FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003619013

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003619013
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length71
%GC59

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ACGCCATTTCCACGGGAAAGCTGCCGAGGTCGACCGGGGCTGGCAGGATCTTCAGCCGGGGGTCGTGCGTC13.3333333333333335No Hit
CCGTCAAGCTGTCGATCCGAATGTCCGCGGAGGAGGCTCGCCAGCTCGCAGCGGGTGCTCGCGCGGCAGGC13.3333333333333335No Hit
AGATCACCGCCCGTGCCCGCGGGTTGCGGTCACGCGTCAGGTTCGCCGGTGGGGTGATCCGGTCCAGTGTT13.3333333333333335No Hit
GAAGATATCCTCGTACCAATTTTTGTCGTCGGAATGCTCTTCATCGGGCTTCCCTGGCTGATCATGCACTA13.3333333333333335No Hit
GCCTGCAAGGCTCGCCAGCATCATAGCTGTCTTTGGATTATCACGAATCGGATCTTCCAATTCTTCACTTA13.3333333333333335No Hit
GGCCTTGACCAGCGCCGCGGCGATCTCGCCCCGCAGCCGCTCGGCCAGCGCGCGGCGGTCCGCATGCTCGG13.3333333333333335No Hit
TCCGTACGGGCGTCATCAACTTCAACAACAACCTGCCGTTCCAGTTCGTCCAGGAAATTCAGATCAAAACC13.3333333333333335No Hit
GTGAACCGCAAGCGCAAGGCGGCCGATGACCTCTGGAAACGACGAGTGTCCCCTCCAGCTTCAGCCGCTTG13.3333333333333335No Hit
GCAGCTATACCATTATCGGCCAGACCGCGGCGGAGATGCTGGGCGTATCGCTGGATGACGTCATTGTGCGG13.3333333333333335No Hit
CTTTCATGATTTTTCTCCTATGGTTTAATTGGAACAAACCACTCGGTACAGCTAAGCTATCGGCAGTTGAA13.3333333333333335No Hit
GTCGTTGCCGCCGTCGGTAATGATGTTCAGGTAGTCGTTGTTGTAGCCGAACTGGGCGGCCTGCGACGCAC13.3333333333333335No Hit
TTTCCATCTCGAGCGCGCACTCAAAGAGGCGCGCTTGCCGTCGCCTCGTGAGGTGGATCATCTTCAAAAGG13.3333333333333335No Hit
GTCGACATCCTTCGCCGGGTCGATGCGGTTGATCACCAGCTCCGAGTTCAGATGCCCCGGCAACGGCAACT13.3333333333333335No Hit
AGCCCCGATATGTCGGGGCTTTCATCAGGATACATGACCAAATGGTTATGGTTTTTCCGCAATCTCTTGAC13.3333333333333335No Hit
CGCGTAAATAATCCCGAATTGACGGTTAACTCGGGCATTCCCCTCTCCCCTTCGGGCTGAGGGGAATGAGC13.3333333333333335No Hit
ACGCTGCAGCGCGCCTGCGAGATCCAGATGGCGACCTTCTCCATGGGCCAGGCCATCCCGGTGAGCGAGGA13.3333333333333335No Hit
AAGCCAAGCGCGCCGCCGATGCCGCCAGCGCGGCCAAGAGCCAGTTCCTGGCCCTGTCTCTTATACACATC13.3333333333333335No Hit
GGCCGAGCGTGCGCAGCGCGTCGACTTCTTCGTTGACCGTCATCGTGCCGAGCTCGGCGGCGTAGGCCGCA13.3333333333333335No Hit
CTTTCGACGGGAGCCGCGAAATATCAGGGAGTTACGCCGATGATCGGCGGTATTCGCAAGTTTGCCAAATC13.3333333333333335No Hit
CGGCGAACTGACGATCCTGCACGATATCGACTTCTCGCTCGCGCCGCAGGAATCGGCCGCGATCGTCGGAG13.3333333333333335No Hit
CGGGATCCGTCTCCGCGGGGCGCGGCCGGATGTCCTTCATCTCGCCGGTCCGCAGATTCAGCCTCCGGACC13.3333333333333335No Hit
GAATACGAGACAGCCGTACGATCAAGTCGAGACTCGACTCGCATTGTACGAGAACTGTCTCTTATACACAT13.3333333333333335No Hit
ATTTGTAGTCGCCGACGTAGAGGATATTCGAGGTGCCTTAGGATCCGTCGGCGCAGAGGTGCAACGCATGG13.3333333333333335No Hit
GAACTGGACAAAGCGGGTGCTTTGTTCACCCGGCCCCTCCAGCACCGCACCCGAGCAGTCCTTTTTGTCGT13.3333333333333335No Hit
GATTTGATTCCGTGTACACACAGCTCTACAAAAATGGTGTTCTGGTGCAGCGCGTTGCTCGTCCAATTCAG13.3333333333333335No Hit
GATGCTGGCGTTCGAGGCGCCGCATTTCGGCGCCCACGCGACGCTGGGCGGCGCCGTGGCCAGCGGGCTGT13.3333333333333335No Hit
CCCGACTACTCAGCCCCAGAGTCGAAACGCGTTGCCGCCGAATATATGCGTGGTTTCTACACACCTGTCTC13.3333333333333335No Hit
CGCGTAGACGCCCGGCGCCGAATGCGGCTGGAAGTAGACCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTGCCGAC13.3333333333333335No Hit
GCAAAGAGAAAGGTTGGGCTACGCGGTTAACCGTACGAGTACCAAACGACCTCCAAATGGCCTGTCTCTTA13.3333333333333335No Hit
GGCCAGCACAACGGGCAACACGCTGCGAATGCCCGTTCCCATTTCCTGTCTCTTATACACATCTGACGCTG13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)