FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003619759

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003619759
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences96
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC51

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCGTAGGGTAGGCACACGCTGAGCCAGTCAGTGTAGCGCGCGTGCAGCCC33.125No Hit
GCGCGCGCCTCGCGGCAGAGCGCGCCGCGCAAGTCTTCTTCCTCAAAGGA22.083333333333333No Hit
GATAAAGGTAGTTCTGCTGTGATATTTTATACAGATAGAAGCACAGGGCA22.083333333333333No Hit
ATTTAGGTTGTACAGATTGAAATTTAGTTGTTTCATTGGCTGTCTGAGGA22.083333333333333No Hit
CCTCACTACTCTCAAATCTGTTCTGGAGGTACTCTAGGTATACCTCAAAC22.083333333333333No Hit
TCCTGGGGAAGAGGATGAGTTTGGAGCGGTACTCCTTCAGCCGCTGCACG22.083333333333333No Hit
TCTATATACTGTCTATAAATACAGACTCACTTTAGATACAAAGACACAAT22.083333333333333No Hit
CCGGCGTGCTGGTCGACCTGCTGCCGCAGGTGCTGGAGGCGCTGGGCGCA22.083333333333333No Hit
GTATTGGCAGGAGGCAGAGACTCTGAAACGTGCTTCAAGATACATGCCAA22.083333333333333No Hit
GGATTCGAGTTGGCTGCTGGATTCATTTCCTGCAAGCAGGCCTGCAAGGT22.083333333333333No Hit
CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA22.083333333333333No Hit
GTTGCAGGCTGGTGCCTAAAGCTTTCCCAAGGGGGCGCTGCATGCTGCCA22.083333333333333No Hit
GACCGGCGATGCGGCGGCGTTATTCCCATGACCCGCCGAGCAGCTTCCGG22.083333333333333No Hit
GACTGGTCTTTCTATCTCTTGTACTACACTGAATTCACCCCCACTGAAAA22.083333333333333No Hit
ACACAGTTTAAAAGAAAATCTAGAAGAAACTCTGCAACTAGAAATAGAAA11.0416666666666665No Hit
GTTTTTCTTTCTTCTTTCACGGTATCGGCTTCTATGGCGAATGACAGTGG11.0416666666666665No Hit
GAAGATTCCACTGAGTGTTCTGGTGATGCCACACTGGGACTTGTGTTTAG11.0416666666666665No Hit
CCCAAGGCGCAGCGCCTGGCGCTGAACATCTTCATCGGCTTCCTGCCCGC11.0416666666666665No Hit
TGATTCACCAGGCCACTGACAACTGTCCTTGGGGCTATTTCTCCGACATC11.0416666666666665No Hit
GGCTGGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAA11.0416666666666665No Hit
ATGTCGCCTTTACGGACACTGAACGGTTGATCGGTGATGCCGCAAAGAAT11.0416666666666665No Hit
CTGCTAAGGCTACCGTTGAACAGCTAATGTTTGAAGAGAAGAACAAAGCT11.0416666666666665No Hit
TTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTA11.0416666666666665No Hit
GTACAAGGCCACCTTTTCGGCGTGGGTCAGCTGGGTCCAGCTTCCCTTCT11.0416666666666665No Hit
GAATAATGGAATAGGACCGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTCGGAACTGAG11.0416666666666665No Hit
GGGTGGGGGAGCCGGACAGGGGCCACAGGGTCTGTTTGCTGGTGGCTGCC11.0416666666666665No Hit
AAGCAGAGAAACCTAAAATAAGGGCAACTGCTGTATTCTATGAGTCTCGA11.0416666666666665No Hit
CTGTGCCTCCATGTCTTCATCTAAAAGAAAACATGCTGCCTAAATATTTT11.0416666666666665No Hit
TCTTTCATGTCTGCCACTTTGTCTAGCCACACTCCAAGACACGTCAGCCT11.0416666666666665No Hit
CATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGACCCGGGGA11.0416666666666665No Hit
CATGAAGACCCAGAGATGTAAGATCCCCTGCAACTGGAAGAAGCAATTTG11.0416666666666665No Hit
GTCCTGTCTCGGAAGATCTGTGGGAATGAGTTGCTGAAGGAGGGAGCAGC11.0416666666666665No Hit
GTCCCGACTCTAGCCGCCTCTTCAGCTCGCCATGGATCCCAACTGCTCCT11.0416666666666665No Hit
GTCCACAAGCACAGGGAGATGCGTGGGCTGACATCTGCAGGCCGAAAGAG11.0416666666666665No Hit
TGACATCAAAGCGGGCGACACCGTCTGCATCATCGAAGCCATGAAAATGT11.0416666666666665No Hit
GTAGGTGGCCTGCAGTAATGTTAGCGGTTAGGCGTACGGCCAGGGCTATT11.0416666666666665No Hit
GCAGAATGTGGATTTGGGGTAAGTGGTCTTGAAGGATTCATTTAGTCACC11.0416666666666665No Hit
CCTTCCGTCAATTCCTTTAAGTTTCAGCTTTGCAACCATACTCCCCCCGG11.0416666666666665No Hit
GGGGGGGGGGCGGTGTTGGTGGCTGGCATGGGTGCACGGTGATGGTCGTC11.0416666666666665No Hit
CTGTTTTGGAATATCTAACTTGGAGACGAAGGTCAGGCAGCCGCGGTCAT11.0416666666666665No Hit
