FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003627238

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003627238
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC53

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTGAAAGGCATCTCAGCGGCTGCCCCACCATGGCTACCTGGGCCCTCCTG312.5No Hit
TGCCATCACTGGGCACTGCGAATGCCATGACTGAAGAATTAACAGCCGCC28.333333333333332No Hit
GGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCATGTTGGCCA14.166666666666666No Hit
AGCCAAGACTCTATGATGAAACTAAAGGGAATGGCGGCAGCTGGTCGGTC14.166666666666666No Hit
CAGCTAAGAGCATCGAGGGGGCGCCGAGAGGCAAGGGGCGGGGACGGGCG14.166666666666666No Hit
GGCCGCCGCCCCGCCCGTTGTTACCGGTATTGTAAGAACAAGCCGTACCC14.166666666666666No Hit
GTCCCTAGACTTCACGGAGTAGGCGAATGCTATGAAGCCCAGGCAGCAGG14.166666666666666No Hit
CATTGAAGCAAATGAATGTTGGTGAAGATTTAGAAAATGAAGATTTTGAC14.166666666666666No Hit
CCCTAGAACAAGAGGCTTAAAACCGGGCTTTCACCCAACCTGCTCCCTCT14.166666666666666No Hit
GTGTAGAGGGAAGGTTAATGGTTGATATTGCTAGGGTGGCGCTTCCAATT14.166666666666666No Hit
GCGCAGCCTGGCATTGGGGTTGGTGACTCTGATGGCCAGTTGGGCAGCTC14.166666666666666No Hit
AGATGTGGAGGCTCATGTCGAGGTTTAATGCATTCAAAAGGACTAATACC14.166666666666666No Hit
CTTTGGATATTTAGGAAGGGGATGGGGAGAAAGTCAGTTCTCAGAACAAA14.166666666666666No Hit
CCTTTTATCCCTTATTAGAAAAAGTGGCAAAAACAGGCAAGCCGGTGATT14.166666666666666No Hit
AGTTGCTGCTGACGCTCTGGGTGAAGAATGGAAGGGTTATGTGGTCCGAA14.166666666666666No Hit
GTGCTCGGTCCTTCCGAGGAAGCTAAGGCTGCGTTGGGGTGAGGCCCTCA14.166666666666666No Hit
GTATGGGGGTAATTATGGTGGGCCATACGGTAGTATTTAGTCTGTCTCTT14.166666666666666No Hit
GGCTCATCTTTGCAGGCAAGCAGCTGGAAGATGGCCGCACTCTTTCTGAC14.166666666666666No Hit
CACAAAGGACTTGAGCAGGTGTTTGCTGAGCAGGCTTAGGGATGCCGGCC14.166666666666666No Hit
AAAGGAACCTTACTATGATGACAGAAGCAATATACCAAACACAGAGTTTA14.166666666666666No Hit
CCCCACTGCACGACTGTCCCCGTGGGAGCCTCCGTCAACATCACCTGCTC14.166666666666666No Hit

[WARN]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)