FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003621609

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003621609
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGTGTAATTTTACTTTTAATAATTTAAATTTTTAAAATTTTTAAAGGGTT28.333333333333332No Hit
GTCGGGCATCAGGCCGTGATGCCGGATCGCACCCCACAGCGCGCCTTCGG28.333333333333332No Hit
GGGGATCTCCTCGCCGGTCGGGTCGTAGTAGTCGACGTTCGACTGGAGCC14.166666666666666No Hit
CGGTAATACCGGTAATTGACCCGAAGAGGAACTGTTGCAGCGACCCGGAA14.166666666666666No Hit
GGGTATCTTCGGCTGCGGCGAAAGCGGCTTCGTAATCGCGAACCTTGAGC14.166666666666666No Hit
ATAGAGAACCACGGCCTTCCGTGCGCAAGTATAGCCAGCGCCGTAAAGAC14.166666666666666No Hit
GCTTTTGACAACCCTTGTCTTTGAGTGATGTTTGATTATAGGGCTGTCTC14.166666666666666No Hit
GCCCTGTGGCTGCCGGCCGAGCGCCTGACCCAGTGGCAGGCCCTGCATCC14.166666666666666No Hit
CTGCTGTGGGGGCCGCTGCGTACGATGGCGGCGGAGCGGGGCAGCGCACT14.166666666666666No Hit
CTTGTCGTAGCGGTGCAGGCCGGTGAGCAGCGGCTGGAAGCGCAGCACCT14.166666666666666No Hit
CATTGGGCGATGCACTTAATGGCGCGCGTGCAACGTGGGCAGGGAACCTG14.166666666666666No Hit
GCCGCTTACGGTGACGCTGGTCGCGATAATGGGCCAAGTGCTGCTGTGGG14.166666666666666No Hit
AAGCCGGCCGTGCGGGTGCGCGTCAACCCGACCAAGCTCGCCGCGATGGG14.166666666666666No Hit
CTGTAGACATTGTCGCATAAGCCCGCTTGCTTTGGCACCTGCTTCAGTTT14.166666666666666No Hit
ACGCCGGGGAGCAGAAGCTGCGTCCCGGCTTCCCCAAGCGCCTGGGCACC14.166666666666666No Hit
GCTAAAGATACATCGAAAGCGGAAACGGCGATGAAAGCCTGGGTGGATGC14.166666666666666No Hit
GGTCTGCAGCATCGGCGTCTCGACCTCGAGGTAGCCGCGGCCGGTGAGGC14.166666666666666No Hit
ACCCGGGGATCGAGGACCTCATCCGCGGAGATCTCGCGGTGCTGCGCATG14.166666666666666No Hit
GCCTGGTGATGGCGGTCCTGCAACCCCACGTGGTCCACCCGCTCGAACTC14.166666666666666No Hit
GCACCGACCGGACCTTGGAGCCGTAGTAGAACGGCATCATCACGACACCG14.166666666666666No Hit
CGATGTGAAAGGTCGTGCCCGCTGGCTCGCGTGCCGTCACGAAAGCGCCC14.166666666666666No Hit
GGTTTTCAGCTCCAGCGCAACGATCTGGCTGGCGAAGCGGCCCTCGGCAA14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)