FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003621716

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003621716
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length140
%GC58

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GAACAGGAAGCTGCCGTTTTTACTGTCGGTCGGGAATTCCGGCACGCTCA416.666666666666664No Hit
GTGCTACTTGCGGCGAACTTCGTTCACTGCTGGCGTGCCCGTACTGGAAG312.5No Hit
CGGCGGGCTTGTCGGCGTTGGTGTTGCCGTGGCGATGCCATGCCCAGGAG28.333333333333332No Hit
ACTCCGGGTTGAAGCCCTCCTCGTCGAGGAAGCCGACCACCTTCTCACCG28.333333333333332No Hit
CCGGAGGAGCTCTCCGGCGGCCAGCAGCAGCGGGTCGCGCTCGCCCGCGC14.166666666666666No Hit
CTTTGGTAGCCCTGTGGGGCGAGGGCTATGATGTAGCCTGGCAATCTTGT14.166666666666666No Hit
GCCCGGCCGAGCTCGGAGGTCTTCCGGCGCCTCGGGGAGCTCGGGCTCGA14.166666666666666No Hit
GCCCGCTGCCGCCACCTTGCTCCATGACCAAGACCGTTTCCATCACGCGC14.166666666666666No Hit
CAGCAATACTAAATTCAGACACATTACTGCAATACCGCCCACCGCAGTAA14.166666666666666No Hit
CCCAGACGGCACTGCCGCGCGCAATCGGTCCCGACGGGTCCTGCGTGAAG14.166666666666666No Hit
GGCACAGTCAAAGCTCACTGCAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACATCTGTAA14.166666666666666No Hit
GGGAGAGGGTGTGAGGAGGAGGAGTTGCAAGGATAGATAGGAGTGGTGGA14.166666666666666No Hit
GCCCTTGAATTTCCCGCGCAAGCGCTGCTTATCTAGCCCGGAGGACTTGA14.166666666666666No Hit
ATATCCGCATCATTCAGCGCAGTCATAAGCAGCCCGCGAAGACGGTCTAC14.166666666666666No Hit
CCACTAGGAGACCAATAATGACCACAAGAATAACGACCGCGACGATCAGG14.166666666666666No Hit
CCCCTTGACGCGATGTTCAATGGTGCCAAGCGCGGTAAGCAACAGAATCG14.166666666666666No Hit
AGACAAAGCACTCTGGCATCGCGTCGTACCATGAGACAACTGGGAATGGT14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)