FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003621610

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003621610
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC61

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TTCCGCACCACCGCGTCCAAGTCGCGCCTGAACTTCCTCGCGCTGCTGCG28.333333333333332No Hit
TTTAAACCCTTTAAAAATTTTAAAAATTTAAATTATTAAAAGTAAAATTA28.333333333333332No Hit
CGGGACGTCGATCGGTTTCAAGGTCAACGCCGTCACCGGCATGCTGCGGC14.166666666666666No Hit
GCACGAGGCCGTCCTCGGTCGGCAGCACGAGCTCCTGCTCGTTGTCGCCG14.166666666666666No Hit
GCAGCGGACCAAAGCCGGACAGCCGCGCGCGCACCACCTCCACCGCGGCG14.166666666666666No Hit
GGCGCTTTCGTGACGGCACGCGAGCCAGCGGGCACGACCTTTCACATCGC14.166666666666666No Hit
CCCTATAATCAAACATCACTCAAAGACAAGGGTTGTCAAAAGCCTGTCTC14.166666666666666No Hit
GCCGATTAGCGAGGAGCTGCGGGTCCGCCGCCGCTACGTCGACCTCATCG14.166666666666666No Hit
CGTGCCAGGGTCGCTCAAGGCTCAGACCGACGAGTGGTGTGATTCGTGCC14.166666666666666No Hit
CGCCCACGCCGACCAGCGGCGCCAGGGCAGGCTGAGGCTCAGCCAGATGG14.166666666666666No Hit
GCTGAGGTTTTCGGTCGTCAGGCCCATCGCGGCGAGCTTGGTCGGGTTGA14.166666666666666No Hit
GTCCCCGCGATGCTCTTCCTCGGTGTCGTGATGATGCCGTTCTACTACGG14.166666666666666No Hit
CCATGACCCACAGCAGCGGGTAGGCCAATACCGTCCACCATGCCTGGTAT14.166666666666666No Hit
GACTACCGCGATCCTCGTGGCGGTCGTCTCGCAGAACCGGCGTCTCAAGG14.166666666666666No Hit
GTTAATGATGCAAAGCTGTCCTGAAGGGTGTTGTAGGCATCCACCCAGGC14.166666666666666No Hit
CGCTCCGCGCGGTGAGGTCGTCGATGACGTGCGGGATGATGATGTCCTGG14.166666666666666No Hit
GACATGCGCATCTATCGCGAAGAGATCTTCGGGCCCGTGTTGAGCGTGCT14.166666666666666No Hit
AAACTGAAGCAGGTGCCAAAGCAAGCGGGCTTATGCGACAATGTCTACAG14.166666666666666No Hit
GTCAGCAGCGCCACGTTTTTGTTGTAGGCGCCTGCCAGTGCGCTGCCCCG14.166666666666666No Hit
GTACATATGACCCAGGTGCTGCGCTTCCAGCCGCTGCTCACCGGCCTGCA14.166666666666666No Hit
GCCAGCGCCGCGCCGCGCGTGCCATTGCCGAGGGCCGCTTCGCCAGCCAG14.166666666666666No Hit
GGTCGAGCAGGTTCCCTGCCCACGTTGCACGCGCGCCATTAAGTGCATCG14.166666666666666No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)