FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003619758

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003619758
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC48

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AACACGGGAAACCTCACCCGGCCCGGACACGGACAGGATTGACAGATTGA33.125No Hit
ACCGTAGGCAGCCATGGCGCCCAGCCGGAATGGCATGGTCTTGAAGCCCC22.083333333333333No Hit
GCTCGGGGGTCGCGTAACTAGTTAGCATGCCAGAGTCTCGTTCGTTATCG22.083333333333333No Hit
CTATACAGGTGATATGCAGAAACCCCTACTGGGAAATCCATTTCATTAGT22.083333333333333No Hit
TAACAAGAGTAACATGTGTGAAAGCAGCAAAGAGGCACTGGCAGAAAACA22.083333333333333No Hit
CAAAATGGTTGGGACAATTGGCTGAGACGTTGATCAAGGCAGTTATGCCC22.083333333333333No Hit
ACAGTATATTTTGCTCCTCAACTCATTCTGTGTTAACCAAATTCTTAGAC22.083333333333333No Hit
GTTATGGAGTCTGGAAATCCAAGATAAGGGCTGGGCGCGGTGGCTCATGC22.083333333333333No Hit
GTCTTAGAATAAATCACCTCCGCTTTAAAAAAAAAAGATTGATTCTGCAT22.083333333333333No Hit
GTGGAGGGAAGGGAGCTATGAGTGTGTGTGTTGTGTATGGACTCACTCCC22.083333333333333No Hit
GCGCTCAACGAACCCACCATCGATTATGGTTTCCAGAGGTTACAGAAGGT11.0416666666666665No Hit
GTATTATGGAACAGAAGAGACCATTTTAAATAATTTTTTTAAACAGCCCA11.0416666666666665No Hit
CGCTATTGGAGCTGGAATTACCGCGGCTGCTGGCACCAGACTTGCCCTCC11.0416666666666665No Hit
CTTCTCCACAGTAGGCACTCCTGACTACATTGCTCCTGAGGTGTTCATGC11.0416666666666665No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCG11.0416666666666665No Hit
CGGTATCTGATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGATTAATGAAA11.0416666666666665No Hit
GCCTGGAGCTTGGTGCTGAGGAAAGGTGGAGGTGGAAGACGAGGGATGCA11.0416666666666665No Hit
TTCCCGTGTTGAGTCAAATTAAGCCGCAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCC11.0416666666666665No Hit
GAACGAGAGAAGGCAAACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCA11.0416666666666665No Hit
GTCCGTGTCCGGGCCGGGTGAGGTTTCCCGTGTTGAGTCAAATTAAGCCG11.0416666666666665No Hit
TCTCACATGTTACTATTAAAAACAAAGCTGCATTTGTGAAAAGATGTTAA11.0416666666666665No Hit
GCGCAAGACGGACCAGAGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAAT11.0416666666666665No Hit
GCCCACAGAGAGCCTCCACTAGAGTGATGCTAAGTGGAAATGTGAGGTGC11.0416666666666665No Hit
GTGCCAAGTGTGCCCAGGGCTGCATCTGCAAAGGGGCGTCGGACAAGTGC11.0416666666666665No Hit
GGCTGCCTGTCACTGCAGTCTTGATCAGCTTGTCAATTTGATACTTCAGC11.0416666666666665No Hit
CCACTGCACGCTAATTCTATGGTTTCTGAAAATGTGATACAGTCTACAGC11.0416666666666665No Hit
