FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003619012

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003619012
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length71
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCCAGGAACTGGCTCTTGGCCGCGCTGGCGGCATCGGCGGCGCGCTTGGCTTCTGTCTCTTATACACATC13.3333333333333335No Hit
ATCCGAAAGTGCACGGAATCCTCGTGCAGTTGCCGTTGCCGGGGCATCTGAACTCGGAGCTGGTGATCAAC13.3333333333333335No Hit
GTGCTCTTGCCCGACCCCGACGCTCCGACGATCGCGGCCGATTCCTGCGGCGCGAGCGAGAAGTCGATATC13.3333333333333335No Hit
GGCCGACGCCGATCCATCCGCCGATCGCGCCGGCGCCGTAAATGCAGATCTTCATGAGCTCGGTCGCTTCG13.3333333333333335No Hit
CCCTCACACAGAATCCTGCACAGGTCGATGCGTTGATCTGGCAGCGGGCGCCGCATCCGTCGTGGCAAGAA13.3333333333333335No Hit
CGCCACCGGCACGCCGGTGCAGCCGGTGGCGCTGCGCTTCAGCGACAACCACGACGCGGTCAGCAAGGCCG13.3333333333333335No Hit
GAAATGGGAACGGGCATTCGCAGCGTGTTGCCCGTTGTGCTGGCCCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCC13.3333333333333335No Hit
ATACCAGGGCGGGCAGGTCCGGAGGCTGAATCTGCGGACCGGCGAGATGAAGGACATCCGGCCGCGCCCCG13.3333333333333335No Hit
CTGCTTGACATTCATCCGCCTGAATGGGTCGATTGGTTGTCCAGTTCTTTCTATGAAGAATTGTGCGAGTC13.3333333333333335No Hit
ATATAACTGCTTGAGGAACACTCTCGGTACCGCGCAAAAGATAGTTGTACTGAATTGGACGAGCAACGCGC13.3333333333333335No Hit
CGCCAGTGTGGGTGCGTCCCGCAAATATTTTTACCTTTTGAAGATGATCCACCTCACGAGGCGACGGCAAG13.3333333333333335No Hit
GGTCTACTTCCAGCCGCATTCGGCGCCGGGCGTCTACGCGCTGTCTCTTATACACATCTCCGAGCCCACGA13.3333333333333335No Hit
CTTTCGGCGGGACCTGCACCGAGACCTGGCTGTACCGGCCCAACCGGACCATGCTGGGCACCAGCGGCGAG13.3333333333333335No Hit
TTCTCGTACAATGCGAGTCGAGTCTCGACTTGATCGTACGGCTGTCTCGTATTCCTGTCTCTTATACACAT13.3333333333333335No Hit
CCGCTGGGGCGACCCGCTGTTCGCCGACTCCCCGGAGTTCGACATCGAGCACCAGACCGGTGCGTCGCAGG13.3333333333333335No Hit
TCAAGAGATTGCGGAAAAACCATAACCATTTGGTCATGTATCCTGATGAAAGCCCCGACATATCGGGGCTC13.3333333333333335No Hit
GCCGGAAGCAGCGCCGACCGTCGAAAGAGGAACGGACGCGGGCCGGCCCACAGTTGATTTGGCTCGAACTG13.3333333333333335No Hit
CGGTGACCGACTACTGCGCCATCCTGCCCTCGCTCATCTGCAGGCGGCTGACGCACGACCCCCGGCTGAAG13.3333333333333335No Hit
GAACGGGTCCTGGAACCCGAAGATGCCAAAGCTGACAATCTGGGGGATGAACAGCAGGACGAGCGCCCACT13.3333333333333335No Hit
GGTCTTGACCGTCACGGTGCGGGCAGCACGGCCGTCTTTAAGCAAACGGCGGTGCATAGCTTGCGCGGTCT13.3333333333333335No Hit
GTGTGTAGAAACCACGCATATATTCGGCGGCAACGCGTTTCGACTCTGGGGCTGAGTAGTCGGGCTGTCTC13.3333333333333335No Hit
ACACAGGCACGTTCCCTATCAGGCCGGCCAAGTAGGCGCCACGTGACAGGCCTGCCGCGCGAGCACCCGCT13.3333333333333335No Hit
TGATCGACCAGCGGCCGAAAGGCTGAAGCGCCCTCCGCGGTTTGCGCCGATCGAGGAACCCGCCGAGACGG13.3333333333333335No Hit
GTTCCTCGCCAATCTCGTCGGCCTGTCGATCGTGCGCGAACTCGGGCCGCTGATGACGGCGATCCTGGTCA13.3333333333333335No Hit
GCCATTTGGAGGTCGTTTGGTACTCGTACGGTTAACCGCGTAGCCCAACCTTTCTCTTTGCCTGTCTCTTA13.3333333333333335No Hit
GCATAGACGCCGGCTGTAGAACTGTTCGCCCCCCATTGACCGCCAGACCCGGCGGATGCGGTGAAGCGGCT13.3333333333333335No Hit
GCAGTCTTCCACTTGGTGACATAGTGCATGATCAGCCAGGGAAGCCCGATGAAGAGCATTCCGACGACAAA13.3333333333333335No Hit
ATTCAAAAACCAAGCGCCGTGTTCACGAAGCCGGTCCCCCTATGGACCTGCCGAAACTGGTCAGCGATACA13.3333333333333335No Hit
GGTTGCTGCTGTATGTGGCGTTACAACTGGATGAAGAGCGGTAGGTTATGCGTTAAGGTTGAGGCGGCGCT13.3333333333333335No Hit
AAGTCGCGCAGGCTGCCGGCGCTGATGCGACGCGGTCCGGACAGCCCGCTGGCCACGGCGCCGCCCAGCGT13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)