FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003634951

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003634951
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC47

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGATGAAGATGCTTACAAGAAACAGTTCTCTCAATACATAAAGAACAGCG28.333333333333332No Hit
AGTTCAATGTTTTTGCCACCTGACTGAACCACTTCCAGGAGTGCCTTGAT28.333333333333332No Hit
GGCATTATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACTAGCCTGGTCAACATGGT28.333333333333332No Hit
GGGTCTCTCTCCATATGAATTTTCTTATGTTTAATCAGAGTTGACTTCTG28.333333333333332No Hit
CTTATACTAGTATCCTTAATCATTTTTATTGCCACAACTAACCTCCTCGG14.166666666666666No Hit
GAGTACATGGGGAATAATTGCAATCCCCGATCCCCATCACGAATGGGGTT14.166666666666666No Hit
TCCTTATAGGTGGCTCAAGTGTTCCAGTTCCCCTCATCCCTCTCTTTCTG14.166666666666666No Hit
CTGCAGCACGATGATGTCGCGGTCTGTGAGTTTGTCTCCAGTCACAGGGT14.166666666666666No Hit
AGATAAGGCCTTGGGCTTGAGAAACTCATTGTCATAAAGTTATAAACTGG14.166666666666666No Hit
CGCCTTTTGGTACCAATCCTTTAGTAACGAAGACACCTTTTCCAGCAGAA14.166666666666666No Hit
GCCCTCAACTTCTCCGTGTTCTACTATTAGATCCAGAATGCACCTGAGCA14.166666666666666No Hit
TCCCCGCCCCTTGCCTCTCGGCGCCCCCTCGATGCTCTTAGCTGAGTGTC14.166666666666666No Hit
CGGCCGGGGGGCGGGCGCCGGCGGCTTTGGTGACTCTAGATAACCTCGGG14.166666666666666No Hit
TCATCCTTCACCAACATGCAAGTTCTTTCCTTCCCTGCCAGCCAGATAGA14.166666666666666No Hit
GGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAACCTCACCCGG14.166666666666666No Hit
ACACGGGAAACCTCACCCGGCCCGGACACGGACAGGATTGACAGATTGAT14.166666666666666No Hit
GTGTTGAATATCTCATGTAATTTATTGAATACTGCACCAAAAGTGAAAAA14.166666666666666No Hit
ATACAGGACTCTTTCGAGGCCCTGTAATTGGAATGAGTCCACTTTAAATC14.166666666666666No Hit
CTCAAAGATTAAGCCATGCATGTGTAAGTACGCACGGCCGGTACAGTGAA14.166666666666666No Hit
TCTTCCTTCACCAACATGCAAGTTCTTTCCTTCCCTGCCAGCCAGATAGA14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)