FastQCFastQC Report
Thu 1 Sep 2022
EGAF00003626513

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003626513
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC62

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GGCCAAGGGCATCGAGATGAAGTCGCTGATCCGCATCAGCCCCGCCTACA310.0No Hit
CGCTTGGGCAGCTTCAGGGCGTCCCTGTCCTCGGCGTTGCGACGAAGCAG26.666666666666667No Hit
GTGCAAGCCCCGAGAGCACCGCGCCCGCCGAGAAGGGCGAGTGCGGCTGC26.666666666666667No Hit
GTCTTTCACCGAGCCTGGGCGCTGCCCGGCCAGATGAGGAATGCAGCACC26.666666666666667No Hit
GCTCCAGCCAGTTGATGAAGCGGATGGCGGCCGTCTCCTCCAGCTGCTGT26.666666666666667No Hit
GCTGACGATGATGCGCTTGACCAGGGCCGGCGACGGGAAGGCGCCCTGGT26.666666666666667No Hit
GACGCGATCTCGGGCGCCCTGAACGGGGCGCGCTTCGCCGAGGTCTCGAC13.3333333333333335No Hit
AGCCCGATCAGCTCGAGAGGGATGCCCGACGCGCTCTCCGCCGCCATTGT13.3333333333333335No Hit
GTCGTCAACGACGTGCGTAAGGCCAAGAAGGGCCAGGGCCTCAACGCCGC13.3333333333333335No Hit
GTGGTATCAACGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA13.3333333333333335No Hit
GCGTCCACGCTGTTGCGATACCTGCCGCCCACGCGCACGACGACGTCGAA13.3333333333333335No Hit
GTTCCAGGACATTGCGGCCATCCCGATGATCGCGCTGCTGCCACTGCTGT13.3333333333333335No Hit
CTCCGAGCAACGTGGGCAGCGAGCCGCAGAACAGGTAGGCGACCGTCGCG13.3333333333333335No Hit
GGTCCAGCGTGGCAAACAGGAGGTCTTCTTCATAGCTGTCAGCACTCGTC13.3333333333333335No Hit
GGTCGACTTGCACTCGGTGCACATCTACACCGGCTCGGACGACTACTGGA13.3333333333333335No Hit
ACAGCTCGGCCCAGGAACCGTCCAGGTAGACCTCCTTGCCCGAGCGCTTG13.3333333333333335No Hit
GGCGTGGACATGATCCACGACTACCTCTCGCCCATGGGCTTTGGCAGGCC13.3333333333333335No Hit
GGGGTCGCGCCCGAGGTGACGCTAGCGCGCACCGCGGGGTTGGAGCTCGA13.3333333333333335No Hit
CCACCGTGGTGACCGGTGTCCGCGCCGACCACGCGCTGATGCAGGAGGAA13.3333333333333335No Hit
ATTTGTGCTCCTATACAACAAAGCACTCGTATTAACCCGCAATTCCATCT13.3333333333333335No Hit
GCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGGTAAAAA13.3333333333333335No Hit
GGCAAACTTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCT13.3333333333333335No Hit
CGTGGGCATTGAGCGCGGACGGACAAAAGTCACGGGGTACGAATGCTTGA13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)