAGTCGCTGTCCTTACTACTTTTGC60.3519061583577713No Hit
CCCCAGGTATCTTCCTAAAGCCGTGTCGGGACTGCAACCCGCCCTTCGATCCAGCTGGGGCCGGGCCCCAC60.3519061583577713No Hit
CTTTGAGTTGAGGAGAAAAAAAATATATATGTGGGTCCATTTATTAGGTTAAAGTTGACCCATTCAGTGTA60.3519061583577713No Hit
CCTCTGATGTTAAGATTTTATGTATAGCATAAGGAAGCTAGCTCTGACTATATTTTCCTAAGAATAAAGAC50.2932551319648094No Hit
CCTAGAATCTTTGTGCTCTCGCTGCAGTTCCCTTTGGGTTCCATGTTTTCCTTGTTCCCTCCCATGCCTAA50.2932551319648094No Hit
GCTGAACTGGGATGTGGAACTGTGGCGGGTGGAGAGGTCTGAATAAACCGTCTGTGTCATGAAAAAAAAAA50.2932551319648094No Hit
TCCTTTGACCCTGGTCTGAGCTGACTGCTGGAAGATGATCTTTCTGCACTGAGACTGTGGAGTTTGGGGAA40.23460410557184752No Hit
CATTTAAACTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA40.23460410557184752No Hit
TTGTAAAGCAATGTCTGCCTAGTTTATTGTCCAGTTAACTTTAGTGACCTTTTAAAAGTTGGCATTGTAAA40.23460410557184752No Hit
GCCACCTTCCTTCCCGATACAAAAGATGCAGATAGATGAAAGAGAAGAGTTCGGCCCGCGGCTGCCTCCCG40.23460410557184752No Hit
GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG40.23460410557184752No Hit
GGCTTTCGCTCTAAGATTAAAAATGCCCTAGCCCACTTCTTACCACAAGGCACACCTACACCCCTTATCCC40.23460410557184752No Hit
CAGTTTACTTTTGTTCAATAAAGTTTGTATGTTGCATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA40.23460410557184752No Hit
GCATAAAACACTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA40.23460410557184752No Hit
GCCTTCAGTCACTGGGGAAAGCAGGGAAGCAGTGTGAACTCTTTATTCACTCCCAGCCTGTCCTGTGGCCT40.23460410557184752No Hit
ACGCCACAAGGCATTATTATTCTATTAATTATTGTTATTATGATGATTATTGTTATTAATAATTATTGTTA40.23460410557184752No Hit
GAGTGCAATGGCGCGATCTTGGCTCACCACACCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGC40.23460410557184752No Hit
GTTGGAAGGTGACAATAAACTGGTGACAACTTTCAAAAACATCAAGTCTGTGACCGAACTCAACGGCGACA40.23460410557184752No Hit
ATGTATTTCTCTCCATTCCAGCCTAATAATTCAATAAGATCTAAATTCAGCTTTACTATTTTCTTTATAAA40.23460410557184752No Hit
GTTTGTGGAAGGGAGATATTCTGGGGAAAATGTGAGAAGGCGACCTTCCTAAGATCCCTTGATTCATAATA40.23460410557184752No Hit
GTATTTAATCATGATGTTTAATTTTGCACACTTATTTGTAATGTTTCTTTTAAATAAAAGTGACTAATTTT40.23460410557184752No Hit
GAAGGCTCAGTAATCATCAATCTTGTTGCAGTTAATTAACTTTTGACAAAACTATTCTGTGTGTCGTGGGT40.23460410557184752No Hit
GTGTTAAGTCTATGTATAATACTACTGTGAGTAAAAGTAATACTTTAATAATGTGGTACAAATTTTAAAGT40.23460410557184752No Hit
ATGTGACACCTCATAAAAGTGAGCTTTGAACTGTAGATAACTCTTAAAGAAAATGTCATTTTAGACAATTA30.17595307917888564No Hit
GGACAATCCTAAGCAAAAAGAACAAAGCTGGAGGTATCACGCTACCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCT30.17595307917888564No Hit
TCCCTACACGACGCGGGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
CTCAAGCACGACTAAGAGCCTTCTGAGCCCAGCGACTTCTGAAGGGCCCCTTGCAAAGTAATAGGGCTTCT30.17595307917888564No Hit
CTGGTGGATAAGTTCAATAAAGGTCATATCCCAAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
TTCCCTACACGACGCGGGTGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
GTACACCACCCTCCCCCAGCCAGATACGGAATAAAACTACAGACGCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
CTGTGTGTATGTATACATACATTTTCCAAAAAGAAAAATTAAATGATTATAGAGATTAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
GAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
CCATAAAGCACTCCTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
GAAGGCTCAGTAATCATCAATCTTGTTGCAGTTAATTAACTTTTGACAAAACTATTCTGTGTGTCGTGCTT30.17595307917888564No Hit
