FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003624637

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003624637
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC55

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GCCATGTAATGAAACTGTGCGCTCCTCGCCGCCTGATGTAATAGTGTACG36.25No Hit
GATGCAATGATTAAAAAATATGAAGAGCAATTCGCCAAAGCTCCTCATAA24.166666666666666No Hit
TGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATTACAAAAATTAGCCGGGCGTGGCC24.166666666666666No Hit
CTATGGTCAGTAATTCCTGGAGGAATAGGTACCAAGAAAAAAAACGAACC24.166666666666666No Hit
GCTCACGCGGGACCTGGCCGGCCTCCGCAGTTCTTCAAGCAGCTGCCCAG24.166666666666666No Hit
TCAGGTTGGTAACCATGACGATGGTGGCTGTGTTTTGTTCCCAGATCATC24.166666666666666No Hit
AGCTGGAACTCGGCCCCACCACGATCGCCGATCTCCAGGTACCCGTGCTG24.166666666666666No Hit
TCGCTCGGCCCTCTCGACGGCGAACGCCGGGTGACGCGATGCGTACGATC24.166666666666666No Hit
GTGTGCGGCAGCGACGGCACCACCTACCCGAGCGGCTGCCAGCTGCGCGC12.083333333333333No Hit
GGGCAAGGCGACGAACGAGCACGGTGTGGCCTCCACTGGTCGGTCTCGCG12.083333333333333No Hit
GGCCAGGGAGATCCTGAGGGGCTTCAAACTAAATTGGATGAACCTTCGGG12.083333333333333No Hit
GGAATACGAACAGGGCAAATACGGCACCTCGGACGCCAGGTTCGACGCGC12.083333333333333No Hit
AATTAAAGCTGTTCAAAAAGAAACAGGAATTAAAGGGAAAAACTTATTTA12.083333333333333No Hit
GCTATGAACGCTTGGCCGCCACAAGCCAGTTATCCCTGTGGTAACTTTTC12.083333333333333No Hit
CCCTAATAAGATAAAGCAAAGACAAAAAAATTTATCTTATTAGAAACAAG12.083333333333333No Hit
GATTAAGGCGACAGCGATTTCTAGGATAGTCAGTAGAATTAGAATTGTGA12.083333333333333No Hit
GAAGTGAAGATGATTGACCGCACGCAATTGATATTAGATATTTTTGCAAA12.083333333333333No Hit
GGTGTGTTGTTAATATTTTCTTTATCCACAAGGACAACTGTAACACCTGC12.083333333333333No Hit
CCTAAGGGCAGCGAAAAGCTGGCACTCCACAGGGTTCTGTGACACAGGCT12.083333333333333No Hit
CGCGGTGCAAGGCCCGGCGGAGGTGCGACACAGACCCGGTATGAACCGGC12.083333333333333No Hit
GCAGTGGTTCGATCTTGGCTTACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCCTGT12.083333333333333No Hit
GTGATGATCGCGGTGCCGTTGCGCCCGTACGGGTTCCAGACGTGCGCGTC12.083333333333333No Hit
GAGCCCAACACGTGCCCGCGCTGCAGCAAGAAGGTGTACTTCGCTGAGAA12.083333333333333No Hit
GTATTATAGATTCTCTGATTTATAATGACAAAAATCAACCCGCAAAAGGC12.083333333333333No Hit
GCCCTGTCCTGGGGCCGCAAGGAACCGCCGCTGACCTACGACGAGGCCTA12.083333333333333No Hit
CTTGTTAACTTGTCATATCGCGCACGTAGTAGCCTAGAGCGCCAGGGGCG12.083333333333333No Hit
CTCCAGGAACGCGGTCATAAGCCGTTGCTCCTCGTCGGTGGGGCGACAGG12.083333333333333No Hit
GAGTCGCAGCCACGACACCACCAGCAACACCTTGGCGCAGCTGCTGGCCA12.083333333333333No Hit
CTCTAAATACGTACAGATTCTGCGATAATGTGTGGACTTTTGTACTGAAT12.083333333333333No Hit
CTGCTGTCGCCGGCACTCCTGGGTGCCGGAGCCCTGGCCCTCGTCGTCCT12.083333333333333No Hit
CATTAGCATAGAACTCACTCTTCCAGTTGTGGTCATCCTGACCTACCAGG12.083333333333333No Hit
GCATCGGCCCGGCGATGTAAACAGCCGTCGTCTCCTGGTGGATCCGCTGC12.083333333333333No Hit
AGTTAAGACTGGAAACAAACCAAAAAGAACAAATAGAAAGTCTTACTGAG12.083333333333333No Hit
TTGTGATGCTGTCGCTGATCTATCTGGTCTATGGCGACCGGAAGATCTGG12.083333333333333No Hit
GCACGCCGCCCACCGAGTCGTAGACCATGCAGGCGCCATCCAGCACGCGC12.083333333333333No Hit
AAATCTGGGTGGTTAGAGAATTGCAAGGAACCCATAATCTGTCTCTTATA12.083333333333333No Hit
TCATCGTTCATCCAGCCCGAATCCGTAGGACCAGGATCGACTGCGTTGAC12.083333333333333No Hit
CGGCGAGCTCGATCGGCGAGCCGTGCGGCGTCTCGGAGAGATCCGCGCTC12.083333333333333No Hit
CCGAGAGGCAAGGGGCGGGGACGGGCGGTGGCTCGCCTCGCGGCGGACCG12.083333333333333No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)