FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003627237

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003627237
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC51

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCCCGTCCTACACACCCGGGTCGCAGCATTGGAAACACTTCTCTGGGTGG312.5No Hit
ACCCTGCACCTGGTCCTGCGTCTGAGAGGTGGTATGCAGATCTTCGTGAA28.333333333333332No Hit
GCTTGGTGCGGATGGACATGATAACTTGGCCAATGTGAACCCTGGCCACA14.166666666666666No Hit
GCGTGCCTCAGGCCAGGCTTTTGAGCTGATTCTCAGCCCTCGGTCAAAAG14.166666666666666No Hit
AACCTAGCCATGGCCATCCCCTTATGAGCGGGCGCAGTGATTATAGGCTT14.166666666666666No Hit
GTCGGGAGATGCAGCCAAAGGACAGTCAGGCTTCCTACCGGTGGCGGCGT14.166666666666666No Hit
ATTCGAACGTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGTCGCCGTGCCTACCA14.166666666666666No Hit
ACTAAATACTACCGTATGGCCCACCATAATTACCCCCATACCTGTCTCTT14.166666666666666No Hit
GTATCAACGCAGAGTACATGGGATGGACAGAAGCGGCTCCAGGAGTTCCT14.166666666666666No Hit
GTACATGGGGGAATTCTCTTGCTTCAACAATAACGTCTCTTTCAGAAGGC14.166666666666666No Hit
GTCGACTCTTTCTGGATGTTGTAGTCAGAAAGAGTGCGGCCATCTTCCAG14.166666666666666No Hit
GAGTACATGGGGGCTCACTGAGAACCATCCCGGTAACCCGACCGCCGCTG14.166666666666666No Hit
CTACGGAGGTGGCAGCCATCTCCTTCTCGGCATCATGGCCGCCCTCAGAC14.166666666666666No Hit
ACCCATTGTAATTCCATGAATAAGTGCAACATAAGGTTTCTGGCAAGAAC14.166666666666666No Hit
GCCTTCTCCTCCACACACGTAACCAAATGCCCGGTTGTCTGTCACATCAC14.166666666666666No Hit
TCTTTAGAGAGATTGAAAAGTTTGCGGATTCTGCTAGCTCTTTTGGGGCC14.166666666666666No Hit
GGCATGATCTCGGCTCACTGCAACTTCCGCTTCCCGGGTTCAAGCGATTC14.166666666666666No Hit
CAGATGAGGCTCCCAATGTTGACGTTGGCCAGGGCCTTTGCAAACAAGCC14.166666666666666No Hit
GCTTCTTCAGTAATATCCTCTTCTTCTAAGTATACACTCAGTCTTACAGG14.166666666666666No Hit
CCCATATTCCTCGGACACCACACCCTGCTGCTTTGCCTACATTGCCCGCC14.166666666666666No Hit
AAAGAATCTAGGCATTAGAATGAACTACTGGAACCTGAGTCAAAGACCTG14.166666666666666No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)