FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00002879230

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00002879230
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences1486
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length71
%GC35

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[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
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CCATTAACCTTCCCTCTACACTTATCATCTTCACAATTCTAATTCTACTGACTATCCTAGAAATCGCTGTC70.47106325706594887No Hit
CTCCCTAATTTATGTGCTATATAAATATGTCAGATGTACATAGAGATCTATTTTTTCTAAAACATTCCCCT60.4037685060565276No Hit
GCTATTCGCCGTTTGGCTCGGCGCGGTGGCGTCAAGCGCATTTCCGGTCTTATCTATGAGGAGACTCGAGG60.4037685060565276No Hit
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CTCCCCATGTTATGGCTGATCAGTCATCCACCAGGAACGAAGATTTCCTGAAGAAGACCTGGTCCCTCTGG60.4037685060565276No Hit
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GGGCTAAGGATTCTGTCTGCTGCTTTGTTTCTTCTAAGTAGGCATTTAGATCATTCCTGTAGGCTTCCTAT60.4037685060565276No Hit
CTTTTTAAATGAAGATACTTTATTGACATACTATTTATTAAGTCCTTTACTAAAGCATTAATCGGCTCCCT60.4037685060565276No Hit
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TCCTTCCCCTCAGGTAGCCTCTCTCCCCCTGGGCCACTCCCGGGGGTGAGGGGGTTACCCCTTCCCAGTGT50.3364737550471063No Hit
CCTTGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGTGTGAGACACCGTGCCCGGCTCCA50.3364737550471063No Hit
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GGTATACTACGGTCAATGCTCTGAAATCTGTGGAGCAAACCACAGTTTCATGCCCATCGTCCTAGAATTAA50.3364737550471063No Hit
TTTGAATGTTTTGCAAATGTATTGGTCCCTGTGTTGTATTTTGTAGCCTTTTCCTGGGCTTCAGCTCCCCT50.3364737550471063No Hit
TGTATTTGGTGTCTGCCATATCTTTGCATCCTTCAATGACACTTTTGTCCATGTCACTGATCTTTCTGGCA50.3364737550471063No Hit
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GTGTTCAGACACCCCATGCTCTCCTGCAGCTCAGGGCAGGTGACCCCATCCCCAGTAATATTAATCATCAC50.3364737550471063No Hit
GAAAAGAATAGAGAAGATAGGGAAATTAGAAGATAAAAACATACTTTTAGAAGAAAAAAGATAAATTTAAA40.2691790040376851No Hit
ATTTTAAGGGATTCCCTAATATGTATACTATCTTTTTATCTGAAGTAATAAATAAACAATGATCTTGAAAG40.2691790040376851No Hit
GCATTTGCAGTGACCTGGATGAGATTGGAGACTATTACTCTAAGTGAAGTAACTCAGGAATGGAAAACAAA40.2691790040376851No Hit
GTTATTAGTTTTTAAAATCAGTACTTTTTAATGGAAACAACTTGACCAAAAAATTGTCACAGAATTTTGAG40.2691790040376851No Hit
GGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACAGGGTGAAAACCCAGTCTTTACTAAAAAAACACAAAAAAAT40.2691790040376851No Hit
CAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA40.2691790040376851No Hit
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GTACTATATTTGCTAGACTCTAGACAAGATATTGTACATAAAAGAATTTTTTTGTCTTTAAATAGATACAA40.2691790040376851No Hit
GCTTAATATTTCTTCACTTGAATATTCTTATATTTTAGGCATATTCTATAAATTTAACTGTGTTGTTTCTT40.2691790040376851No Hit
AATTGGGCCAACTTTTAAAATGAAGATGCTTTTTAAAACTAATGAACTAAGATGTATAAATCTTAGTTTTT40.2691790040376851No Hit
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TATTAATCATCACTAGAACTTTTTGAGAGCCTTGTACACATCAGGCATCATGCTGGGCATTTTATATATGA40.2691790040376851No Hit
GCATTATTGTGTAGCCACGGTTTTCTGGAAAAGTTGATATTTTAGGAATTGTATTTCAGATCTTAAATAAA40.2691790040376851No Hit
GTATACTACGGTCAATGCTCTGAAATCTGTGGAGCAAACCACAGTTTCATGCCCATCGTCCTAGAATTAAT40.2691790040376851No Hit
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GTAGAGGAAATGGAAGTGGATGACTTCTATGATGGAATCAAACGGCTCTATAATGAAGATAATGTCTCAGA40.2691790040376851No Hit
CTTCCGATCTATTCGCGCGAATAGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTAGATCTCGGTGGTCGC40.2691790040376851Illumina Single End PCR Primer 1 (100% over 49bp)
TTTATTGTCTGAGTCTTTGTTCAGTCCTTGCTTTCCAATAATAAACTCAGGGGGACATGCTGCAAAAAAAA40.2691790040376851No Hit
TGACTCAGGCTGGGCACGGGGGCTCACGCCTGTCACCCCAGAGCTTTGGGAGGCCAAGGTGGGAGGATCGC40.2691790040376851No Hit
GTGCACCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAAGTGGGAGGATCAGTGGAGCCTCAGAGGTTGAGGCTG40.2691790040376851No Hit
ATATTGGCATATTGGTTGTTGAAAAATAAATTTCATCCTCACTTATGAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA40.2691790040376851No Hit
ACCCTATCTCATACATCTAAAGTAAAAGAATGTGCCAGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTT30.2018842530282638No Hit
CGCCACAGGGGCAAGAGGGTGGTTTTCCTGAAGCAGCTGGCTAGTGGCTTATTACTTGTGACTGGACCTCT30.2018842530282638No Hit
CCATACTAGTTATTATCGAAACCATCAGCCTACTCATTCAACCAATAGCCCTGGCCGTACGCCTAACCGCT30.2018842530282638No Hit
GGAGGAAATAGGACCAAGACCCCTGGACCTGGGGCCCAGTCGGCCCTCAGAGCCCTTGCCCGCTCGGGTAT30.2018842530282638No Hit
CTCCTGTTGCTTGAAATAATGATGATATAAAGGCTGGATTTGGAGTTTGTATCCCCTGGTCCCTCTGGGAT30.2018842530282638No Hit
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