ATATTAGACAAAGTGGATAAAGACTGGCATTGACATCTTCCAAATAGCAA11.0416666666666665No Hit
ATTTCCTTGTATCTCAGAAAGATGATTTAGAAGTTGGCTTACAGGGTGGT11.0416666666666665No Hit
GTTTCACCCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTCGCACAATCCTGGCTCAC11.0416666666666665No Hit
TCTTTAATGATGAACTGTCGCCAAGTCAGCTGAAGTCATTGGCAACAGCA11.0416666666666665No Hit
GTCCTGCTTGTTTCCAAACACACCGCCATATGCTGTGAAATCCTCAATGC11.0416666666666665No Hit
GGAGATGCAGTGTCCCCCGGGGAATGCCTCCTGAGACTCCAGCGCCTGGA11.0416666666666665No Hit
ATTCCTAGCTGCGGTATCCAGGCGGCTCGGGCCTGCTTTGAACACTCTAA11.0416666666666665No Hit
AACAAATACATGTGATTATATTCTAAACTGTGACAATGCTATGAAGGAAA11.0416666666666665No Hit
CTAAGAAGTTGGGGGACGCCGACCGCTCGGGGGTCGCGTAACTAGTTAGC11.0416666666666665No Hit
CTTTAGGAAAGTGTAGAATTTCTGCTCTTTCTCTCCATTGACATCCCCTT11.0416666666666665No Hit
ATTATAACCCTACATTTTGTGCATAAAGTGTAAGTGAATAAGCATATCAA11.0416666666666665No Hit
AAACTCACCTGAGTTGTAAAAAACTCCAGTTGACACAAAATAGACTACGA11.0416666666666665No Hit
TTCATAGCTGAGCCCAGTATCAGCAACAGCATGCCCTCACCTGCTACTTT11.0416666666666665No Hit
GGAAAGTTACAGACTGTAAATAGAGTCGGGTAGGCTTGTGCCCTTCCTTA11.0416666666666665No Hit
CGCGGGGGGGATGCGTGCATTTATCAGATCAAAACCAACCCGGTCAGCCC11.0416666666666665No Hit
TTCACATCCAGCCTGGGAAGTACACAGGCGTCAAGGATGCTCATTTCAGA11.0416666666666665No Hit
CACTGACATCTAATTCTGTCTGTAATCTCTGAGCTTTGTTCTTCTCATCA11.0416666666666665No Hit
GTATTGAGCTGAAACAACAAAAAGCTGTGAAAATCAAAACAAAAGATTCT11.0416666666666665No Hit
TATCAACGCAGAGTACATGGGGGCCAGGCCCTGGCCGTGGCGAAAGAGCC11.0416666666666665No Hit
CTATAAATCTTCCCACTATTTTGCTACATAGACGGGTGTGCTCTTTTAGC11.0416666666666665No Hit
CATTTACACCAACCACCCAACTATCTATAAACCTAGCCATGGCCATCCCC11.0416666666666665No Hit
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT11.0416666666666665No Hit
CATCATGACAAATACGTCTCAACAGTCCTGCACTGAAGTTTTACTGGCAG11.0416666666666665No Hit
ATTTCTTTCAGAGTCTGTCCTTGCAGTGGCTGGAGATGAAGAAGTTATAA11.0416666666666665No Hit
GAACTACGACGGTATCTGATCGTCTTCGAACCTCCGACTTTCGTTCTTGA11.0416666666666665No Hit
ATCACAGGAATGGGACTGGTGGCTTTATAAGAAGAGGAAAAGAGAACTGA11.0416666666666665No Hit
GGGCCGAGTTCCTCAGTCCACAACCGATTCCTGGGAACTTGAGCAAGCCA11.0416666666666665No Hit
GTACATGTGCGTGGTCGCCTCGTTGAAGATCAGCGGCTGCGCCGCTAGCC11.0416666666666665No Hit
CTCTGAACGCGGCCAAGGTGCCGGCCGACACCGAGGTGGTTTGTGCTCCC11.0416666666666665No Hit
CAGCTGATGTCAGAGTTTGGTGGCAGTGGCACTGGTGGCTGGGTCCACGG11.0416666666666665No Hit
