FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003621715

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003621715
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC57

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGTGTCGCGAACCCGATCAACCTCGACGGTTTGGGCGTGCTGAACCTTGA416.666666666666664No Hit
GCCGAACGTCAAGCAGAGCAGGTACGCGAAAGAGCGGCGCAAGGTTCTGC312.5No Hit
GCCCGTGACGTCATCCAGAACCATCTGCTCCAGCTGCTGGCGCTCACCGC28.333333333333332No Hit
GTCCCACCAAGAACCTCGACGCGACCGTCCATGAGCTTCCCGCCGGCCTC28.333333333333332No Hit
GGTTGATGTCGAGGATCTTGTTGTTGGTGACGAGTTCGGTAATGTTTGGT14.166666666666666No Hit
GAGCCAACCGACCCGTTCCCCGCTGATCCGGCTTCTGCTGGTGTTCCTGC14.166666666666666No Hit
AAATGAAACTGTTGATTGTCGAAGATGAAAAGAAAACCGGAGAATACTTG14.166666666666666No Hit
CCTCTCCTCTCCTCTCCACCACTCCTATCTATCCTTGCAACTCCTCCTCC14.166666666666666No Hit
AGGTACAAAGCTGGCTTATCGAGCGCCCGATTCGCATCGCTATCATCCTT14.166666666666666No Hit
GTCCATACCTTCAATTTCGGGGAGGAAGTATTTCTGGTGCTCACTATCAA14.166666666666666No Hit
CCCGAGTAGCTGGGACTTCAGGCATGCGCCGCCACCATGCCTGGCTAATT14.166666666666666No Hit
GACCACGTTTTGCCTTCATTGGTACGTTTATGTGGTTTTCCTCTTATATC14.166666666666666No Hit
CCAGGCTTGCGGAGCATATGGTCCTGCAACTGTCTGAAGGCAGGCGGCAA14.166666666666666No Hit
GGTTGCCGAGCGGGGTGCGGACGGAGCCGTTCTCCGCCTGGCCCTCTACA14.166666666666666No Hit
CAGCACCAGGTCGAACTCGCCGCTGGAGCGCAGCACGTCGAGCGCGCCCA14.166666666666666No Hit
GAGCACGCCGATGTGCTCTCCGCTGCTCGTCCAGAGGAAAGGTCAAGTCA14.166666666666666No Hit
GAAGGCGTGATCCCAAAGGTCGACAAGATGCTTGTTGGCGAGCTGCTTGA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)