GGCTAAAGAACTTGCCACTAAACTGGGTTAAATGTACACTGTTGAGTTTTCTGTACATAAAAATAATTGAA30.17595307917888564No Hit
GCCTTGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCACCACGCCCAGCCTAACTGCCCAGTTTTTAA30.17595307917888564No Hit
TCCCTACACGACGCGGGGTAATAAAGTATATAATTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
ATCCACATGGAATCATTTATCGTCCTCTGTAATAAACTGGCCAAGATACTAAAGGCTTACTATTCATAAAA30.17595307917888564No Hit
GACATAAACCCAGTTGCCATCTGCGTGACAATAAAACATTAATGCTAACACTTTTTAAAAAAAAAAAAAAA30.17595307917888564No Hit
GTTTTAAGATTTGCTTGAGCAAACCTTTAACCATGGAAATTTGAAACAATGATTTCCAGGTTGAAATAATT30.17595307917888564No Hit
GGCTTACCTGTACACTGACTTGAGACCAGTTGAATAAAAGTGCACACCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
CTCTTTATTCACTCCCAGCCTGTCCTGTGGCCTGTCCCACTGTGTGCACTTGCTGTTTTCCCTGTCCACAT20.11730205278592376No Hit
AATAACCAGTTAAACCAGCTACTCAAGGCTGCTCACCATACGGCTCTAACAGATTAGGGGCTAAAACGATT20.11730205278592376No Hit
CCTCACAGTTGCCATGTAGACCCCTTGAAGAGGGGAGGGGCCTAGGGAGCCGCACCTTGTCATGTACCATC20.11730205278592376No Hit
GTTTTATATTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
CTGTATGGCTTATTTACAGTATTTTTAATTCTTAATAAACACTTGAGCTTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAA20.11730205278592376No Hit
GAGTGCAATGGCGCGATCTTGGCTCACCACCACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGC20.11730205278592376No Hit
GATCTATACTGTTGGAAAACGCTTCAAAGAGGCAAATAACTTCCTGTGGCCCTTCAAAGTGTCTTCTCCAC20.11730205278592376No Hit
GTGGAGATGCTGGCAACAGGGAGGACCAGATCAACAGGCTTATTAGAAGAATGAACTAAGGTGTCTACCAT20.11730205278592376No Hit
TTACTAAGTACCTTTTCTTATATTTGCTATAATCTGTATAAACTTATTGTCATACAATAAATCAATATTTT20.11730205278592376No Hit
CTTGCCAGTGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
CCCCAGGTATCTTCCTAAAGCCGTGTCGGGGCTGCAACCCGCCCTTCGATCCAGCTGGGGCCGGGCCCCAC20.11730205278592376No Hit
GGTTTGTGGCGCCTGTCATGGCAGGCATCTCATGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
GGGTTTGCATTTATCAGTCTGTTTTCCGATGATGTGTACATGAAAGAGTACACCATGTGAAGAGAAGATAA20.11730205278592376No Hit
ATATTATAGAAAATTATTTGTATGAATAATGAAAATAAAACACACCTCGTGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
TCCCTACACGACGCGGGAACGAGAGTCAAGCAGAATGCAGACTAGAAATGATACTAGTTTTACCTACCAAA20.11730205278592376No Hit
GCTCTCTAGGCCTCTCCAGTTTGCACCTGTCCCCACCCTCCACTCAGCTGTCCTGCAGCAAACACTCCACC20.11730205278592376No Hit
GTATTGGGCCTAATTGCAACACCAGTCTGTTTTTAACAGGTTCTATTACCCAGAACTTTTTTGTAAATGCG20.11730205278592376No Hit
ATCAGTGGGAGGCCCACATACTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
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AAATAAATTTCTTCTTCTGCTTTTTTCTTGGTAACCTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
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CCTCAGCTCGCCTGAAGGCAGGTCCCCTCTGCCGCCTCCGGGAGCCCAGGTTTCCCAGAGTCCTTGGGACG20.11730205278592376No Hit
CCCCAGGTATCTTCCTAAAGCCGTGTCGGGACTGCAACCCGCCCTTCGATCCAGCTGGGGCCGGGCCCCCC20.11730205278592376No Hit
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CCGTGCCACCTATCACACCCCATCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA20.11730205278592376No Hit
CTCCAGGGACCCGGCAGCCAGACAGACGGACAGGCGGACCGCTAGGGAGCTCAAGTACCCGGACACACGCA20.11730205278592376No Hit

[OK]Adapter Content

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