FastQCFastQC Report
Sun 11 Sep 2022
EGAF00003249920

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003249920
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences2973986
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length101-126
%GC58

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[WARN]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGT161570.5432776078972799No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGG150440.5058530874052534No Hit
GGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGT130850.4399818963505544No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGT108800.36583897839465285No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGG95440.32091610384178No Hit
GTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT90090.3029267790769694No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT85720.2882326951101989No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTG77070.2591471513315799No Hit
GTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGT76140.2560200350640521No Hit
GTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT75810.25491041316267127No Hit
GTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT74770.25141342292801644No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG72710.24448669227091183No Hit
CTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTGGAAGCGGCCCCCGCAGACGCTCGG69440.23349134797541077No Hit
GTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG64050.21536752358619038No Hit
CCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGT63700.21419065187260464No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTG61970.20837354311688083No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGT60370.20299355814048886No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGG60160.20228743511233743No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG59900.20141318755367374No Hit
GGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGG59260.19926119356311697No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGG57800.19435195727215931No Hit
TGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTC57250.1925025874365246No Hit
GTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGG55830.18772785076997672No Hit
GGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCG48570.16331616893959822No Hit
GTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTG45900.15433831901024417No Hit
GTCGTTGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGT45840.15413656957362945No Hit
GTGGAGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT45800.15400206994921967No Hit
GGTGTCTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTGGAAGCGGCCCCCGCAGACG45140.151782826146458No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGT44610.15000070612302815No Hit
GGCAGAGGTTGTGCTGGTTGTAGGAGCAGAGGTTGTGCTGGTGGTGGGAA43090.14488972039545578No Hit
GTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCTTG43020.14465434605273864No Hit
TGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCG41550.13971148485567855No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGTGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT41330.13897173692142464No Hit
GGGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCT40700.13685336783697033No Hit
CTGCTGAGGGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAA40200.13517212253184782No Hit
GTGGGAACAGGGCTGGGAGTAGTTCCAGGACCAGAGGTTGTGCTGGCTGT40190.13513849762574537No Hit
GTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGT39980.13443237459759394No Hit
GTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGT39850.13399525081826208No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGA39330.1322467557009347No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGG38360.1289851398089971No Hit
GTGGAAGCGGCCCCCGCAGACGCTCGGCAGGTGTCTTGATATTATCATCT37880.12737114431607952No Hit
GTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGCTGATGGG36710.1234370303020929No Hit
GTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGG35440.11916666722708176No Hit
GTCCACGTCAAGAGCCAAGCCAAGGTACTGTTCCTCCAATGAGTAAACAG34960.11755267173416419No Hit
GTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTG34410.11570330189852945No Hit
GGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCGATGTTGGGGTCT34260.1151989283069927No Hit
GGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCAC33250.11180281279064529No Hit
GTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATG33050.1111303146685963No Hit
GTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTGGTGGTGGTGGTGATGGGTGTCAT31740.10672545196917538No Hit
GCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGTGATGGGTG31170.10480883232133575No Hit
GATGGGTGTCGATGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGG31040.1043717085420039No Hit
GGTGGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCTGACGCTCGGAAGGTGTCTT30870.10380008513826225No Hit
GTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGGGGTTGGGGTCACCGTAGTGGTGGTGGT30020.10094196811955403No Hit
GTGGTGGTGATGGGTGTCGGGGTTGGGGTCTGTGTGCCGGTGGGTGTTGG29970.10077384358904178No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

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