FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003090007

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003090007
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences7480
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length43-617
%GC41

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATAGGGCTCCCTGGACCCA1491.9919786096256684No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTAGGAGCTGGAGGCAGAG1151.537433155080214No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGGAGAGAGTGAAGAAAC1111.4839572192513368No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGTAGTGAAAGTAGGAGGA1111.4839572192513368No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGCCTGTGGATCCCTAGC1091.4572192513368984No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGCCTTACTGAGGCTTGCT1081.4438502673796791No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGGGCTAATTGCGGGACT1041.3903743315508021No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGAGCTCTGTGCCCTATCT1011.3502673796791442No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGGAAGCTAGAAGAAACA1001.3368983957219251No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGGAACTGCTGTCTGCAT1001.3368983957219251No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAGGTGAGTCACAGGTTCAG971.2967914438502675No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAGTCTGCATGGAGCAGGA911.2165775401069518No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATCGCATCACCAATGCCTT901.2032085561497325No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAGTTGCTGTCCTGTCACT881.1764705882352942No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCTAACTCCTGGTGTCTCT881.1764705882352942No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAATCTTCCCCTTGACTTT871.1631016042780749No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACACCTGCGCATGTACACTCA871.1631016042780749No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAATCCCGTGGCCTAAAGAA871.1631016042780749No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATCCCACAGCATGACCTAC871.1631016042780749No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGGAGGCAAAAGAAAGGC851.1363636363636365No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATTCATGCGCCTTTCCATT841.1229946524064172No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAGTGTGTCACTCGTAATTA831.1096256684491979No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTCCAGAGGAGGAGTATGT831.1096256684491979No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAGCTCTGTCAAACATAAA811.0828877005347592No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAGGGAAAGGGCGTCATCAG811.0828877005347592No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGAATGTCTGTGGTTTGGT801.06951871657754No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACACGATGAACAATGACATCT801.06951871657754No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATCATGAGGGGAGGCAGCT801.06951871657754No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCCTTTTGCCTGCAGGAG791.0561497326203209No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTAGCCCACCCTGGATTAA781.0427807486631016No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCTCCCCACCAGACCATGA771.0294117647058822No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAGGCCTAATGATTATTTTT761.0160427807486632No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAAGGACCCATTAGAACCA730.9759358288770054No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATTTCTGTCCTTTGCAAGC730.9759358288770054No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAGCAAGGGATTGTGATTG720.9625668449197862No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAACAGCTTTTCCTCCATGA710.949197860962567No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCTTTTGCCTCCATCCTCA700.9358288770053476No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATCTGCGACATCCCTGGGA700.9358288770053476No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATAACTTGGGCTTTCTGAC690.9224598930481283No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAACATGCTACTTACCAGGT670.8957219251336899No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACACCATTTATGAACTCTCAA670.8957219251336899No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGCGCAAAGATTTAAAAA670.8957219251336899No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGGCGTTTCTAATAATGCC670.8957219251336899No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAGCCCTACTCAGGTTAATG670.8957219251336899No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTGTGCCTGCCTTAAGTAA660.8823529411764706No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGGCTGACCTAAAGCCACC650.8689839572192514No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAGCCATGAAACGAACCTT650.8689839572192514No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATAATCAGTGTGATTCGTG650.8689839572192514No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACACCATGGACACTGGATTAA650.8689839572192514No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGTGCATCAGTGGCTTTT650.8689839572192514No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCCAGTCAAGCATATTGA640.8556149732620321No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGGATCCTGGCTCCTTATC640.8556149732620321No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATTCTAGCAGTATCGACAA640.8556149732620321No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAGAAGGCGTACATTTGTC630.8422459893048129No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTATTTCCTCTGCCGTGTTT630.8422459893048129No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGTGGTTGTCATCAAGAAA630.8422459893048129No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAACATATGGCCAATAGCGT620.8288770053475937No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTACAAACCAGGATTCTAGC610.8155080213903744No