ACTCCACACTGAGCAGTGGCTGGGGCAACTCCCGAATGAAGAGCTTCAGC11.0416666666666665No Hit
TCCTTTGGCAAACGCTCAGGGTCACCAGGGTGCCGAGGAATGACCTTCTG11.0416666666666665No Hit
CCTTATGGATTTGACCCACCTCATTCTGGACAAAGCCTCAGGAGGATCTC11.0416666666666665No Hit
GGCTTCAGAGGGAGGAGCTGCATTTCTGGGAGCCAGGCTGGCCCTCCTGT11.0416666666666665No Hit
GGCTAATACTTTTTCCAATTAGAAATAAAGGAGAAACCAAGGCACAGTGG11.0416666666666665No Hit
CTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGTAAGTACGCACGGCCGGTACAGTGAA11.0416666666666665No Hit
CGAGTACGGAGCCCTCACCATTGATGGGGAGGAGCACATCCCCTTCAAGC11.0416666666666665No Hit
CCAATGAAGTAGGGGAAGTAGGCAAGAGCGAAGCAGTTCCCGAAGTGAAA11.0416666666666665No Hit
CTACTATACTCAATTGATCCAATAACTTGACCAACGGAACAAGTTACCCT11.0416666666666665No Hit
TGGTAGGCACGGCGACTACCATCGAAAGTTGATAGGGCAGACGTTCGAAT11.0416666666666665No Hit
TATCAACGCAGAGTACATGGGAAGCAGTGGTATCAACGCAAAAAAAAAAA11.0416666666666665Clontech Universal Primer Mix Long (95% over 22bp)
ATTACAAACAAAGCTGCTATAAACATTTGAGTACGAATCTTTGTATAGAA11.0416666666666665No Hit
TGGCGGAACAGGCTACCAAGTCCGTGCTGTTTGTGTGTCTGGGTAACATT11.0416666666666665No Hit
ACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAACAGCAAGCATGCTGGCACACACCTGT11.0416666666666665No Hit
GGATTTATAGCGGCATTTTTCTGCTCCAATATGAAGCGCCCCACCATCCT11.0416666666666665No Hit
GGTCAGGGTTGTACATAAAAAATCCAGGTTTGTGGAAGTCGCGTTCTTTA11.0416666666666665No Hit
GATATGGCGGCGGTCGGTTTCCAGTTTCGTTTCCCCGGGACCTCTTGCCC11.0416666666666665No Hit
CTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCA11.0416666666666665No Hit
TCCTGCTGCTGCTCCTGCTTTCCTCTCTTCTCGCTTTAAATGATTGTTAG11.0416666666666665No Hit
CCTTACTACCAGACAACCTTAGCCAAACCATTTACCCAAATAAAGTATAG11.0416666666666665No Hit
AGCCAGAGTTTTCTCAAGAGCCAGCTTTGCTCAGCACACTCTCCTGGGCC11.0416666666666665No Hit
TAAGAGGGACGGCCGGGGGCATTCGTATTGCGCCGCTAGAGGTGAAATTC11.0416666666666665No Hit
CCTGTAATCCCAGCACTTAGGGAGGCCGAGGAGGGCAGATCACGAGGTCA11.0416666666666665No Hit
CTACACCTCTCTTTCTTCTTTTGTTGTTGGGGTCTGTGACTGCGGATATA11.0416666666666665No Hit
GACCGCAACACGGCCTTGGAGACGCTGCACCAGAATAGCATCACTCAAGT11.0416666666666665No Hit
GCACGGTATTCCAGCACAAGGATGTATGGTAATTTACAGATGCACTTCTT11.0416666666666665No Hit
TGTCCGGGCCGGGTGAGGTTTCCCGTGTTGCGTCAAATTAAGCCGCAGGC11.0416666666666665No Hit
TTATTCCCATGACCCGCCGGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGTCTTTGGGT11.0416666666666665No Hit
GTACATGGGGAGTGGAGGCTGAGGCTATGATGGCGGCCATGGCGACGACT11.0416666666666665No Hit
CTACATGGCCTCATCCTGCATGACTCGCCTGTCCCGGTCTCGTACAGCCT11.0416666666666665No Hit
GTCTTTGATCATGCCAGGGCTGATCTCCCCAGTAAAAGCCCCATTAGTCA11.0416666666666665No Hit
CCGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTTCGGAACTGAGGCCATGATTAAGAGGG11.0416666666666665No Hit
CTATTCTCCCCCACCCCCCCAAAAAACTTTTATGCTAGTCCTGCATTTCA11.0416666666666665No Hit
TTCAAAGCAGGCCCGAGCCGCCTGGATACCGCAGCTAGGAATAATGGAAT11.0416666666666665No Hit
GGCTATCGTAGTTTTCTGGGGTAGAAAATGTAGCCCATTTCTTGCCACCC11.0416666666666665No Hit
TTTCAATTTTTTCCAGGTTTTCCAGGAGAGAATCCACTTTTTGTTTTATC11.0416666666666665No Hit
GCCGGGAGCAACTTCTCCAGGGCCTTCTTCTGCTTCTCGGTGGCTGCAGC11.0416666666666665No Hit
ATCAGATACCGTCGTAGTTCCGACCATAAACGATGCCGACCGGCGATGCG11.0416666666666665No Hit
AGCAGACATAGAGGAAATAAAGAGTGGGAGGCTAAGCAAAGAACTGGATT11.0416666666666665No Hit
CATCTATATTTAGTGGCCCCGCCTGCAGCTCTTGAACCTGCTTCTCCAAG11.0416666666666665No Hit
CTCACGCCTATAATTCCAGCACATTCTGAGGCCAAAGTGGGTAGATCACT11.0416666666666665No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)