FastQCFastQC Report
Sat 23 Apr 2022
EGAF00003630333

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003630333
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC66

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
GTCCGGAGTCGACGGGCTGGTCGCTCGCGTGGCGCCTCAACCTGCGGGCC36.25No Hit
GGAGTCCGTGCGCGAGAGCCCGAACGCCGCGAGGACCGACACGACCGTCG36.25No Hit
AGATCAAGGAGATCGCGCGCGCCGCGACCGACGCCGGCGTCTCGATCCGG24.166666666666666No Hit
CGGTGTACCTGTACATGGGCGCGATCGGCACGACCATCGTCGTCGGGTTC24.166666666666666No Hit
GTCGGACACCGAGTAGTACGAGTCCGGGTGGTCGGGGGCGACGGCCGTGG24.166666666666666No Hit
CGAACCGCGCTCGTCGCTGCCGGTCCGTCCGGCGTGCTCGCCGGCGCGGG24.166666666666666No Hit
GTTCGCGGCGGCCTGGACGGCGCCGTCGCCAACGGCGATCCGGCCGACCG24.166666666666666No Hit
ATCCCCACTAGGTGACCACAGCAAAAGTGGACAGATAGCGTCTGGCAAGC24.166666666666666No Hit
CCGGAGGAGAGCATCGCCCGGCCCATCCGGAGCACCGCCCCGGACTGGCG12.083333333333333No Hit
CACGTCGACTAATAAACAATGTCCTTTATCAGCAGAGTTTATATCCAGCC12.083333333333333No Hit
GTGTCCGGAGAGGTGGCCGTCGTGCACGGCTACGACGAGGCCGGGGTCGA12.083333333333333No Hit
GCGTGAGGTTGAGCCCGCCGTGGCCCGCGAGCAGGAGCTTGCGGGCGGGC12.083333333333333No Hit
GAACACACAGAATGCAAAGGCCATGGGATGCGTTTGGGGGGCGGTTCGGG12.083333333333333No Hit
GTCTGGCTGGGCATCCCGACGTGCACCGTCTCGGCCCTGTTCCTGATGGA12.083333333333333No Hit
TCGCGGTGCTGCGGGTCTCGAACGTGTTGCCACAGGTGCAGGTCACCGTG12.083333333333333No Hit
ACCCTGGACCACGTAGTAAGATGCCATCTTTACAAAAATTTAAAAATAAA12.083333333333333No Hit
GCTCGACCCCCTGCGCGGCGCGGTCTCGCGGCTCGCGAACAAGCTGCAGC12.083333333333333No Hit
GATCACTGATAATGTTTTTAATTTGGAGTTGGAGCAGTTCCCTCTGGTAT12.083333333333333No Hit
CGGCCATGTAGGCCACGACTGCTTGGTGAACCAGCGTCTCGTTGAATTCG12.083333333333333No Hit
ATACCGACGTCGTGATGCCGCCAAAAATAATCAGGCTGATGGCGATGTTG12.083333333333333No Hit
ACCGACGGATTGGTGAGGCTTAAGTTGATGCCGGCGCAGGGCTGCCAAAC12.083333333333333No Hit
CGAGCACGGTCGGGACGGCGTTGCTGCCGCGCGCCGCCGTCCCCGTGACC12.083333333333333No Hit
CCACGAGTCCGGGCGCCGCAGCGACCATCGGGGCGGCCGGGCCGGCAGCC12.083333333333333No Hit
GTGCTCGATGCGTCCGCGCCGATGACTGTGCTGGACCTGTCCGGGCTCGG12.083333333333333No Hit
GGTAGATACGAAACGATTTGTTTGCGGGAAGTGTCATGGCATTTTGCAAA12.083333333333333No Hit
CCCTGGCGGACCGGTGCCACCTACCGTGCGGACGAGACCGGGCGCGTCGA12.083333333333333No Hit
TCGCGGCAGGGCGGGTGACCGTCGACGGCTCGTCGGTGTCCCGCAGCGCC12.083333333333333No Hit
ATATAGGGGTGCATTATGCCCTTTATTAAAAGAAAAATCAATGATCTTCT12.083333333333333No Hit
GGTGTGCAGAAAGGCCTGAATCTATAGCACTTGCTGATTTCAGGGACATG12.083333333333333No Hit
TCCTGGTACAGGTCGCGGCGGGCGGCCCGGGTGAGCGCGGTCCCGCGCGG12.083333333333333No Hit
GTCTCAGGCTACGACGTGAAAAAGAGTGCCGAGATTCTGTATAATCATTT12.083333333333333No Hit
GCCCGCAAGTATCGCCCCCAGAATTTCAATGATCTGATCGGCCAGGAGCC12.083333333333333No Hit
ATAATGGGGCAAACAATCCTGTCTATCTCCATTGCCAGAACAGATGAGAG12.083333333333333No Hit
ACCTGGAGACCGTGCAGCTCGACACCGAGCTCGCCCGCCAGGACCCGACG12.083333333333333No Hit
GGTCCGCGTCGAGCGCCTTGCCGGTGCGCAGCCGGAACGGCACGCCGCCC12.083333333333333No Hit
GGACGAGCTCGTGCGCGCCGACCTGTCGGTGTCCCTGTGCGTCCAGGGCG12.083333333333333No Hit
CCGTGAGCGTGCTCGAGGTCGGCGCGCTCGCTGCGGCGATGGGCGGCTCC12.083333333333333No Hit
GCGCTCAGCGGCGCGCTGCTCACCGCGCTCGGCGGTCCGGCACAGCTGCG12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)