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTGAGTAGACACAGCTTGA610.8155080213903744No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGCCCAGGCCTTTCTCCAC610.8155080213903744No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAGTGTCTGCCACATAGAA580.7754010695187166No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTATGGTGCTCTTCCCTCCT580.7754010695187166No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCATGAGAAAAGGTGGGCC570.7620320855614973No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTCCAAGCAAGGCAAACAC570.7620320855614973No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCACTATGGCTTAGCGTCT560.7486631016042781No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAACAAACAATAAAACCTTT550.7352941176470588No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAACAGGGATATTACCTACC540.7219251336898396No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTACAAAGCCTCAAATGTAA530.7085561497326204No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAAAGCCAAAGGAGGATGG530.7085561497326204No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACACCCGAATTTTGCTAATCC510.6818181818181818No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATCATGAAAATGGTCAGAG500.6684491978609626No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTATTCAGTTGCCTGAAGAG490.6550802139037433No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTTTCCCAAGGTCTCAGTG470.6283422459893049No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGGCATCTTTTGGTTTGC440.5882352941176471No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAGTGCCTTCCCATTGCCT430.5748663101604278No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTACGATACACGTCTGCAG430.5748663101604278No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGAAACTTGTTTTCCAAA430.5748663101604278No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAAACAGCAGATGGTCATA430.5748663101604278No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTGGTTAAGCATTTATGTG410.5481283422459894No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATTTCCCTGTCATACCCCC410.5481283422459894No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAGGGTTTAGTGACTATTG400.53475935828877No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAGCAGAACACTCTTTTCT400.53475935828877No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTTGTGTTACTAATGACTGT390.5213903743315508No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCTAGATTGACGCCTTTTG380.5080213903743316No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAGGTGCACTGTAATAATC380.5080213903743316No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTACTGTCGCAAACAAGACT360.4812834224598931No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAGATTCCATAGAGATATT340.45454545454545453No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTACCTTATTTCCCCCCATT290.3877005347593583No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAGGAAATGCTCTTATTAT290.3877005347593583No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATGGTTGCCACCTTGTTAC250.3342245989304813No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGGTTAAGCATTTATGTG230.3074866310160428No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAACAGGGATATTACAGTGC210.2807486631016043No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCAAAGCCTCAAATGTAA160.21390374331550802No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCAAACCAGGATTCTAGC160.21390374331550802No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGATTCCATAGAGATATT150.2005347593582888No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGCAGAACACTCTTTTCT150.2005347593582888No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGGTGCACTGTAATAATC140.18716577540106952No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGTGTTACTAATGACTGT140.18716577540106952No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGAGTAGACACAGCTTGA130.17379679144385027No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGGAAATGCTCTTATTAT120.16042780748663102No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCTTTCCTCTGCCGTGTTT120.16042780748663102No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTAGGTGCACTGTAATATCC120.16042780748663102No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCCTTATTTCCCCCCATT120.16042780748663102No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTACCTTATTTCCCCCATTT110.14705882352941177No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCCAAGCAAGGCAAACAC110.14705882352941177No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCTGTCGCAAACAAGACT100.1336898395721925No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCAGGAGCTGGAGGCAGAG100.1336898395721925No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCAGAGGAGGAGTATGTG100.1336898395721925No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAATCTTCCCCTTGACTGG100.1336898395721925No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACATTTGAGGCTTTGTAGACC90.12032085561497327No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCTTCCCAAGGTCTCAGTG90.12032085561497327No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCAACAGCAGATGGTCATA90.12032085561497327No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGGGTTTAGTGACTATTG80.10695187165775401No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCCCAGAGGAGGAGTATGT80.10695187165775401No Hit
ACTACTATGTACACTGACGACATGGTTCTACAAAGCCAAAGGAGGATGGA80.10695187165775401No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCAGCCCACCCTGGATTAA80.10695187165775401No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCTCCATGTAGAACCATGTCGTCAGTGTACATAGTAGT80.10695187165775401No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTCGTGCCTGCCTTAAGTAA80.10695187165775401No Hit
ACTACTATGTTACGGTAGCAGAGACTTGGTCTGTGTTACTAATGACTGTG80.10695187165775401No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)