CCTTGTAGATGCTGTAGACGCCCGCGCCGATCAGCGTGGGAATGGCGAGG11.0416666666666665No Hit
ATCATCGCCTGTGGCTTTGACATCAACAAGACTTTCATATTCTCTGACCT11.0416666666666665No Hit
ATTTGACAAAGCATTCAAGAAACATCTGCAGACTAGTTTTAACAGACAAA11.0416666666666665No Hit
GCTTTCATCCATACATAGTATATAATCAAATGTGGCAAAATCTTCTTTGG11.0416666666666665No Hit
CATGAAATATTTCCTATAAAAATAATGCTATATGGTGTACTTTATTCAGT11.0416666666666665No Hit
TCTTTGCTGCGCTCGTCAGGGGTCAGACGTACGTACTGGCTCGTGAGCAT11.0416666666666665No Hit
GTACATGTGCGTGGTCGCCTCGTTGAAGATCAGCGGCTGCGCCGCGAGCC11.0416666666666665No Hit
CAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTATGATCTCAGCTC11.0416666666666665No Hit
CTCCCCCAGACTGAGGAAGAATGGATGTTTCATGGCATCCTCTGCGGAGA11.0416666666666665No Hit
ATAGTTAACTGATCCTGTTTGCTGATGTCCTTTTTATGTTCCACAGGTGA11.0416666666666665No Hit
GAGCTATCAATCTGTCAATCCTGTCCGTGTCCGGGCCGGGTGAGGTTTCC11.0416666666666665No Hit
CAGGACCCAGCTCAATGACAGCTTAAAGGAAATTCACCAAAAGGAGTTAA11.0416666666666665No Hit
CTACTTAAAGAGAAGCTTTGGTCAAGAATGGAATGAAATCGCAAAAAAAC11.0416666666666665No Hit
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGA11.0416666666666665No Hit
GGCTAGAATCCTGCCATGAGGGTGTCATGTCTCAGGAAGCTGGTTAATGT11.0416666666666665No Hit
ATCTAGAGTCACCAAAGCCGCCGGCGCCCGCCCCCCGGCCGGGGCCGGAG11.0416666666666665No Hit
ACTTGGACCTTGGGCCTGCCAGCATCATTCACCACCATAAAGGGCCAATG11.0416666666666665No Hit
TCCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTAACCTCAGCTGATCCACCCGCCTTGG11.0416666666666665No Hit
CCTCCATGGTGTGCCCCGGGGGCCCCGAAGAAAGAGTTCCAGACTCGCTG11.0416666666666665No Hit
GAGGCCGACTACCTGAGCTCGCACCTGACCGAGGGCCCACACCGCGTCGT11.0416666666666665No Hit
GCCAAGAGAATATCCGAACTTTAATTTCAGGAATTGAATGGGTTTGCTAG11.0416666666666665No Hit
GAAATACCTCCAGATGGAATAATGAACCCATGTTCATTTCACATTGCAAA11.0416666666666665No Hit
AGACGGACCAGAGCGAAAGCATTTGCCAAGAATGTTTTCATTAATCAAGA11.0416666666666665No Hit
AAACCGACCTGGATTACTCCGGTCTGAACTCAGATCACGTAGGACTTTAA11.0416666666666665No Hit
CCTCTTTTAGTTGATCTTTGCTTCCTGGGTGATTAACTTTAGGGTGATTT11.0416666666666665No Hit
GATTTCGACGATTTTGCCGCCGAAGTCGGCTTCGATGCGGTTGAACATTT11.0416666666666665No Hit
CTCCCACTTCAGCTTCTTGAGTAGCTGGGACTGTAGGCACAGACCGCCAC11.0416666666666665No Hit
CCTATTGCTCGGGCTGTAGTGCCCTCAAAACGTCAGCGTGTATCAGGAAA11.0416666666666665No Hit
ATTATAACCCTACATTTTGTGCATAAAGTGTAAGTGTATAAGCATATCAA11.0416666666666665No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)