FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003620000

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003620000
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC62

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CGGCGACGCGGAGGACCCCGTCCGGGATCCGGTCGGCCAAGGACCCGAAG16.666666666666667No Hit
GAAGAACCGATTCTGGGTTTTTCTATTGTGAATGAAACCGGTGCGTACTT16.666666666666667No Hit
GCGTGCGCGTGGCCGCCAGGGCAAAGGCCAGACCCAGCAGCGTCGAACCA16.666666666666667No Hit
AGATTGAGCGCCACGACCTGATGCCACCACATGCTGGGCTGTCTCTTATA16.666666666666667No Hit
ACCCAGGAGGCTCTGGGCAGGCGTGCCTGAGTGGTCAGGTTGGGACGCTG16.666666666666667No Hit
AAGTGCAAATGATCAGGTTGTTGCAGCATTTTGCGTGACGGCTCGGGGAA16.666666666666667No Hit
ATGCCCAAGCTGCTGCGACAGCCGGTCACCTTCGCCAAGGGCCTCTATTC16.666666666666667No Hit
CTCCTCGCGCTGTGGTTCGTACCTGACAGACGTGTGCACACTGTCTCTTA16.666666666666667No Hit
TTCCTGGGCGACCACTTCGGTCATCCCTTTGCTCTTACGCAGCTCAACCA16.666666666666667No Hit
GTCGACTTCTTCGCTCTTTTTGCCGCTGTGCAGCGTGAACGTGGCCTCCG16.666666666666667No Hit
CTTTATGACGGCGGCATCTGCACCCGCATCGACTGCGTCTCGCTCGGCGT16.666666666666667No Hit
CTCCCGCCCGGTGAGGATCTCGTCCACTGCGGCGAACGGTCCGGTGAGGT16.666666666666667No Hit
TCTGGGAGGACCACTTCCTGCTGCAGCCGGCCACGGCCGAGCCCGGTTGA16.666666666666667No Hit
ATGTTGCACATCGGCAGGCTGACGACCGCGAGGCGGGCCTCCGCCATCCG16.666666666666667No Hit
GCGCAAGCCACGGCGCGCCGGGAGGCGTATCCCTGGCAAGCGCCTCGAAT16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)