FastQCFastQC Report
Wed 31 Aug 2022
EGAF00003634952

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameEGAF00003634952
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences24
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length100
%GC52

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[WARN]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
TCCTTCTTCTGAGCAAGGGACATTTTGGGACGGTTCCACCTCTTCTTTTT28.333333333333332No Hit
GCGCAGACCAGACTTCGCTCGTACTCGTGCGCCTCGCTTCGCTTTTCCTC28.333333333333332No Hit
GTACATGGGGAGTGTGCGCTTTTGAGAGTCGCGGCGGAAGGAGCCCGGCC28.333333333333332No Hit
AAAGTATGCTTCCATTATAATCTTCATAAAGCTCAACCTGCAGAGAGATT28.333333333333332No Hit
GCGCAAGACTCCCTGCAACCTTAGCCTCCCAGGTTCAAGCATTTCTCCTG28.333333333333332No Hit
GCTTCGTTCCCTGGATCGCACTGAACCTAAGCCACAACCCGAGGACCCTC14.166666666666666No Hit
GCACCAGACTTGCCCTCCAATGGATCCTCGTTAAAGGATTTAAAGTGGAC14.166666666666666No Hit
CGCTGAGCCAGTCAGTGTAGCGCGCGTGCAGCCCCGGACATCTAAGGGCA14.166666666666666No Hit
AATTAAGCCACAGGCTCCACTCCTGGTGGTGCCCTTCCGTCAATTCCTTT14.166666666666666No Hit
CTATCAGCTTGTTTTAAATGGATCTTTTAAATATCAACTTAAGACTGGTT14.166666666666666No Hit
CGCTACGTGTGTGCCGTGACCCGCGACAGCCTGAGCAACGCCACCCCCTG14.166666666666666No Hit
CTATTGGAGCTGGAATTACCGCGGCTGCTGGCACCAGACTTGCCCTCCAA14.166666666666666No Hit
AGTTAGCATGCCAGAGTCTCGTTCGTTATCGGAATTAACCAGACAAATCG14.166666666666666No Hit
ATCTGACACTATTCTAGACCCAACTAATGAATGGCATAGTAAGTGTCATT14.166666666666666No Hit
ATCATGGCCTCAGTTCCGAAAACCAACAAAATAGAACCGCGGTCCTATTC14.166666666666666No Hit
GCCTGCGGCTTAATTTGACACAACACGGGAAACCTCACCCGGCCCGGACA14.166666666666666No Hit
GGTGTGAAACTGCGGTGTGGCCTCCAGCCAACACAAGCCATCAGCCCCAT14.166666666666666No Hit
GGTGAAGGAGGTGGACGTGGGTTTGGTTGCCGATGTAGGAACACTGCAGC14.166666666666666No Hit
CTTCCAATTAGGTGCATGAGTAGGTGGCCTGCAGTAATGTTAGCGGTTAG14.166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)