FastQCFastQC Report
Sat 23 Apr 2022
EGAF00003630334

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003630334
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences48
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC66

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TGTCGCCTCAGTCGGTCATCACGCAGGCCGGCGGCATGGTGCTCGTGCCC36.25No Hit
TGTCGATCGTGCCGGGCCTGTCCGGGATCACCGTCTGGGCCACCGCGACA24.166666666666666No Hit
GCCCACGTCATCACGACCGTGATCCCGCCGCGCACCCGCAGCCCACGCAC24.166666666666666No Hit
AGCCCGAGGCGAACGCCCGCAGCACGAGGAACGCACCGGCGAGACCGACG24.166666666666666No Hit
GGCATTTGGTGCAGGTGCTGGTGGAGAACTGCACGAAGGTGGCGCGGGCT24.166666666666666No Hit
GCCGTAAGCCCTGAAGTGCTTGGCTGGGGAGACTAGAGTTGATCACAATT24.166666666666666No Hit
TGACCGGGTCGTTGTGCTTGACCGAGATCTTGAAGTCGTGGAAGCCGTGC24.166666666666666No Hit
AGGCGGACGTCCTCCGACCGATCACGCAGTCCAGGCGCGACATGACGTGG12.083333333333333No Hit
GGTCGTTCAGGCGCCCCGGCGCGGCCGGCCTGCCCGCCTTCAGCCATTCC12.083333333333333No Hit
GTTTGGGAGCGGTTCAGCGTTCTGGCAGACTGTCCCCCTGGTACCGGTTC12.083333333333333No Hit
GGAGGCGTACCCGGGGTCCGCGGCGTCCGCCCGGACGACGACCTCGCGCT12.083333333333333No Hit
GAAAAGAGCACACACAAGAACTAGATGACCGTGACCCTTTCCCTAGAGAC12.083333333333333No Hit
GAGGTGAGGCGCGGGGGAGGTGACGCGCCCGACGTGGGCTCAGGCGGCGA12.083333333333333No Hit
GCCCACGTCATCACGACCGTGATCCCGCCGCGCACCCCCAGCCCGCGCGC12.083333333333333No Hit
GTCTGGCATGCGGTGAGGAACATGAGGGAGGCAAACGTGGCAGTAGCGGC12.083333333333333No Hit
CCCCGGGTGCTCGCCCGATCCGCGGCCACCCCCACGGCCCCGCTGGAGAT12.083333333333333No Hit
GCACGGGGACAGGTCCGGTCCGCGTCTCGGGTCCCGGCACCCGGCCCGTC12.083333333333333No Hit
GGCGCGCGCCTGAGCGCCCGGCGGGCTGAGCACCCCGTCTCCGAGCAGCC12.083333333333333No Hit
TGGCGCTACTGGCGGCAACCTGGTTGTACGTCCAGCGGCCAAGGCTCGCG12.083333333333333No Hit
GGCGGGGACCGGCGCACCGTCCGCCGGCCCGGTTCGTCGCGCGACCGCGA12.083333333333333No Hit
GATTTAATCAAACATAAGGGGGTGTTATTTTCTTCTGGGTTAATTGTTGG12.083333333333333No Hit
CGGTCAAGGACCGCATCGCGCTCAAGATGGTCGAGGCGGCGGAGGCGAGC12.083333333333333No Hit
CTCGGTGACGTCCGTGGACCGCAGGCCGGCGCCGAACCCGGGGCGGACGA12.083333333333333No Hit
TAGCGCACCTGCTCGATGATTTCGCGAATATCATCGATACCTGTATGCGA12.083333333333333No Hit
ACAGAGTGAGACCCTGTCTTGAAAAACAAAAACAAAAAAAACAACCAAAA12.083333333333333No Hit
GGTTTACCTGCACCTGTTTCGGCGTGGCGACTCGCTCGATGGGTTGAACC12.083333333333333No Hit
AGCCGCCGCTGTCCGTCGGGCCCGCGGACCTGTCCAAGCGCAAGGTCGAC12.083333333333333No Hit
AACAAGAACTGCCGTTTTCGGCGACATTTGATATCTTACAACAGACTGAC12.083333333333333No Hit
CCACGAGCCGGTGCTGCCGATCCCGGTGATCATGGTCGCGACGATCGTGC12.083333333333333No Hit
GGTGTCCCGCGGCTGCGGCTGACCGGCGTCCCACGGGTGCGGCGACCGGT12.083333333333333No Hit
AGCTTCCACTGCGCTTGCATGCGCCGGACTGCCGGGACCGAGCGCAGCAG12.083333333333333No Hit
ATGTAGCGGATGAGCGTGCGGTTCGGGCCGACGATGAGCACCCCGGCGTG12.083333333333333No Hit
CTCCTGCGTTAGCCTCCTGAGTAGCTTGGTCCACAGGCGCATGCCACCAG12.083333333333333No Hit
AGCCGCAGGTGCGTTCACACGACCTACCGCCTCCTGCCAGCTCACGAGGT12.083333333333333No Hit
ACCCCGTCGTGGTCGAGGACGACCCCGGAGCCGTCCGCGTCGACCCACAC12.083333333333333No Hit
CACCGCCCTGCGCGCTGAGCTCGACGAGGCCCTCTCGACCGCTCGGGCCT12.083333333333333No Hit
CGGTGAAGGACCGCATCGCGCTCAAGATGGTCGAGGCGGCGGAGGCGAGC12.083333333333333No Hit
ATATATGGAAGGAGAGATTTCATAAATTGCCTAAATGCACCAAAATTGCT12.083333333333333No Hit
ACGGGGCGAGCACGCCCGTGAGCGCCGGGCCGAGCGCGGCCGAGGCCCCG12.083333333333333No Hit
TACCTACCTTAACAAATCAATATTTGTAACTTAATCCCTTCCAATTATGT12.083333333333333No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

[OK]Kmer Content

No overrepresented Kmers

Produced by FastQC (version 0.11.5)