FastQCFastQC Report
Sat 23 Apr 2022
EGAF00003626514

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003626514
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences30
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC63

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCGTCATGTCCCGAATACGGAAGCCACGCGTGGCCGACCTGCTTGCCGGG310.0No Hit
GGCACCGCGGCGCTGGTGATCGAGGCCTACGCCAACCGGCACCAGGGCGC26.666666666666667No Hit
GATCCGGTCGGCCTGGCAGTCCTCGCAGCCGCGCGATACCGACGCTGATC26.666666666666667No Hit
CTCGGCGCGAAGGCAGCGGCGCAGCTGCTCGGCGCCCTGGCGCCCCTGCG26.666666666666667No Hit
GCGTGGCGAGCCTCTATCCGGTGTTGAAGCCCCACAGTGCCGCCTCGAGC26.666666666666667No Hit
CAGCTGGAGGAGACGGCCGCCATCCGCTTCATCAACTGGCTGGAGCCTGT26.666666666666667No Hit
CTCGACGGGCTAGCACACATCTGGTTGACTAGGCGCATAGTCGCCATTCA13.3333333333333335No Hit
GTATAAAATCAGGCAGTTTTTGATCACGTTTATTGTAAGCCGTCAGCATC13.3333333333333335No Hit
GTACCAGACGTTCCACTCGTCGTAGGCGATGCGGGGCGGTTTCGCGATCT13.3333333333333335No Hit
CCTGCTCTGGCATCCCCGATTCGGCGACGCGCCGCGCTACGCCACCCCCG13.3333333333333335No Hit
TCCTTGTACAGCGCCTCGTACTGGCGCGAGACCGCCCCCAGCGTCGCCTT13.3333333333333335No Hit
CATCCCGCCCCACCGCCGCCGGCGGCTTCCTTCTCGGGCACCTCGGCGAC13.3333333333333335No Hit
GTATCAACGCAGAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT13.3333333333333335No Hit
TTCAAATTGAGCTGGCTCAGCTGCAATATGCACTGCCGCGTCTGACGGGA13.3333333333333335No Hit
CAGGCGATGCCACCGTGCTCCTCATCGAGCTCCAACCCCGCGGTGCGCGC13.3333333333333335No Hit
CTCTCGGTTCAGCCCGATTCACAAGCACGAGATTTTGCTGAGCGCGAACT13.3333333333333335No Hit
GTACGGCGGGTAGGCCACCTTCAGGGTGTCCACCTGGTCGGTCTTCGCCA13.3333333333333335No Hit
TCGGGCTTCCGTGGCGAGATCGTCGCCAAGATCATCGGCGACAACCTGGA13.3333333333333335No Hit
GCTTTTGAAGCCGCATGCACCATAGCGCACTCGCGCCAAGTCTGTTGATA13.3333333333333335No Hit
CGCCCGAGCGGTCGATGCGGCGCACGGGGCAGTTCAGCACCAGCACGGCC13.3333333333333335No Hit
CAGTGGCAGCAGCGCGATCATCGGGATGGCCGCAATGTCCTGGAACCTGT13.3333333333333335No Hit
CAACTGGCTGGCAGGGCCACCGCCCACCTGGCCTGGCCTGCGAAACGGCA13.3333333333333335No Hit
GAGGAGGCGTTCGAGCGGGAGCGGAGCGGCGCAAGCGGTGCTTGGACCAA13.3333333333333335No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)