FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003620001

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003620001
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences15
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC66

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCTGGCGCTGATGACCGCCAGTGGTTCGACGCTGCTGGGTCTGGCCTTT16.666666666666667No Hit
GCATTCGAGGCGCTTGCCAGGGATACGCCTCCCGGCGCGCCGTGGCTTGC16.666666666666667No Hit
CCCAGCATGTGGTGGCATCAGGTCGAGGCGCTCAATCCCTGACTCTTATA16.666666666666667No Hit
ATCCGGAACAGGTGCGTGAAAACTACGTGCCGCGTCTGGTTGAGCTGCGT16.666666666666667No Hit
AGGTCGTCGAGTCCATCTACCTCACCGGACCGTTCGCCGCAGTGGACGAG16.666666666666667No Hit
CTCCCCCCTCTGATTGGCTGTTAATAAGCTGCGAAACTTACGAGTAACAA16.666666666666667No Hit
AATAGAGGCCCTTGGCGAAGGTGACCGGCTGTCGCAGCAGCTTGGGCATC16.666666666666667No Hit
GCGCTCGAGGACGAGCCGCAGTTCCGGGCCATCGCCGACCTCACCGCCCA16.666666666666667No Hit
AACACGTCGGGATCGAGTCCGATCTGCTGCGCCAGCGCCTCCAGCGTGTC16.666666666666667No Hit
GTGCGCCAACCTGGTAGCCGACTTCAAAAGCCCCACGGAGGCCACGTTCA16.666666666666667No Hit
TGTGCACACGTCTGTCAGGTACGAACCACAGCGCGAGGAGCTGTCTCTTA16.666666666666667No Hit
ACCCGGATTGATGATGTATGCGGCCAGCAGGGTATCGAACTCCGCACCCT16.666666666666667No Hit
CGTCCCAACCTGACCACTCAGGCACGCCTGCCCAGAGCCTCCTGGGTCTG16.666666666666667No Hit
GGGCCAGGCCGCCCCCACCGCGCGACGGCTGGTAGAGCGACGGTTGCTCG16.666666666666667No Hit
GAGCGGACATCGTCCTGCTCATCGTCGCGGCCCTCGACCAGCCCACGCTC16.666666666666667No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)